肠道菌群特征与抗结核药物性肝损伤的关系研究
发布时间：2021-07-28 05:26
目的探究肺结核患者治疗前、后肠道菌群的动态改变情况,并分析肠道菌群与抗结核药物性肝损伤（ADLI）的关系;分析四种一线抗结核药物构建肝损伤模型大鼠的肠道菌群构成及肠道屏障功能的变化。利用筛检出的菌株构建干预模型,探究其在抗结核药物性肝损伤中潜在作用机制。方法首先,收集2017年10月2018年10月期间在内蒙古呼伦贝尔市传染病医院确诊的肺结核患者治疗前（TI）和治疗后（T2）的两份粪便标本,并按照治疗后34周间是否发生肝损伤将患者分为肝损伤组（ADLI组）和非肝损伤组（NonADLI组）。利用细菌16S rDNA高通量测序方法分析肠道菌群的差异、全自动生化分析仪检测肝功能指标的变化、ELISA法检测血清TNF-α和IL-6水平的变化。其次,使用四种抗结核药物异烟肼（H）、利福平（R）、吡嗪酰胺（Z）、乙胺丁醇（E）联合给药建立大鼠肝损伤模型。大鼠随机分为对照组（D组,n=8）、HRZE给药15天组（HRZET1,n=8）、HRZE给药30天组（HRZET2,n=8）,16S r...
【文章来源】：华北理工大学河北省
【文章页数】：142 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
肝损伤组和非肝损伤组从T1到T2时肝功能指标的变化
ADLI与Non_ADLI组比较,TNF-α和IL-6蛋白的含量在ADLI_T1 vs Non_ADLI_T1时均无统计学差异（均P>0.05）,而在ADLI_T2 vs Non_ADLI_T2时均存在统计学差异（均P<0.05）,且在ADLI_T2组水平均要高于Non_ADLI_T2组。1.2.4 测序序列的统计分析
121例患者（44例ADLI患者和77例Non-ADLI患者）在T1和T2两个时点共242份粪便样本经测序共获得8637463条有效序列,每个样本的平均序列数目为35692.00±11546.38条,这些序列长度主要集中在421-440bp之间（图3）,平均长度为417.88±5.07bp。利用Usearch软件在0.97相似度下进行OTU聚类,再将所有clean reads比对到OTU序列上,最终得到7660593条mapped reads,平均每个样本的mapped reads数量为31655.34±10292.11条,各样本划分的OTU数目总共27322个。就各分组而言,ADLI_T1组和ADLI_T2组有效序列分别为1558272条（平均序列数为35415.27±13221.70条）和1620855条（平均序列数为36837.61±10543.88条）,经OTU聚类后分别得到1341473条高质量序列（平均序列数为30488.02±11792.23条）和1452003条高质量序列（平均序列数为33000.07±9874.82条）；Non_ADLI_T1组和Non_ADLI_T2组有效序列分别为2650870条（平均序列数为34426.88±11260.36条）和2807466条（平均序列数为36460.609±11435.34条）,经OTU聚类后分别得到2370341条高质量序列（平均序列数为30783.65±10559.31条）和2496776条高质量序列（平均序列数目为32425.66±9345.99条）。每个样本详细的MiSeq测序信息见表5。图3 序列长度的统计分布
【参考文献】：
期刊论文
[1]Akkermansia muciniphila: a promising target for the therapy of metabolic syndrome and related diseases[J]. ZHOU Ji-Chao,ZHANG Xiao-Wei. Chinese Journal of Natural Medicines. 2019(11)
[2]Gut microbiota dysbiosis in patients with nonalcoholic fatty liver disease[J]. Feng Shen,Rui-Dan Zheng,Xing-Qiang Sun,Wen-Jin Ding,Xiao-Ying Wang,Jian-Gao Fan. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2017(04)
[3]role of the normal gut microbiota[J]. Sai Manasa Jandhyala,Rupjyoti Talukdar,Chivkula Subramanyam,Harish Vuyyuru,Mitnala Sasikala,D Nageshwar Reddy. World Journal of Gastroenterology. 2015(29)
本文编号：3307311
【文章来源】：华北理工大学河北省
【文章页数】：142 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
肝损伤组和非肝损伤组从T1到T2时肝功能指标的变化
ADLI与Non_ADLI组比较,TNF-α和IL-6蛋白的含量在ADLI_T1 vs Non_ADLI_T1时均无统计学差异（均P>0.05）,而在ADLI_T2 vs Non_ADLI_T2时均存在统计学差异（均P<0.05）,且在ADLI_T2组水平均要高于Non_ADLI_T2组。1.2.4 测序序列的统计分析
121例患者（44例ADLI患者和77例Non-ADLI患者）在T1和T2两个时点共242份粪便样本经测序共获得8637463条有效序列,每个样本的平均序列数目为35692.00±11546.38条,这些序列长度主要集中在421-440bp之间（图3）,平均长度为417.88±5.07bp。利用Usearch软件在0.97相似度下进行OTU聚类,再将所有clean reads比对到OTU序列上,最终得到7660593条mapped reads,平均每个样本的mapped reads数量为31655.34±10292.11条,各样本划分的OTU数目总共27322个。就各分组而言,ADLI_T1组和ADLI_T2组有效序列分别为1558272条（平均序列数为35415.27±13221.70条）和1620855条（平均序列数为36837.61±10543.88条）,经OTU聚类后分别得到1341473条高质量序列（平均序列数为30488.02±11792.23条）和1452003条高质量序列（平均序列数为33000.07±9874.82条）；Non_ADLI_T1组和Non_ADLI_T2组有效序列分别为2650870条（平均序列数为34426.88±11260.36条）和2807466条（平均序列数为36460.609±11435.34条）,经OTU聚类后分别得到2370341条高质量序列（平均序列数为30783.65±10559.31条）和2496776条高质量序列（平均序列数目为32425.66±9345.99条）。每个样本详细的MiSeq测序信息见表5。图3 序列长度的统计分布
【参考文献】：
期刊论文
[1]Akkermansia muciniphila: a promising target for the therapy of metabolic syndrome and related diseases[J]. ZHOU Ji-Chao,ZHANG Xiao-Wei. Chinese Journal of Natural Medicines. 2019(11)
[2]Gut microbiota dysbiosis in patients with nonalcoholic fatty liver disease[J]. Feng Shen,Rui-Dan Zheng,Xing-Qiang Sun,Wen-Jin Ding,Xiao-Ying Wang,Jian-Gao Fan. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2017(04)
[3]role of the normal gut microbiota[J]. Sai Manasa Jandhyala,Rupjyoti Talukdar,Chivkula Subramanyam,Harish Vuyyuru,Mitnala Sasikala,D Nageshwar Reddy. World Journal of Gastroenterology. 2015(29)
本文编号：3307311
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/xiaohjib/3307311.html
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