克罗恩病的早期诊断及肠道菌群变化的研究
发布时间:2021-07-15 09:59
第一部分:回盲部炎性病变的随访及其对克罗恩病早期诊断的意义研究背景和目的:克罗恩病(Crohn’s disease,CD)是病因未明的胃肠道慢性炎症性疾病,临床表现复杂多样,病程呈进行性破坏,反复发作,致残性强。近年来,我国CD的发病率呈上升趋势,疾病负担越来越重。CD在早期阶段缺乏特异的症状和体征,目前尚无明确的早期诊断标准和有效的诊断标志物,多数患者具备CD典型表现时才能获得临床诊断,这时疾病往往已进入进展期并出现并发症,预后较差。早期诊断有助于抓住CD治疗的机会窗,减少肠损伤和预防致残,从而改善预后。研究发现对生物发病期或临近发病期的个体,尤其是对CD患者的一级亲属进行前瞻性随访或筛查,可获得关于CD自然病程的相关信息,并实现早期诊断;然而,我国CD患者的阳性家族史仅为1.2%,难以通过此方式进行早期诊断研究。此外,有报道指出借鉴大肠癌伺机性筛查的经验,对具有CD患病风险的人群进行筛查,有望成为CD早期诊断的有效方法。本部分通过对不明原因的回盲部炎性病变患者的前瞻性随访,旨在了解我国CD患者的早期病变特点,为临床早诊提供线索。方法:纳入2013年1月至2018年12月于解放军总医...
【文章来源】:中国人民解放军陆军军医大学重庆市
【文章页数】:71 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
OTUsVenn图分析
陆军军医大学硕士学位论文34图3-2Rankabundance曲线3.3.4Alpha多样性分析使用R软件的Kruskal.test函数分别对样本多样性的各个指数进行秩和检验分析,以检验样本组间的Alpha多样性指数是否具有显著性差异。如图3-3所示,与对照组相比,进展期CD组的菌群丰富度(Chao1指数)和物种多样性(Shannon指数、Simpson指数)差异均有统计学意义(P<0.05);分别与对照组和进展期CD组相比,早期CD组的菌群丰富度(Chao1指数)和物种多样性(Shannon指数、Simpson指数)差异均无统计学意义(P>0.05)。
陆军军医大学硕士学位论文35图3-3Alpha多样性指数箱线图A.Chao1指数;B.Shannon指数;C.Simpson指数。横坐标表示样品分组,纵坐标表示不同分组下的Alpha多样性指数值。3.3.5Beta多样性分析各样本在物种多样性方面存在的差异采用Beta多样性分析。相似性(Anosim)分析和主坐标分析(PCoA)是两种常用的Beta多样性分析方法。基于Unifrac算法的Anosim分析用以检验组间的差异是否显著大于组内差异,从而判断分组是否有意义;UniFrac指数越大,样品间的差异越大,结果分为加权(Weighted)与非加权(Unweighted)两种,加权UniFrac考虑了序列的丰度。考虑CD患者潜在的混杂因素,如药物使用、累及部位等,选择加权UniFrac指数进行分析。使用PCoA分析展示各个样品间的差异大小,如果两个样品UniFrac距离较近,说明其物种组成相近。如图3-4所示,与对照组相比,早期CD和进展期CD组的菌群结构上差异均有统计学意义(P<0.05)(WeightedUnifracAnosim:早期CDvs对照组,R=0.146,P=0.008;进展期CDvs对照组,R=0.186,P=0.001)。早期CD和进展期CD的样本位置很接近,表明早期CD组和进展期CD组样本存在相似的细菌群落结构(WeightedUnifracAnosim:R=-0.033,P=0.866)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]腹部超声检查在炎症性肠病早期诊断及活动期、缓解期评估中的应用价值[J]. 张玉芝. 中国肛肠病杂志. 2019(08)
[2]腹部超声检查在炎症性肠病早期诊断和活动性评估中的价值分析[J]. 文武军. 齐齐哈尔医学院学报. 2019(03)
[3]磁控胶囊内镜对小肠克罗恩病早期诊断的临床研究[J]. 王吉,胡梅洁,郑雄,胡晓莹,姚睿宏. 中华胃肠内镜电子杂志. 2019(01)
[4]克罗恩病早期诊断及其临床干预初探[J]. 李舒,盛剑秋,陆晓娟,杨浪,李娜,王海红,赵晓军,曹翠云,李世荣. 胃肠病学和肝病学杂志. 2019(01)
[5]小肠MR灌注成像定量参数对克罗恩病早期诊断及活动性评估的初步研究[J]. 吴吟晨,郑贤应,曹代荣,林雪花,黄楠,陈琦,黄欣瑶. 临床放射学杂志. 2018(12)
[6]回盲部病变的影像学研究进展[J]. 邓文林. 影像研究与医学应用. 2018(22)
[7]炎症性肠病诊断与治疗的共识意见(2018年·北京)[J]. 吴开春,梁洁,冉志华,钱家鸣,杨红,陈旻湖,何瑶. 中国实用内科杂志. 2018(09)
[8]克罗恩病诊断延迟对早期病程的影响[J]. 贾雪梅,张吉翔,邓欢,郭远美,田山,董卫国. 中华消化杂志. 2018 (05)
