Piezo2蛋白的生物信息学分析及其在肠道中的表达

发布时间：2017-12-27 22:12

  本文关键词：Piezo2蛋白的生物信息学分析及其在肠道中的表达　出处：《重庆医学》2016年15期 　论文类型：期刊论文

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【摘要】：目的对Piezo2性质、结构和功能进行预测分析,并检测其在肠道的表达。方法利用Protparam程序预测人Piezo2蛋白基本理化性质;TMHMM Serve 2.0预测跨膜结构域;ProtComp Version 9.0分析亚细胞定位;用SOPMA程序预测其二级结构;SWISS-MODEL服务器生成其三维模型。免疫组织化学染色确定Piezo2在肠道组织的表达位置,以实时定量荧光PCR检测Piezo2在不同肠段的表达量及与Epac1表达的相关性。结果 Piezo2蛋白分子式为C14539H22436N3662O4087S130,相对分子质量为318.092×103,等电点pI=5.82。Piezo2蛋白存在35个跨膜结构域,并有多个蛋白修饰位点。免疫组织化学染色发现Piezo2蛋白表达于肠道上皮与神经节,其在结肠表达水平较回肠丰富(P0.01),其中结肠Piezo2与Epac1在mRNA水平表达呈正相关(r2=0.65,P0.01)。结论 Piezo2在结肠表达丰富,可能通过Epac1通路参与肠道机械力感知与调控。
[Abstract]:Objective to predict the nature, structure and function of Piezo2 and to detect its expression in the intestinal tract. Methods the basic physical and chemical properties of human Piezo2 protein were predicted by Protparam program, TMHMM Serve 2 was used to predict transmembrane domain, ProtComp Version 9 was used to analyze subcellular location, SOPMA program was used to predict its secondary structure, SWISS-MODEL server generated its 3D model. Immunohistochemical staining was used to determine the expression of Piezo2 in intestinal tissue. Real-time quantitative fluorescence PCR was used to detect the expression of Piezo2 in different intestinal segments and its correlation with Epac1 expression. Results the molecular formula of Piezo2 protein was C14539H22436N3662O4087S130, the relative molecular weight was 318.092 x 103, and the isoelectric point was pI=5.82. There are 35 transmembrane domains in the Piezo2 protein, and there are several protein modification sites. Immunohistochemical staining showed that Piezo2 protein was expressed in intestinal epithelium and ganglion, and its expression level in colon was more abundant than that in ileum (P0.01). The expression of Piezo2 in colon was positively correlated with Epac1 expression at mRNA level (r2=0.65, P0.01). Conclusion the expression of Piezo2 is abundant in the colon and may be involved in the perception and regulation of intestinal mechanical force through the Epac1 pathway.
【作者单位】： 华中科技大学同济医学院附属协和医院消化内科;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(81200271)
【分类号】：R57
【正文快照】： 2010年Coste等[1]发现并定义了Piezo2蛋白。通过细胞系中的体外siRNA筛选及电生理实验的方法,证实Piezo2是机械门控离子通道蛋白。Piezo2是非选择性阳离子通道蛋白,受机械信号刺激,通道开放,将机械刺激信号转化为生物电信号。Piezo2表达于传入神经节(如三叉神经节及背根神经节

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本文编号：1343390