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HCV慢性感染患者病毒基因型、NS3区耐药相关变异和细胞毒T淋巴细胞表位变异的分析

发布时间:2021-06-12 23:18
  丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV)具有相当高的变异性,HCV感染后多数可发展为慢性丙型肝炎,部分患者可进一步发展为肝硬化和肝癌。HCV基因型可以明显影响α干扰素抗病毒治疗的疗效,其中1型与2型HCV感染相比应答率较低。NS3蛋白是一种多功能蛋白,在病毒的生命周期中起重要作用,因而成为新型抗HCV药物的最主要的靶点。NS3蛋白同时也是细胞毒T淋巴细胞(CTL)的识别靶位。目前我国北方地区缺少近期大样本HCV基因分型资料,我国患者中HCV NS3区相关耐药变异和CTL表位变异尚未见报道。本文在对767例北方地区基因型的分析和150例HCV NS3蛋白激酶编码区序列分析,以了解我国北方地区HCV感染患者中近期HCV基因型流行状况以及蛋白酶抑制剂的天然耐药相关变异和CTL表位变异状况。目的(1)对北方地区慢性HCV感染患者的基因型进行分析,以进一步了解我国北方地区近期HCV基因型流行特点。(2)建立扩增和检测我国各种基因型HCV感染患者NS3蛋白激酶编码区序列扩增分析的方法。(3)对NS3区进行序列分析,揭示我国北方地区HCV感染患者中与NS3蛋白酶抑制剂相关耐药变异和... 

【文章来源】:中国人民解放军军事科学院北京市

【文章页数】:48 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

HCV慢性感染患者病毒基因型、NS3区耐药相关变异和细胞毒T淋巴细胞表位变异的分析


HCV基因组结构图

电泳图,产物,电泳,基因芯片


表 5. 两种方法 HCV 基因分型结果比较数(150)测序分型基因芯片法 Mega4 N因 1a 型因 1b 型因 2a 型因 3a 型因 3b 型因 6 型1 1 100 98 34 32 6 6 6 6 3 3 基因型均可扩出较为单一的 PCR 产物,但产物长度可应基别(图 8)。

序列,位点,耐药,基因型


图 9. HCV NS3NS3 区分子进化分析 区序列分析耐药相关突变位点结果各型 NS3 序列的 543 个氨基酸中分别有 253/543(1b/543(3a)、94/543(3b)和 69/543(6 型)个位点发代,另外一条序列中出现一处位点插入突变。所有样elaprevir 耐药相关的 V36M/A,T54A,R155K/T,A/对这些位点的分析中,检出有 3 例(2%)的 1b 基因S 变异形式,另外在 1b 基因型样本中检出 V36G 和 V表 9),而 2a 基因型样本在此位点上的表现形式均为

【参考文献】:
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本文编号:3226493

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