rs3129891和rs77005575位点突变基因型同IBD患者肠粘膜中α-防御素的减少表达相关

发布时间：2021-02-25 18:35

　　研究背景和目的炎症性肠病（IBD）是肠道的一种慢性特发性炎症,根据临床和组织病理学特征,分为溃疡性结肠炎（UC）和克罗恩病（CD）主要表现形式。目前越来越认可的一种观点认为,肠道抗菌肽表达减少导致的无效细菌清除是触发并维持IBD患者中观察到的异常免疫应答的重要因素。人肠道抗菌肽主要由人肠道α-防御素,少量的溶菌酶和分泌型磷脂酶A2（SPLA2）组成。基因型-表型相关研究表明,NOD2突变（SNP8，rs2066844;SNP12,rs2066845;SNP13,rs2066847）与回肠CD相关。在携带这些突变的CD患者中,肠粘膜α-防御素的表达的明显减少,在存在SNP13突变时减少的水平更加显著。然而,在结肠CD和UC患者中,哪些基因变异与抗菌肽的粘膜表达有关,尚不清楚。本研究的目的是为探讨哪些遗传变异可影响结肠CD和UC中粘膜抗菌肽的表达。为了解决这个问题,我们收集结肠CD和UC患者肠粘膜组织,检测它们的抗菌肽表达水平,然后比较这些抗菌肽表达同22个1BD相关SNP的基因型之间的相关性。这些SNP包括rs2066844,rs2066845,rs2066847,rs35261698，... 

【文章来源】：南方医科大学广东省

【文章页数】：135 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图２ｒｓ２０６６８４２的质谱结果图

?结果???ｔｉｓｓｕｅ?ｌｙｓｉｓ，?ＤＮＡ?ｂｉｎｄｉｎｇ?ｔｏ?ｍｅｍｂｒａｎｅ，?ＤＮＡ?ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ．?Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ?ｏｆ?ｇｅｎｏｍｉｃ?ＤＮＡ?ｆｏｒ??ｍｕｔａｔｉｏｎｓ?ｏｆ?ＳＮＰ?ｒｓ２０６６８４２?ｗａｓ?ｐｅｒｆｏｒｍｅｄ?ｕｓｉｎｇ?Ｍａｓｓ?ＡＲＲＡＹ?ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ?Ｓｙｓｔｅｍ??（ＳＥＱＵＥＮＯＭ）?ａｃｃｏｒｄｉｎｇ?ｔｏ?ｔｈｅ?ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｅｒ’ｓ?ｐｒｏｔｏｃｏｌ．?Ｗｉｌｄ?ｈｏｍｏｚｙｇｏｕｓ?ＣＣ?ａｎｄ?ｍｕｔａｎｔ??ｈｅｔｅｒｏｚｙｇｏｕｓ?ＣＴ?ｗｅｒｅ?ｆｏｕｎｄ．??

图４ｒｓ２１７２２５２的质谱结果图。收集的肠道粘膜组织剪碎后，使用ＴａＫａＲａ的基因组ＤＮＡ提??取试剂盒提取ＤＮＡ，包括组织裂解、ＤＮＡ与膜结合、ＤＮＡ纯化等步骤。提取的ＤＮＡ使??用ＳＥＱＵＥＮＯＭ的ＭａｓｓＡＲＲＡＹ?ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ方法检测ＳＮＰ?ｒｓ２１７２２５２的位点核酸信息，发现??ＡＡ野生纯合型和ＡＴ突变杂合型。??Ｆｉｇｕｒｅ?４?Ｍａｓｓ?ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ?ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?ＳＮＰ?ｒｓ２１７２２５２．?Ｆｒｏｚｅｎ?ｂｉｏｐｓｉｅｓ?ｗｅｒｅ?ｄｉｓｒｕｐｔｅｄ??ｍｅｃｈａｎｉｃａｌｌｙ?ａｎｄ?ｇｅｎｏｍｉｃ?ＤＮＡ?ｗａｓ?ｅｘｔｒａｃｔｅｄ?ｕｓｉｎｇ?ＭｉｎｉＢＥＳＴ?Ｕｎｉｖｅｒｓａｌ?Ｇｅｎｏｍｉｃ?ＤＮＡ??Ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ?ｋｉｔ?Ｖｅｒ．５．０?（ＴａＫａＲａ）?ａｃｃｏｒｄｉｎｇ?ｔｏ?ｔｈｅ?ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｅｒ＾?ｐｒｏｔｏｃｏｌ．?Ｉｎ?ｂｒｉｅｆ，?ｉｔ?ｉｎｃｌｕｄｅｓ??３１??

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本文编号：3051399