白介素-8基因多态性与HBV背景下肝炎、肝硬化、肝癌遗传易感性研究
发布时间:2020-06-15 19:29
【摘要】:目的:研究白介素(IL)-8基因多态性在广西HBV背景下肝炎、肝硬化、肝癌患者中的分布和频率;探讨具有代表性的IL-8单核苷酸多态性(SNP)位点的基因多态性与HBV背景下肝炎、肝硬化、肝癌的关系,为从基因水平对HBV背景下肝脏疾病的预防、发生发展及治疗提供遗传新指标。 方法:选取连续入院的HBV感染患者390例包括慢性乙型肝炎患者(CHB)160例、乙型肝炎肝硬化患者(LC)80例和HBV相关性肝癌患者(HCC)150例及健康体检者(对照组)150例。通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测IL-8基因-251A/T位点和+781C/T位点单核苷酸多态性,并利用直接测序法鉴定其基因型。应用SPSS13.0软件检验各位点Hardy-Weinberg遗传平衡性(HWE)、分析基因型及等位基因频率在病例组和对照组中的分布差异。Logistic回归分析筛选独立的易感与保护基因型和等位基因,以比值比(OR)及其95%可信区间(CI)表示相对风险度。运用SHEsis在线软件进行连锁不平衡及单倍型分析。 结果: 1.对照组和病例组中IL-8基因-251A/T和+781C/T位点的基因型频率已达到遗传平衡,具有群体代表性(P0.05)。 2. IL-8基因-251A/T位点AA、AT、TT三种基因型及A、T两种等位基因和+781C/T位点CC、CT、TT三种基因型及C、T两种等位基因在不同组别间的分布差异无统计学意义(P0.05)。 3. logistic回归分析校正年龄、性别因素的影响后发现,与TT基因型相比,IL-8基因-251A/T位点AA基因型显著降低了LC的发病风险(OR=0.135;95%CI,0.021-0.865;P=0.035)。同时A等位基因相对T等位基因,LC组的风险度降低了47.7%(95%CI,0.247-0.920;P=0.027)。提示IL-8基因-251A/T位点AA基因型和A等位基因可能是乙型肝炎肝硬化的保护因素。但Logistic回归分析未发现IL-8基因+781C/T位点多态性与广西地区人群CHB、LC、HCC的发病风险有关(P0.05)。 4.对性别分层后,无论是在男性人群中还是女性人群中,IL-8基因-251A/T位点AA、AT、TT三种基因型及A、T两种等位基因和+781C/T位点CC、CT、TT三种基因型及C、T两种等位基因在不同组别间的分布差异无统计学意义(P0.05),并且两位点多态性与广西地区人群CHB、LC、HCC的发病风险无关(P0.05)。 5.本研究150例广西地区对照者的IL-8基因-251A/T和+781C/T位点多态性与国际人类基因组单体型图(HapMap)计划中报道的北京人群、欧洲人群分布较一致(P0.05),而与东京人群和撒哈拉以南非洲尼日利亚人群有差异(P0.05)。 6.连锁不平衡和单体型检验显示:1) IL-8基因-251A/T与+781C/T位点存在连锁不平衡关系(D'=0.710,r2=0.356,P0.001); 2)在本研究的人群中存在A~(251)C~(781)、A~(251)T~(781)、T~(251)C~(781)、T~(251)T~(781)四种单体型;3)所有单体型在各病例组和对照组的频率分布均无显著差异,并且与CHB、LC、HCC的发病风险均无关(P0.05)。 结论: IL-8基因-251A/T位点AA基因型和A等位基因,对广西地区人群乙型肝炎肝硬化可能有一定的保护作用。
【学位授予单位】:广西医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2011
【分类号】:R512.62
【图文】:
图 1 -251A/T 位点扩增片段电泳图(M 泳道为 Maker,1-8 泳道为样本扩增产物)(2)+781C/T 位点扩增产物片段长度为 203bp,见图 2。图 2 +781C/T 位点扩增片段电泳图(M 泳道为 Maker,1-8 泳道为样本扩增产物)2.酶切产物电泳结果(1)173bp 的-251A/T 位点扩增产物可被 AseI 内切酶切为 152bp 和 21bp 两个片段,当碱基 A→T 时,酶切位点消失,因此只显示为 173bp 一条酶切产物
图 2 +781C/T 位点扩增片段电泳图(M 泳道为 Maker,1-8 泳道为样本扩增产物)2.酶切产物电泳结果(1)173bp 的-251A/T 位点扩增产物可被 AseI 内切酶切为 152bp 和 21bp 两个片段,当碱基 A→T 时,酶切位点消失,因此只显示为 173bp 一条酶切产物的,表示为纯合子-251TT 基因型;有 173、152、 21(不显示)bp 三条酶切产物,表示为杂合子-251AT 基因型;有 152 和 21(不显示)bp 两条酶切产物,表示为纯合子-251AA 基因型,见图 3。
【学位授予单位】:广西医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2011
【分类号】:R512.62
【图文】:
图 1 -251A/T 位点扩增片段电泳图(M 泳道为 Maker,1-8 泳道为样本扩增产物)(2)+781C/T 位点扩增产物片段长度为 203bp,见图 2。图 2 +781C/T 位点扩增片段电泳图(M 泳道为 Maker,1-8 泳道为样本扩增产物)2.酶切产物电泳结果(1)173bp 的-251A/T 位点扩增产物可被 AseI 内切酶切为 152bp 和 21bp 两个片段,当碱基 A→T 时,酶切位点消失,因此只显示为 173bp 一条酶切产物
图 2 +781C/T 位点扩增片段电泳图(M 泳道为 Maker,1-8 泳道为样本扩增产物)2.酶切产物电泳结果(1)173bp 的-251A/T 位点扩增产物可被 AseI 内切酶切为 152bp 和 21bp 两个片段,当碱基 A→T 时,酶切位点消失,因此只显示为 173bp 一条酶切产物的,表示为纯合子-251TT 基因型;有 173、152、 21(不显示)bp 三条酶切产物,表示为杂合子-251AT 基因型;有 152 和 21(不显示)bp 两条酶切产物,表示为纯合子-251AA 基因型,见图 3。
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本文编号:2714885
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