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白介素-6基因多态性与HBV背景下慢性乙型肝炎、肝硬化和肝癌遗传易感性研究

发布时间:2020-08-11 21:42
【摘要】:目的:研究白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)基因启动区三个单核苷酸多态性(SNP)位点rs1800795、rs1800796、rs1800797在广西地区人群的分布;分析rs1800795、rs1800796、rs1800797基因多态性与HBV背景下慢性乙型肝炎、肝硬化及肝癌遗传易感性的联系。通过此项研究,探索在广西地区人群IL-6基因多态性的分布规律;IL-6基因多态性与HBV背景下慢性乙型肝炎、肝硬化和肝癌遗传易感性的关系。获得具有重要意义的与HBV背景下肝脏疾病易感性相关的SNP和(或)单倍型,为HBV背景下肝脏疾病的人群预防和治疗提供新的遗传标记和生物靶标。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术和DNA测序法,分别对来自广西地区192例健康体检者(对照组),185例慢性乙型肝炎患者(CHB组)、92例肝硬化患者(LC组)、192例肝细胞癌患者(HCC组)检测其IL-6基因启动区三个SNP位点rs1800795、rs1800796和rs1800797在各组研究对象的基因频率,并同时采用SHEsis软件构建IL-6基因启动区三个SNP位点的单倍型;采用罗氏Cobas · e601检测各组对应的血清IL-6水平。统计分析IL-6基因启动区rs1800795、rs1800796和rs1800797三个SNP位点在广西地区人群的分布情况。采用哈-温平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)检验各组研究对象是否具有可比性和群体代表性;χ2检验比较各位点基因型和等位基因在各病例组和对照组的差异;logistic回归分析校正性别与年龄因素后计算比值比(Odds ration,OR)和95%可信区间(Confidence Interval,CI);方差分析比较对照组与各病例组间血清IL-6水平差异;配对t检验统计分析肝癌患者手术前、后血清IL-6水平差异。上述统计分析均采用SPSS13.0软件计算。结果:1.经HWE统计,对照组与各病例组IL-6基因启动区rs1800795、rs1800796和rs1800797三个位点的基因型频率分布均符合HWE平衡,所纳入各组研究对象均具有可比性和群体代表性(P0.05)。2.广西地区人群IL-6基因rs1800795、rs1800797位点突变率低,rs1800795仅发现GG、GC两种基因型,未发现CC基因型;rs1800797位点仅发现GG、GA两种基因型,未发现有AA基因型。两位点三种基因型频率在对照组和病例组间差异无统计学意义(p0.05)。3.广西地区人群IL-6基因启动区rs1800796可见CC、CG、GG三种基因型,经logistic回归分析校正性别与年龄因素后发现:IL-6 rs1800796可能与HBV背景下CHB、HCC的遗传易感性有关。CHB组CG、GG基因型患病风险分别增加至1.5倍(OR=1.526)、3.2倍(OR=3.211),G等位基因的患病风险增加至1.6倍(OR=1.561);肝癌组CG、GG基因型患病风险分别增加至1.8倍(OR=1.854)、4.8倍(OR=4.742),G等位基因的患病风险增加至1.9倍(OR=1.881)。4.按性别因素进行分层分析,无论是男性或是女性人群,IL-6基因启动区rs1800795和rs1800797位点在各病例组与对照组间差异均无统计学意义。rs1800796GG突变纯合子基因型在男性CHB和HCC中患病风险增高,rs1800796CG杂合子在女性CHB中患病风险增高,差异具有统计学意义。5.广西地区人群IL-6基因rs1800795、rs1800796、rs1800797基因型和等位基因频率与东南亚区域、黄种人群结果相似(p0.05);而与欧美地区、白种人群结果差异较显著(p0.05)。6.IL-6 基因启动区 rs1800795、rs1800796、rs1800797 三个 SNP 位点GGG单倍型与广西地区人群HBV背景下CHB、HCC的发生发展相关,OR值分别约 1.67(OR=1.669)和 1.83(OR=1.827)。.7.各病例组血清IL-6水平较对照组显著增高(p0.05);在CHB组和HCC组中,rs1800796 CC、CG、GG三种基因型血清IL-6平均浓度比较,差异具有统计学意义(p0.05),GG基因型血清IL-6浓度显著高于CC、CG两种基因型浓度。在肝癌切除手术后,血清IL-6浓度较手术前显著降低(p0.05)。结论:1.广西地区人群IL-6基因启动区rs1800795、rs1800796和rs1800797基因型和等位基因频率与东南亚区域、黄种人群结果相似;而与欧美地区、白种人群基因频率分布差异较显著。2.IL-6基因启动区rs1800796 GG基因型和G等位基因可能是广西地区慢性乙型肝炎、肝癌的危险因素。
【学位授予单位】:广西医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2013
【分类号】:R512.62;R575.2;R735.7
【图文】:

