基于宏基因组学/培养组学的胆囊炎菌群致病机制研究
发布时间:2021-04-24 23:46
目的运用宏基因组学及培养组学的方法对健康人粪便样本和胆囊炎患者粪便及相应的胆汁样本进行高通量全基因组测序和高通量分离培养,对胆囊炎相关菌群进行全面解析,探讨胆囊炎菌群的致病机制。方法收集5例健康人粪便样本和5例胆囊炎患者的胆汁及相应粪便样本,采用11种不同的培养基对培养组样本进行大规模分离培养并同时抽提细菌总DNA,对分离培养出的细菌使用MALDI-TOF飞行时间质谱结合16S rRNA进行细菌鉴定。采用鸟枪法宏基因组测序技术对测序组样本进行测序,抽提环境中总DNA。基于培养组学、宏基因组学的结果,探讨胆囊炎菌群的致病机制。结果1、通过对5例健康人粪便标本和5例胆囊炎患者粪便和胆汁样本进行培养组学分析共分离鉴定到727株细菌,隶属于22个属,共40个菌种。其中健康人粪便中共分离出328株细菌,隶属于15个属,共20种;其中最常分离到的为双歧杆菌属(Bifidobacterium)、乳杆菌属(Lactobacillus)和埃希氏菌属(Escherichia),分别分离到53株、44株和33株。胆囊炎患者总共分离出399株细菌,隶属于18个属,35个种。其中胆汁样本分离培养得到细菌25株,...
【文章来源】:湖南师范大学湖南省 211工程院校
【文章页数】:103 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
英文摘要
第一章 前言
第二章 胆囊炎相关微生物培养组学分析
2.1 实验材料和实验方法
2.2 实验结果与分析
2.3 实验结论
第三章 胆囊炎相关微生物宏基因组学分析
3.1 实验方法
3.2 生物信息学分析
3.3 实验结果与分析
3.4 实验结论
第四章 讨论
第五章 结论
第六章 创新与不足
参考文献
综述
参考文献
英文缩略词对照表
附录
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]人体微生态研究现状与展望[J]. 廖秦平,牛小溪. 中国实用妇科与产科杂志. 2017(08)
[2]老年急性结石性胆囊炎腹腔镜手术时机的探讨[J]. 张宗明,魏文平,刘卓,田祖豪,张翀,刘立民,于宏伟,万柏江,刘子旭,朱明文,宋蒙蒙,邓海,谢朝辉. 中华普外科手术学杂志(电子版). 2016(05)
[3]Escherichia coli challenge and one type of smectite alter intestinal barrier of pigs[J]. Juliana Abranches Soares Almeida,Yanhong Liu,Minho Song,Jeong Jae Lee,H Rex Gaskins,Carol Wolfgang Maddox,Orlando Osuna,James Eugene Pettigrew. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2014(02)
[4]急、慢性胆囊炎胆汁细菌培养及抗生素敏感性188例比较分析[J]. 颜伟笔,徐小丰,周龙飞. 现代诊断与治疗. 2013(17)
[5]上海松江地区胆囊良性疾病的流行病学调查30901例[J]. 孙晓敏,徐萍,马志红,程晓松,朱佳莉,何桂钧,任大宾. 世界华人消化杂志. 2011(27)
[6]Helicobacter species and common gut bacterial DNA in gallbladder with cholecystitis[J]. Peren H Karagin,Unne Stenram,Torkel Wadstrm,sa Ljungh. World Journal of Gastroenterology. 2010(38)
本文编号:3158289
【文章来源】:湖南师范大学湖南省 211工程院校
【文章页数】:103 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
英文摘要
第一章 前言
第二章 胆囊炎相关微生物培养组学分析
2.1 实验材料和实验方法
2.2 实验结果与分析
2.3 实验结论
第三章 胆囊炎相关微生物宏基因组学分析
3.1 实验方法
3.2 生物信息学分析
3.3 实验结果与分析
3.4 实验结论
第四章 讨论
第五章 结论
第六章 创新与不足
参考文献
综述
参考文献
英文缩略词对照表
附录
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]人体微生态研究现状与展望[J]. 廖秦平,牛小溪. 中国实用妇科与产科杂志. 2017(08)
[2]老年急性结石性胆囊炎腹腔镜手术时机的探讨[J]. 张宗明,魏文平,刘卓,田祖豪,张翀,刘立民,于宏伟,万柏江,刘子旭,朱明文,宋蒙蒙,邓海,谢朝辉. 中华普外科手术学杂志(电子版). 2016(05)
[3]Escherichia coli challenge and one type of smectite alter intestinal barrier of pigs[J]. Juliana Abranches Soares Almeida,Yanhong Liu,Minho Song,Jeong Jae Lee,H Rex Gaskins,Carol Wolfgang Maddox,Orlando Osuna,James Eugene Pettigrew. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2014(02)
[4]急、慢性胆囊炎胆汁细菌培养及抗生素敏感性188例比较分析[J]. 颜伟笔,徐小丰,周龙飞. 现代诊断与治疗. 2013(17)
[5]上海松江地区胆囊良性疾病的流行病学调查30901例[J]. 孙晓敏,徐萍,马志红,程晓松,朱佳莉,何桂钧,任大宾. 世界华人消化杂志. 2011(27)
[6]Helicobacter species and common gut bacterial DNA in gallbladder with cholecystitis[J]. Peren H Karagin,Unne Stenram,Torkel Wadstrm,sa Ljungh. World Journal of Gastroenterology. 2010(38)
本文编号:3158289
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/xiaohjib/3158289.html
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