HJURP基因多态性与HBV相关性肝癌遗传易感性的关联研究

发布时间：2020-11-20 23:16

　　目的:在中国人群中探讨Holliday交叉识别蛋白(Holliday Junction Recognition Protein,HJURP)基因单核苷酸多态性位点(Single nucleotide polymorphism,SNP)与乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)相关的肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)易感性的关系,进一步阐述影响肝癌发生的生物学机制。方法:本研究采用候选基因的关联研究策略,涉及两个病例对照人群(广西肝癌病例-对照人群和江苏肝癌病例-对照人群,总共包括448个病例和462个对照)。应用酚氯仿法从5 ml EDTA抗凝的外周血中提取DNA。利用GenomeLab SNPstream分型平台结合Taqman基因分型方法对HJURP基因的24个标签单核苷酸多态性位点进行基因分型;通过RT-PCR半定量实验和免疫组化实验研究关联位点rs3771333基因型与HJURP基因表达差异的相关性。利用SNPStats (http://bioinfo.iconcologia.net/snpstats/start.htm)和SPSS (version 13.0, Chicago, Illinois)软件,对每个SNP位点的基因型和单体型进行logistic回归分析,采用Bonferroni法进行多重检验校正。以比值比(odds ratios, ORs)及其95%可信区限(confidence intervals, CIs)表示相对风险度。遗传易感性分析校正性别、年龄、吸烟、饮酒、家族史等影响因素。比较rs3771333位点基因型与HJURP mRNA表达量的差异用Mann-Whitney U-检验。比较癌组织和癌旁组织HJURP表达水平差异用Wilcox秩和检验;比较rs3771333位点基因型与HJURP蛋白表达水平的差异用Mann-Whitney U-检验。结果:本研究发现rs3771333与HBV相关HCC易感性有显著性关联,相对于A/A基因型,A/C和C/C基因型是风险基因型。在合并人群中的OR值为1.82 (95%可信区间, 1.33-2.49; P = 0.00019);携带rs3771333位点风险C等位的HJURP表达量显著低于A/A基因型携带者(P = 0.0078和0.0077,分别为mRNA水平和蛋白水平)。结论:本项研究首次揭示了在中国人群中HJURP基因多态性与HBV相关HCC易感性之间具有遗传学关联。对于HJRUP-rs3771333位点,相对于A/A基因型,A/C和C/C基因型是风险基因型。同时,通过RT-PCR半定量实验和免疫组化实验证实了rs3771333与HJURP基因的mRNA和蛋白表达水平相关,从而影响HBV相关HCC的遗传易感性。总之,我们的研究结果提示,HJURP基因是中国人群HBV相关HCC的易感基因,HJURP基因的SNP位点rs3771333在此易感性中发挥重要的作用。
【学位单位】：广西医科大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2011
【中图分类】：R512.62;R735.7
【部分图文】：

质控图,基因型