代谢组学方法应用于DILI、PBC及AIH代谢特征的研究
发布时间：2022-01-09 08:46
研究背景及目的:临床上发现除病毒性肝炎以外的其它原因导致的肝损伤病人日渐增多,主要包括药物性肝损伤（Drug induced liver injury,DILI）、原发性胆汁性胆管炎（Primary biliary cholangitis,PBC）、自身免疫性肝炎（Autoimmune hepatitis,AIH）等。药物性肝损伤,原发性胆汁性胆管炎及自身免疫性肝炎这三种疾病的临床表现相似,常常需要鉴别诊断。以上疾病的诊断金标准都需要肝组织活检。药物性肝损伤是指由药物本身或其代谢产物引起的肝损伤,也称为药物性肝炎。目前已知,数以千计的药物可引起肝损伤或有潜在的肝毒性;很多药物的赋形剂、中草药以及保健药亦有导致肝损伤的可能。我国目前报道的药物性肝损伤发病率,急性药物性肝损伤约占急性肝损伤住院比例的20%。药物性肝损伤没有特异的临床征象或标志,其临床表现可从无症状、轻微、非特异性的生化改变到急性肝功能衰竭。临床诊断存在困难,因此需要研究药物性肝炎诊断的确切指标。原发性胆汁性胆管炎和自身免疫性肝炎是两种由于自身免疫系统紊乱导致的自身免疫性肝病。由于多样的临床表现和实验室检查结果,原发性胆汁性...
【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：137 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
代谢组学研究技术路线图
可以看到药物性肝损伤患者与健康对照组间有明显的聚类。质量控制（QC）样品紧密结合在一起（图4.3A 及图 4.4A），说明代谢组学数据重复性良好。此外，在本研究中通过在 QC 样品中观察标记的代谢物的变化，即 GCA-d5 和 CA-d5 内标的变化，来评估整个方法的稳定性。为更好地鉴定 DILI 患者的血清代谢产物，构建患者与健康对照组的PLS-DA 模型，如图 4.3B 及图 4.4B 显示了 38 名 DILI（蓝框）患者之间和健康对照组 30 例（绿点）之间满意的分离辨别能力。正离子模型中有三个主要成分（R2X = 0.594, R2Y=0.993, Q2=0.988），而负离子模型中有 2 个主成分（R2X = 0.47, R2Y = 0.995, Q2=0.993。参数 R2Y（cum）和 Q2（cum）分别表示模型的准确度和可预测性，结果表明 PLS-DA 模型有良好的稳定性和良好的预测性。在 PLS-DA 模型中也观察到轻度 DILI 和重度 DILI 组类似的结果
图 4.4 血清负离子模式多变量分析Fig.4.4 Multivariate statistical analysis of serum profiling data generatedin the negative ion mode.图 4.4 (A)负离子模式下检测到的峰的主成分分析图(PCA)。1:健康对照组（绿色圆点）;2:DILI（蓝色方框）;3:质量控制（红色三角）。(B) DILI 患者与健康对照组的血清负离子模型的偏最小二乘判别分析(PLS-DA)散点图。1:健康对照组（绿色圆球）;2:DILI（蓝色方框）。(C)PLS-DA 的负离子模型排序检验，表明模型是有效的，没有过度拟合的迹象。在排序检验中重复排列试验 200 次。(D轻度 DILI 组和重度 DILI 组患者负离子模式下的 PCA 得分图。1:健康对照组;2:轻度 DILI;3:重度DILI。Fig.4.4(A) Plots of PCA scores of peaks detected in the negative ion mode. 1: healthy control; 2: DILI; 3quality control. (B) Scatter plots of PLS-DA with a negative ion model of serum from patients with DILand healthy controls. 1: healthy control; 2: DILI. (C) Validation plot of the original PLS-DA with anegative ion model, strongly indicating that the original model is valid and shows no signs of overfitting
【参考文献】：
期刊论文
[1]Metabolomics studies identify novel diagnostic and prognostic indicators in patients with alcoholic hepatitis[J]. Mona Ascha,Zeneng Wang,Mustafa S Ascha,Raed Dweik,Nizar N Zein,David Grove,J Mark Brown,Stephanie Marshall,Rocio Lopez,Ibrahim A Hanouneh. World Journal of Hepatology. 2016(10)
[2]A serum metabolomic analysis for diagnosis and biomarker discovery of primary biliary cirrhosis and autoimmune hepatitis[J]. Jiang-Shan Lian,Wei Liu,Shao-Rui Hao,De-Ying Chen,Yin-Yin Wang,Jian-Le Yang,Hong-Yu Jia,Jian-Rong Huang. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2015(04)
[3]基于超高效液相色谱质谱的药物性肝损害患者血清代谢组学研究[J]. 李小芬,连江山,王银银,黄建荣. 中国微生态学杂志. 2013(06)
[4]1H NMR-based serum metabolic profiling in compensatedand decompensated cirrhosis[J]. Su-Wen Qi, Zhi-Guang Tu, Lin-Xian Wang, An-Ji Cai, Yong Dai, Key Laboratory of Laboratory Medical Diagnostics, Ministry of Education, Chongqing Medical University, Chongqing 410006, China Wu-Jian Peng, Xin Ou-Yang, Second Clinical Medical College, Jinan University, Guangzhou 510632, Guangdong Province, China. World Journal of Gastroenterology. 2012(03)
[5]Bile-acid-induced cell injury and protection[J]. Maria J Perez,Oscar Briz. World Journal of Gastroenterology. 2009(14)
[6]Bile acids:Chemistry,physiology,and pathophysiology[J]. Maria J Monte,Jose JG Marin,Alvaro Antelo,Jose Vazquez-Tato. World Journal of Gastroenterology. 2009(07)
[7]Autoimmune paediatric liver disease[J]. Giorgina Mieli-Vergani,Diego Vergani. World Journal of Gastroenterology. 2008(21)
