上海市HIV-1主要流行株近全长序列分析与HIV/HCV合并感染者中HCV基因亚型的分布

发布时间：2021-10-08 16:20

　　人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）是导致人获得性免疫缺陷综合征（AIDS）的病原体。我国HIV/AIDS流行呈快速上升趋势。HIV分为HIV-1和HIV-2型,HIV-1的M群至少包含11个亚型,其中CRF01-AE重组型在全国所占比例也有所增加,在上海HIV-1 CRF01-AE重组型为主要的流行株。HIV感染和丙型肝炎病毒感染有着相似的传播途径如经血传播、性传播和母婴传播,因此HIV和HCV混合感染很常见。本研究中,我们应用巢式逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）方法,分段扩增HIV-1近全长基因组相应片段,进行克隆、测序,并进行遗传进化树和序列断点位置。我们还对186份HCV病毒载量大于1000拷贝/ml的来自于河南、云南、新疆维吾尔自治区、吉林和辽宁省HIV-1/HCV合并感染人群标本,用逆转录套式聚合酶链反应方法扩增病人血浆HCV核心基因区并进行基因亚型分型,同时检测病人的HIV-1和HCV载量以及CD4+T细胞计数。主要结果如下:1、完成了5株HIV-1CRF01-AE、1株URF01-AE/B近全基因组克隆,建立了HIV-1 CRF01-AE、URF01-AE/B近全基因组... 

【文章来源】：中国人民解放军海军军医大学上海市 211工程院校

【文章页数】：77 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

PCR产物的琼脂糖电泳

使用引物扩增所需片段，经0.8%琼脂糖凝胶电泳显示扩增序列片段大小与预期片段大小相符(图1.)，即4段片段在2~3Kb左右。克隆入载体后，经过酶切鉴定筛选阳性克隆(图2)1 2 3 4 M3000bp2000bp1000bp4000bp500bp5000bp图1 PCR产物的琼脂糖电泳Fig.1 gel electrophoresis of PCR- 18 -M：DNA分子量标准品；1、2、3、4样品

部分测序结果

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3424521