乙型肝炎患者HBV基因型/亚型的分析与临床意义研究

发布时间：2021-11-08 02:56

　　背景:大量研究发现HBV基因型/亚型与病毒感染途径、基因突变、疾病进程和抗病毒疗效具有一定相关性,且不同地域和人群的基因亚型分布有显著差异。但在以往的研究中,HBV基因型和基因亚型分型的方法多采用PCR RFLP法,其检测结果受到限制性内切酶的功能状态、酶的反应条件及操作人员技术水平等影响较大,这些因素制约了PCR RFLP的检验效能。传统的PCR产物直接测序法获得的信息直观丰富,是基因亚型分型的金标准,但其敏感性较低,通常只有104 IU/ml水平,无论应用于临床检测还是科学研究都很难达到理想的效果。此外,我们在分析大样本量的序列数据时,发现采用人工判断和统计序列差异的方法工作量大、效率低,而国外已有的HBV序列分析数据库都以欧美流行的A型、D型、E型HBV序列为主,且很多数据库需要付费才能使用。目的:本研究拟建立高度敏感特异的HBV序列扩增方法,检测HBV RT全基因和前C区所有突变;建立HBV序列数据库,借助数据库的数据分析和汇总功能,分析2377例HBV序列的RT区耐药突变情况、前C/BCP突变情况、CTL表位变异情况,并对基因亚型B2和C2在乙肝相关疾病进展各个阶段的比例进行... 

【文章来源】：中国人民解放军军事科学院北京市

【文章页数】：57 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

应用VectorNTISuite8.0软件比对GenBank下载209条B基因型与C基因型序列(黄色

科学院硕士学位论文 对实验条件的不断优化，我们建立了高效、敏感的 HBV 序列扩增方 RT 全基因和前 C 区所有突变；对 RT 耐药突变的检测敏感性达到了 认测序法的敏感性（≥104IU/ml）提高了 2 个数量级[14]；同时克服了图 4 PCR 产物测序峰图

；同时克服了高病毒载量图 4 PCR 产物测序峰图图3a 电泳鉴定RT区PCR产物 (3 μl样品)2000 bp1000 bp750 bp500 bp250 bp100 bp图 3b 电泳鉴定前 C/BCP 区PCR 产物 (3 μl 样品)

【参考文献】：
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本文编号：3482865