HBV相关慢加急性肝衰竭后肝细胞再生相关miRNA的筛选

发布时间：2017-11-26 17:31

  本文关键词：HBV相关慢加急性肝衰竭后肝细胞再生相关miRNA的筛选

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【摘要】：目的:本研究旨在获得不同转归HBV相关慢加急性肝衰竭患者(ACLF)组间以及组内病情变化前后血浆miRNA的差异表达谱;筛选出与ACLF后肝细胞再生相关的miRNA及其靶基因,为进一步探索miRNA在ACLF后肝细胞再生中作用及机制提供理论基础。方法:收集西南医科大学附属医院住院部HBV相关慢加急性肝衰竭早期患者初诊时的血浆标本;治疗过程中病情无好转甚至恶化且诊断为晚期时再次收集血浆标本;病情好转者随访至肝功能正常时再次收集血浆标本。所有未死亡患者随访至少24周,同时收集患者人口学资料及临床资料。根据临床转归分为存活组和死亡组,根据各组各指标中位数情况,选取存活组、死亡组各3例2个时间点血浆标本,通过miRNA基因芯片技术分析不同转归ACLF患者组间以及组内病情变化前后血浆miRNA表达谱的差异;根据基因芯片分析结果筛选出不同转归ACLF患者组间以及组内病情变化前后差异表达的miRNA(上调或者下调超过1.5倍,p0.05),利用miRBase、PUBMED,Medline等数据库进行生物信息学分析,筛选出可能与ACLF后肝再生相关的miRNA及其靶基因。结果:miRNA基因芯片结果显示,存活组ACLF基线(初诊为早期)时miRNA表达水平与随访至肝功能正常时miRNA表达水平相比较,共有41个差异表达的miRNA;其中hsa-miR-4468、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-4732-5p、hsa-miR-200c-3p、hsa-miR-541-5p、hsa-miR-660-3p、hsa-miR-4777-5p等共27个miRNA表达上调;hsa-miR-30b-5p、hsa-let-7f-2-3p、hsa-miR-1297、hsa-miR-548y、hsa-miR-4451等共14个miRNA表达下调。存活组ACLF基线(初诊为早期)时miRNA表达水平与死亡组ACLF基线(初诊为早期)时miRNA表达水平相比较,共有57个差异表达的miRNA;其中hsa-miR-491-3p、hsa-miR-27b-3p、hsa-miR-4532、hsa-miR-125a-5p、hsa-miR-4456、hsa-miR-222-3p、hsa-miR-298、hsa-miR-222-3p、hsa-miR-3940-5p等共35个miRNA表达上调,hsa-miR-146b-5p、hsa-miR-1297、hsa-miR-142-5p、hsa-miR-223-3p、hsa-let-7f-2-3p、hsa-miR-4739等共22个miRNA表达下调。死亡组ACLF基线(初诊为早期)时miRNA表达水平与随访诊断为晚期时miRNA表达水平相比较,共有8个差异表达miRNA;其中hsa-miR-142-3p、hsa-miR-1827共2个miRNA表达上调,hsa-miR-875-3p、hsa-miR-4521、hsa-miR-5579-3p、hsa-miR-641、hsa-miR-548a-5p、hsa-miR-4796-3p共6个miRNA表达下调。通过Medline、Pubmed、miRbase数据库对差异表达的miRNA进行初步的生物信息学分析,hsa-miR-148a-3p、hsa-miR-1297、hsa-miR-142a-3p、hsa-miR-125a-5p等10个miRNA可能与ACLF后肝再生相关,其生物学功能涉及参与各类细胞的增殖及凋亡的调控;此外,EGFR、SMAD4、CXCR4、PTEN等共34个靶基因可能与ACLF后肝再生相关,其生物学功能涉及参与各类细胞的增殖及凋亡的调控。结论:(1)不同转归HBV相关慢加急性肝衰竭存在差异表达的miRNA,可能参与不同转归HBV相关慢加急性肝衰竭发生过程。(2)hsa-miR-148a-3p、hsa-miR-1297、hsa-miR-142a-3p、hsa-miR-125a-5p等10个miRNA可能参与HBV相关慢加急性肝衰竭后肝再生过程,其具体作用机制需进一步研究。
【学位授予单位】：西南医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R512.62;R575.3

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本文编号：1230607