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HCV感染者免疫状况、病毒基因变异与疾病转归的相关性研究

发布时间:2021-03-04 11:43
  丙型病毒性肝炎是一种危害严重,影响广泛的疾病,丙型肝炎病毒为输血后肝炎的主要病因。探讨HCV的病原学特征,发病机理及研制诊断试剂及疫苗都要求对病毒基因一级结构有深入的了解。HCV呈现高度的基因异质性,变异分布在全基因组,不同的区域频率不一样,5’端非翻译区(5’UTR)最保守,许多商业试剂的开发都是用此区段作为检测HCV存在、定量和分型的基础。另外5’UTR大部分区域和核心蛋白(C)区的前30个核苷酸(nt)共同构成了IRES结构,介导了HCV的翻译,因此此区又可作为抗病毒药物设计的靶点。胞膜区2(E2)是全基因组变异最大的区域,在其N端第1-27个氨基酸(aa)及随后的第91-97aa高度可变,分别称之为高变区1(HVR1),高变区2(HVR2),其氨基酸多样性分别达到80%和100%,是最为常用的检测准种的区域。 本文用PCR扩增产物直接测序的方法对中国大陆部分地区的流行株进行基因分型,从基因、分子水平分析我国的HCV流行株基因异质性特点及可能的原因,探讨其与疾病进展的关系。用RT-nested-hot start-PCR方法扩增5’UTR序列,产物纯化后自动测序仪测序,按照... 

【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:105 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

HCV感染者免疫状况、病毒基因变异与疾病转归的相关性研究


192HCVS’U丁R区基因扩增产物电泳图

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72℃7min1eycle体系:10只PCRreaetionbLLffer3林1林林拌4︸、︸︸、︶2.51刀MdNTPrnix0nU20林MPrimer720林MPrimers1stPCRProdL一ctsExTaq(ZU/林I)ddH,O2协l0.4林l21.2LTotal、/olume30协I上。孙l,作2%琼脂糖凝胶电泳(150v),紫外灯下观察结

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图5.从菌液中扩增HVR!片段电泳图上面的电泳条带为质粒,下面的577bp的条带是目的条带F195.HVRIPCR朋plifieationproductsfromtransf.Or系:10又PCR:eaetionbu挽r3抖l2.5rnMdNTPmix2.4林I20拼MPrimer70·5林l20拼MPrimer80·5林I处理后的菌液2川Taqplus(ZU/”l)0.4林lddH:o一一-一一卫上劲丝一TotalVolume30拼l条件:2些呈3min1eycle

【参考文献】:
期刊论文
[1]丙型肝炎病毒结构区基因变异的研究[J]. 陈嵩,王宇明.  第三军医大学学报. 2001(03)



本文编号:3063156

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