[9]Fecal microbial dysbiosis in Chinese patients with inflammatory bowel disease[J]. Hai-Qin Ma,Ting-Ting Yu,Xiao-Jing Zhao,Yi Zhang,Hong-Jie Zhang. World Journal of Gastroenterology. 2018(13)
[10]炎症性肠病血清学标志物的研究进展[J]. 曾俊祥,潘秀军,沈立松. 检验医学. 2018(02)
硕士论文
[1]“克罗恩病前期”病变的伺机性筛查[D]. 李舒.大连医科大学 2016
本文编号:3285486
【文章来源】:中国人民解放军陆军军医大学重庆市
【文章页数】:71 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
OTUsVenn图分析
陆军军医大学硕士学位论文34图3-2Rankabundance曲线3.3.4Alpha多样性分析使用R软件的Kruskal.test函数分别对样本多样性的各个指数进行秩和检验分析,以检验样本组间的Alpha多样性指数是否具有显著性差异。如图3-3所示,与对照组相比,进展期CD组的菌群丰富度(Chao1指数)和物种多样性(Shannon指数、Simpson指数)差异均有统计学意义(P<0.05);分别与对照组和进展期CD组相比,早期CD组的菌群丰富度(Chao1指数)和物种多样性(Shannon指数、Simpson指数)差异均无统计学意义(P>0.05)。
陆军军医大学硕士学位论文35图3-3Alpha多样性指数箱线图A.Chao1指数;B.Shannon指数;C.Simpson指数。横坐标表示样品分组,纵坐标表示不同分组下的Alpha多样性指数值。3.3.5Beta多样性分析各样本在物种多样性方面存在的差异采用Beta多样性分析。相似性(Anosim)分析和主坐标分析(PCoA)是两种常用的Beta多样性分析方法。基于Unifrac算法的Anosim分析用以检验组间的差异是否显著大于组内差异,从而判断分组是否有意义;UniFrac指数越大,样品间的差异越大,结果分为加权(Weighted)与非加权(Unweighted)两种,加权UniFrac考虑了序列的丰度。考虑CD患者潜在的混杂因素,如药物使用、累及部位等,选择加权UniFrac指数进行分析。使用PCoA分析展示各个样品间的差异大小,如果两个样品UniFrac距离较近,说明其物种组成相近。如图3-4所示,与对照组相比,早期CD和进展期CD组的菌群结构上差异均有统计学意义(P<0.05)(WeightedUnifracAnosim:早期CDvs对照组,R=0.146,P=0.008;进展期CDvs对照组,R=0.186,P=0.001)。早期CD和进展期CD的样本位置很接近,表明早期CD组和进展期CD组样本存在相似的细菌群落结构(WeightedUnifracAnosim:R=-0.033,P=0.866)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]腹部超声检查在炎症性肠病早期诊断及活动期、缓解期评估中的应用价值[J]. 张玉芝. 中国肛肠病杂志. 2019(08)
[2]腹部超声检查在炎症性肠病早期诊断和活动性评估中的价值分析[J]. 文武军. 齐齐哈尔医学院学报. 2019(03)
[3]磁控胶囊内镜对小肠克罗恩病早期诊断的临床研究[J]. 王吉,胡梅洁,郑雄,胡晓莹,姚睿宏. 中华胃肠内镜电子杂志. 2019(01)
[4]克罗恩病早期诊断及其临床干预初探[J]. 李舒,盛剑秋,陆晓娟,杨浪,李娜,王海红,赵晓军,曹翠云,李世荣. 胃肠病学和肝病学杂志. 2019(01)
[5]小肠MR灌注成像定量参数对克罗恩病早期诊断及活动性评估的初步研究[J]. 吴吟晨,郑贤应,曹代荣,林雪花,黄楠,陈琦,黄欣瑶. 临床放射学杂志. 2018(12)
[6]回盲部病变的影像学研究进展[J]. 邓文林. 影像研究与医学应用. 2018(22)
[7]炎症性肠病诊断与治疗的共识意见(2018年·北京)[J]. 吴开春,梁洁,冉志华,钱家鸣,杨红,陈旻湖,何瑶. 中国实用内科杂志. 2018(09)
[8]克罗恩病诊断延迟对早期病程的影响[J]. 贾雪梅,张吉翔,邓欢,郭远美,田山,董卫国. 中华消化杂志. 2018 (05)
[9]Fecal microbial dysbiosis in Chinese patients with inflammatory bowel disease[J]. Hai-Qin Ma,Ting-Ting Yu,Xiao-Jing Zhao,Yi Zhang,Hong-Jie Zhang. World Journal of Gastroenterology. 2018(13)
[10]炎症性肠病血清学标志物的研究进展[J]. 曾俊祥,潘秀军,沈立松. 检验医学. 2018(02)
硕士论文
[1]“克罗恩病前期”病变的伺机性筛查[D]. 李舒.大连医科大学 2016
本文编号:3285486
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