基于SNP-MaP慢性乙型肝炎不同临床转归全基因组关联研究和乙型重型肝炎预后模型的构建

发布时间：2021-12-28 16:10

　　目的：慢性乙型肝炎的临床转归包括乙肝病毒携带者肝、硬化、肝癌、乙型重型肝炎,它是一组有明确病因的复杂多基因疾病,应用SNP-MaP（snp microarray and pooling）完成全基因组扫描,寻找慢性乙型肝炎重症化的易感位点,并扩大样本验证其易感性位点。方法：根据慢性乙型肝炎的临床转归的表型将样本分为乙肝病毒携带者,肝硬化,肝癌,乙型重型肝炎。应用affymatrix SNP 6.0扫描各组中100个样本随机挑选86个组成DNA pool,并完成3个生物学重复。分别运用两种不同的统计学方法进行分析,挑选差异性最强的SNP位点。在乙肝病毒携带者234例,肝硬化300例,肝癌300例,乙型重型肝炎171例进行个体验证。结果：通过严格的统计学挑选,一共挑选7个SNP进行个体的基因分型。发现两个与肝硬化易感性的多态性位点分别是转录因子TBX5 SNP位点rs3825214在于对照组相比（共显性模型P=0.024,显性模型P=0.008 OR1.8（1.1-2.9））和膜蛋白SCUBE3 SNP位点rs 3800385在于对照组相比（显性模型P=0.0076 OR 1.6（1.1-2... 

【文章来源】：华中科技大学湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

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【学位级别】：博士

【文章目录】：
英文缩略词
第一部分:基于SNP-MaP慢性乙肝不同临床转归全基因组关联研究
    中文摘要
    英文摘要
    正文
        前言
        一、材料和方法
        二、结果
        三、讨论
        参考文献
第二部分:乙型重型肝炎预后模型的构建
    中文摘要
    英文摘要
    正文
        前言
        一、材料和方法
        二、统计
        三.结果
        四、讨论
        参考文献
综述
已发表文章
附一:Affymatrix工作流程图
附二:DNA实验样本96孔板
附三:384孔板加样
附四:973病人调查表格
附五:VG2图TBX5 SCUBE3
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]慢性乙型肝炎急性发作患者血清病毒准种动力学研究[J]. 刘霖,王宇明,兰林,李俊刚,邓国宏,夏杰,赵学兰,张绪清.  中华肝脏病杂志. 2006(01)
[2]Analyses of prognostic indices of chronic liver failure caused by hepatitis virus[J]. Xiao-Mao Li, Lin Ma, Yue-Bo Yang, Zhong-Jie Shi, Shui-Sheng Zhou, Department of Obstetrics and Gynecology, Third Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University, Guangzhou 510630, Guangdong Province, China.  World Journal of Gastroenterology. 2005(18)



本文编号：3554351