中国汉族人群溃疡性结肠炎的候选基因研究

发布时间：2021-04-13 05:24

　　目的:溃疡性结肠炎是结肠的慢性炎症性疾病,它和克罗恩病共同构成炎症性肠病的两种主要亚型。许多证据表明遗传易感性在溃疡性结肠炎的发病机制中扮演重要的角色。近期的全基因组关联研究发现了溃疡性结肠炎的一些新的易感基因,并且大部分结果已经在不同的队列中得到了一致性重复。然而,这些研究结果都仅来自于高加索人群,中国人群中溃疡性结肠炎患者的遗传背景并不清楚。本研究的目的是:在中国人群中,对新近发现的易感基因IL10、IL2、IL21、MYO9B、ECM1、MST1和IL23R与溃疡性结肠炎之间的易感性进行关联研究,并进一步探索基因型与疾病表型之间的关系。方法:本研究为病例对照关联研究,包括245例溃疡性结肠炎患者和300例健康对照,全部为中国汉族人群。采用Taqman^@基因分型技术对这7个易感基因的27个标签SNPs进行检测。实验数据的分析使用UNPHASED3.0.12和Haploview4.0软件包。结果:IL2-IL21基因区域与UC之间具有显著关联。IL2基因上的rs2069762(P=7.0×10^-4,OR=1.54,95%CI 1.20-1.... 

【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校

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【学位级别】：博士

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英文摘要
第一章 前言
    1.1 炎症性肠病概述
    1.2 本课题的整体研究策略
第二章 材料与方法
    2.1 临床样本与临床资料的收集
        2.1.1 病例组—溃疡性结肠炎患者
        2.1.2 对照组
        2.1.3 临床资料的收集
    2.2 SNP的选择
    2.3 SNP的分型
        2.3.1 主要试剂
            2.3.1.1 DNA提取的相关试剂
            2.3.1.2 PCR相关试剂及其浓度
        2.3.3 主要实验技术步骤
            2.3.3.1 DNA的提取
            2.3.3.2 DNA的定量
            2.3.3.3 实时定量聚合酶链反应
            2.3.3.4 等位基因分型鉴定
    2.4 统计方法
        2.4.1 Pedigree数据库的构建
        2.4.2 基因型分布频率的Hardy-Weinberg平衡检验
        2.4.3 病例-对照关联研究数据分析
        2.4.4 单体型分析
        2.4.5 数量性状分析
        2.4.6 关联研究结果的校正
第三章 研究结果
    3.1 候选基因与溃疡性结肠炎的相关性研究结果
        3.1.1 Hardy-Weinberg平衡检验结果
        3.1.2 基于等位基因的关联分析结果
        3.1.3 基于基因型的关联分析结果
        3.1.4 单体型分析结果
    3.2 候选基因与临床表型的相关性分析结果
        3.2.1 等位基因-表型关联分析的结果
        3.2.2 基因型-表型关联分析结果
第四章 讨论
    4.1 严格筛选研究样本的重要性
    4.2 候选基因的选择
    4.3 SNP选择方法的创新点
    4.4 等位基因鉴定技术的先进性
    4.5 对本研究结果的详细讨论
        4.5.1 IL2-IL21基因区域与溃疡性结肠炎
        4.5.2 IL23R基因与溃疡性结肠炎
        4.5.3 MYO9B基因与溃疡性结肠炎
        4.5.4 ECM1基因与溃疡性结肠炎
        4.5.5 IL10基因与溃疡性结肠炎
        4.5.6 MST1基因与溃疡性结肠炎
    4.6 未来研究的预期方向
第五章 小结
参考文献
综述
    参考文献
简历
致谢



本文编号：3134701