研究资料,地理分布,全球,病人


图1邋HBV人群感染流行的全球地理分布逡逑研究资料显示:鉴于中国主要是以CHB及LC病人居多,中国男龄标准化发病率约为40/10万,女性约仅为14/10万;而在欧美地肝癌年龄标准化发病率为6.2/10万,女性为1.7/10万,两地区肝男性均明显高于女性,在肝癌发病率和致死率方面,中国长期高均水平。此外,肝癌因隐匿发病、高恶行性和转移率、预后较差,

示意图,基因分型,引物设计,位点


采用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性技术(PCR-RFLP)技逡逑术对IL-6基因启动区rs邋1800795、rsl800796和rsl800797三个SNP位点进逡逑行基因分型,其技术路线见图2所示。逡逑样本A(r/i)逦样本i3(m)逦样本c(\a)逡逑—CXST邋■'逡逑CCTTACC'?—逦ii.i邋GG邋.ADL...邋.逡逑Kpnl_逦Kpn邋丨抽切逦Kpnl_逡逑-CCTA邋"i邋mQG邋ACC邋ii邋GG邋ACC—逡逑CC一逦逦GGTA逦HOT)逡逑CC—逡逑}帟}沐逡逑M邋抒本A作本B邋MC逡逑B逡逑图2邋PCR-RFLP技术基因分型示意图逡逑3.4.2引物设计逡逑rsl800795[2Q,211、rsl800796邋C/G[22]和邋rsl800797G/A丨2G]位点扩增引物参照逡逑文献设计,引物相关信息见下表4:逡逑18逡逑

电泳图,位点,电泳图,电泳


结果逡逑1.PCR扩增产物电泳结果逡逑1.1IL-6基因rsl800795位点扩X棽锲纬ざ任保叮保猓穑迹乘尽e义贤迹冲澹颍螅戾澹福埃埃罚梗滴坏憷┰霾锏缬就煎义希ǎ保保坝镜牢颍箦澹保福埃埃罚梗滴坏憷┰霾铮保庇镜牢恚幔颍耄澹颍╁义希保插澹桑蹋痘颍颍螅欤福埃埃罚梗段坏憷┰霾锲纬ざ任保福玻猓穑鸚 4所示。逡逑图4邋rsl邋800796位点扩增产物电泳阁逡逑(6泳道为marker,其余为rsl邋800796位点扩增产物)逡逑23逡逑

【参考文献】

相关期刊论文 前4条

1 何凯亮;李永平;吕勇刚;张丹杰;王辉;;IL-6基因启动子多态性与乳腺癌风险的关联性[J];细胞与分子免疫学杂志;2011年11期

2 卢晓明;华立新;王进峰;;苏皖地区汉族人群IL-6-572C>G多态性与前列腺癌易感性的关系[J];中华男科学杂志;2011年08期

3 ;原发性肝癌的临床诊断与分期标准[J];肝脏;2004年S1期

4 黄志碧,邬质彬,徐国诚;广西肝癌高发区人群多种肝炎病毒感染的流行病学研究[J];广西医科大学学报;2000年01期



本文编号:2789596

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