基于Notch信号探讨岩藻多糖对人结肠上皮细胞炎症损伤的保护作用
发布时间:2021-04-05 06:17
目的炎症性肠病(Inflammatory bowel disease,IBD)是一种特发性的肠道炎症性疾病,常累及回肠、结肠及直肠。目前普遍认为肠黏膜屏障的损伤是IBD患者肠道中较为常见的病理学改变,致病机制复杂,其主要原因为肠道上皮细胞的分化异常。现有研究结果表明,Notch信号通路在肠道上皮细胞的分化过程中发挥主要调节作用。岩藻多糖是一种主要来源于褐藻的硫酸盐碳水化合物,研究显示其具有抗炎、抗氧化、抗肿瘤等作用。本研究结合生物信息学分析方法,基于Notch信号通路,探讨岩藻多糖(Fucoidan,FUC)对人正常结肠上皮细胞(NCM460)炎症损伤的保护作用。方法1.生物信息学分析从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中下载GSE55651数据集的原始数据,利用R语言对数据进行预处理后筛选出差异表达基因。利用DAVID数据库和蛋白互作网络分析,筛选出关键的靶基因。2.建立细胞炎症损伤模型、细胞处理及分组体外培养NCM460细胞株,细胞分组如下:(1)空白组:仅添加完全培养基,不含细胞;(2)对照组:使用完全培养基培养细胞;(3)LPS诱导组:在体外培养的细...
【文章来源】:青岛大学山东省
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
火山图注:横坐标为log2(FoldChange),纵坐标为log10(FDR)
青岛大学硕士学位论文16图2.热图注:共172个差异表达基因(其中145个为上调基因,27个为下调基因)。红色表示该基因在该样本上高表达,而深蓝色表示该基因在该样本上低表达。Control(粉红色):对照组;LPS(浅蓝色):炎症组。
结果19图3.GOBP功能注释注:横坐标表示该组基因数目所占比例,纵坐标表示GO功能注释分类名称。红色表示该GO组P值大,而深蓝色表示该GO组P值校圆圈的大小表示基因数目,随着圆圈的不断增大,基因的数目逐渐增多。
【参考文献】:
期刊论文
[1]炎症性肠病流行病学研究进展[J]. 何琼,李建栋. 实用医学杂志. 2019(18)
[2]岩藻多糖对炎症性肠病的作用及其机制[J]. 吴俊仙,董昀凡,袁涛,黄宇康,马嘉政,张娓娓,曹星月,陈允梓. 南京医科大学学报(自然科学版). 2019(09)
[3]食源性天然产物中多糖干预炎症性肠病的研究进展[J]. 陈国伟,邱春红,田灵敏,白卫滨. 食品科学. 2019(13)
[4]Notch信号通路在肠黏膜屏障中的研究进展[J]. 王娜,董欢. 基础医学与临床. 2019(03)
[5]Current global trends in the incidence of pediatric-onset inflammatory bowel disease[J]. Josef Sykora,Renáta Pomaha?ová,Marcela Kreslová,Dominika Cvalínová,P?emysl ?tych,Jan Schwarz. World Journal of Gastroenterology. 2018(25)
[6]Fucoidan protects hepatocytes from apoptosis and inhibits invasion of hepatocellular carcinoma by up-regulating p42/44 MAPK-dependent NDRG-1/CAP43[J]. Yuri Cho,Jung-Hwan Yoon,Jeong-ju Yoo,Minjong Lee,Dong Hyeon Lee,Eun Ju Cho,Jeong-Hoon Lee,Su Jong Yu,Yoon Jun Kim,Chung Yong Kim. Acta Pharmaceutica Sinica B. 2015(06)
[7]维生素D与炎症性肠病的相关性研究进展[J]. 庞园园,方莹,周影. 新医学. 2015(06)
[8]Beneficial effects of fucoidan in patients with chronic hepatitis C virus infection[J]. Naoki Mori,Kazunori Nakasone,Koh Tomimori,Chie Ishikawa. World Journal of Gastroenterology. 2012(18)
本文编号:3119300
【文章来源】:青岛大学山东省
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
火山图注:横坐标为log2(FoldChange),纵坐标为log10(FDR)
青岛大学硕士学位论文16图2.热图注:共172个差异表达基因(其中145个为上调基因,27个为下调基因)。红色表示该基因在该样本上高表达,而深蓝色表示该基因在该样本上低表达。Control(粉红色):对照组;LPS(浅蓝色):炎症组。
结果19图3.GOBP功能注释注:横坐标表示该组基因数目所占比例,纵坐标表示GO功能注释分类名称。红色表示该GO组P值大,而深蓝色表示该GO组P值校圆圈的大小表示基因数目,随着圆圈的不断增大,基因的数目逐渐增多。
【参考文献】:
期刊论文
[1]炎症性肠病流行病学研究进展[J]. 何琼,李建栋. 实用医学杂志. 2019(18)
[2]岩藻多糖对炎症性肠病的作用及其机制[J]. 吴俊仙,董昀凡,袁涛,黄宇康,马嘉政,张娓娓,曹星月,陈允梓. 南京医科大学学报(自然科学版). 2019(09)
[3]食源性天然产物中多糖干预炎症性肠病的研究进展[J]. 陈国伟,邱春红,田灵敏,白卫滨. 食品科学. 2019(13)
[4]Notch信号通路在肠黏膜屏障中的研究进展[J]. 王娜,董欢. 基础医学与临床. 2019(03)
[5]Current global trends in the incidence of pediatric-onset inflammatory bowel disease[J]. Josef Sykora,Renáta Pomaha?ová,Marcela Kreslová,Dominika Cvalínová,P?emysl ?tych,Jan Schwarz. World Journal of Gastroenterology. 2018(25)
[6]Fucoidan protects hepatocytes from apoptosis and inhibits invasion of hepatocellular carcinoma by up-regulating p42/44 MAPK-dependent NDRG-1/CAP43[J]. Yuri Cho,Jung-Hwan Yoon,Jeong-ju Yoo,Minjong Lee,Dong Hyeon Lee,Eun Ju Cho,Jeong-Hoon Lee,Su Jong Yu,Yoon Jun Kim,Chung Yong Kim. Acta Pharmaceutica Sinica B. 2015(06)
[7]维生素D与炎症性肠病的相关性研究进展[J]. 庞园园,方莹,周影. 新医学. 2015(06)
[8]Beneficial effects of fucoidan in patients with chronic hepatitis C virus infection[J]. Naoki Mori,Kazunori Nakasone,Koh Tomimori,Chie Ishikawa. World Journal of Gastroenterology. 2012(18)
本文编号:3119300
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