[8]Autoimmune liver serology:Current diagnostic and clinical challenges[J]. Dimitrios P Bogdanos,Diego Vergani,Pietro Invernizzi,Ian R Mackay. World Journal of Gastroenterology. 2008(21)
硕士论文
[1]原发性胆汁性肝硬化和自身免疫性肝炎的代谢组学研究[D]. 周豪.吉林大学 2011
本文编号：3578367
【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：137 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
代谢组学研究技术路线图
可以看到药物性肝损伤患者与健康对照组间有明显的聚类。质量控制（QC）样品紧密结合在一起（图4.3A 及图 4.4A），说明代谢组学数据重复性良好。此外，在本研究中通过在 QC 样品中观察标记的代谢物的变化，即 GCA-d5 和 CA-d5 内标的变化，来评估整个方法的稳定性。为更好地鉴定 DILI 患者的血清代谢产物，构建患者与健康对照组的PLS-DA 模型，如图 4.3B 及图 4.4B 显示了 38 名 DILI（蓝框）患者之间和健康对照组 30 例（绿点）之间满意的分离辨别能力。正离子模型中有三个主要成分（R2X = 0.594, R2Y=0.993, Q2=0.988），而负离子模型中有 2 个主成分（R2X = 0.47, R2Y = 0.995, Q2=0.993。参数 R2Y（cum）和 Q2（cum）分别表示模型的准确度和可预测性，结果表明 PLS-DA 模型有良好的稳定性和良好的预测性。在 PLS-DA 模型中也观察到轻度 DILI 和重度 DILI 组类似的结果
图 4.4 血清负离子模式多变量分析Fig.4.4 Multivariate statistical analysis of serum profiling data generatedin the negative ion mode.图 4.4 (A)负离子模式下检测到的峰的主成分分析图(PCA)。1:健康对照组（绿色圆点）;2:DILI（蓝色方框）;3:质量控制（红色三角）。(B) DILI 患者与健康对照组的血清负离子模型的偏最小二乘判别分析(PLS-DA)散点图。1:健康对照组（绿色圆球）;2:DILI（蓝色方框）。(C)PLS-DA 的负离子模型排序检验，表明模型是有效的，没有过度拟合的迹象。在排序检验中重复排列试验 200 次。(D轻度 DILI 组和重度 DILI 组患者负离子模式下的 PCA 得分图。1:健康对照组;2:轻度 DILI;3:重度DILI。Fig.4.4(A) Plots of PCA scores of peaks detected in the negative ion mode. 1: healthy control; 2: DILI; 3quality control. (B) Scatter plots of PLS-DA with a negative ion model of serum from patients with DILand healthy controls. 1: healthy control; 2: DILI. (C) Validation plot of the original PLS-DA with anegative ion model, strongly indicating that the original model is valid and shows no signs of overfitting
【参考文献】：
期刊论文
[1]Metabolomics studies identify novel diagnostic and prognostic indicators in patients with alcoholic hepatitis[J]. Mona Ascha,Zeneng Wang,Mustafa S Ascha,Raed Dweik,Nizar N Zein,David Grove,J Mark Brown,Stephanie Marshall,Rocio Lopez,Ibrahim A Hanouneh. World Journal of Hepatology. 2016(10)
[2]A serum metabolomic analysis for diagnosis and biomarker discovery of primary biliary cirrhosis and autoimmune hepatitis[J]. Jiang-Shan Lian,Wei Liu,Shao-Rui Hao,De-Ying Chen,Yin-Yin Wang,Jian-Le Yang,Hong-Yu Jia,Jian-Rong Huang. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2015(04)
[3]基于超高效液相色谱质谱的药物性肝损害患者血清代谢组学研究[J]. 李小芬,连江山,王银银,黄建荣. 中国微生态学杂志. 2013(06)
[4]1H NMR-based serum metabolic profiling in compensatedand decompensated cirrhosis[J]. Su-Wen Qi, Zhi-Guang Tu, Lin-Xian Wang, An-Ji Cai, Yong Dai, Key Laboratory of Laboratory Medical Diagnostics, Ministry of Education, Chongqing Medical University, Chongqing 410006, China Wu-Jian Peng, Xin Ou-Yang, Second Clinical Medical College, Jinan University, Guangzhou 510632, Guangdong Province, China. World Journal of Gastroenterology. 2012(03)
[5]Bile-acid-induced cell injury and protection[J]. Maria J Perez,Oscar Briz. World Journal of Gastroenterology. 2009(14)
[6]Bile acids:Chemistry,physiology,and pathophysiology[J]. Maria J Monte,Jose JG Marin,Alvaro Antelo,Jose Vazquez-Tato. World Journal of Gastroenterology. 2009(07)
[7]Autoimmune paediatric liver disease[J]. Giorgina Mieli-Vergani,Diego Vergani. World Journal of Gastroenterology. 2008(21)
[8]Autoimmune liver serology:Current diagnostic and clinical challenges[J]. Dimitrios P Bogdanos,Diego Vergani,Pietro Invernizzi,Ian R Mackay. World Journal of Gastroenterology. 2008(21)
硕士论文
[1]原发性胆汁性肝硬化和自身免疫性肝炎的代谢组学研究[D]. 周豪.吉林大学 2011
本文编号：3578367
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/xiaohjib/3578367.html
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