HuLDO:人类肝脏疾病本体的构建及应用

发布时间：2018-05-29 04:48

  本文选题：生物医学本体 + 肝脏疾病　； 参考：《军事医学》2015年02期

【摘要】：目的中国是多种常见肝病的高发国家,肝脏疾病的研究对提高防治水平,保障人民健康有着重要的意义。为了全面收集、整理、共享和分析分散于现有数据库和文献资料中的肝脏生理病理学知识,该研究构建了人类肝脏疾病本体HuL DO并展开多方面应用。方法 HuL DO是参考疾病相关的多个权威术语集和肝脏病学专著而构建的,依据该本体中的疾病名称列表,从现有数据库中收集各种肝病的相关数据,以本体结构为数据组织框架构建肝病知识库,以本体为字典挖掘肝病与基因的关系。结果 HuL DO是目前最全面的肝病概念分类系统,以该本体为基础建立了一整套肝病知识的收集、挖掘和展示的工具和策略。结论 HuL DO是全面收集、高效分享和灵活分析各类肝病数据和知识的重要工具。肝病本体的下载地址是ftp://liveratlas.hupo.org.cn/5.liver%20Disease%20Ontology/。
[Abstract]:Objective China is a country with high incidence of common liver diseases, and the study of liver diseases is of great significance in improving the level of prevention and treatment and protecting people's health. In order to collect, organize, share and analyze the knowledge of liver physiology and pathology scattered in the existing database and literature, this study constructed the human liver disease ontology HuL do and applied it in many aspects. Methods HuL do was constructed by referring to a number of authoritative terms and monographs of liver diseases. According to the list of disease names in this body, the relevant data of various liver diseases were collected from existing databases. The liver disease knowledge base is constructed with ontology structure as data organization framework and the relationship between liver disease and gene is mined by ontology dictionary. Results HuL do is the most comprehensive classification system of liver diseases at present. Based on this ontology, a set of tools and strategies for collecting, mining and displaying liver diseases knowledge are established. Conclusion HuL do is an important tool for comprehensive collection, efficient sharing and flexible analysis of all kinds of liver disease data and knowledge. The download address of the liver ontology is ftp://liveratlas.hupo.org.cn/5.liver Disease Ontology /.
【作者单位】： 北京协和医学院 中国医学科学院基础医学研究所;军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室 北京蛋白质组研究中心;
【基金】：国家973计划资助项目(2011CB910600,2013CB911200) 国家863计划资助项目(2012AA020409,2012AA020201) 国家自然科学基金资助项目(201105121,21275160)
【分类号】：R575

【参考文献】

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【共引文献】

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本文编号：1949554