乙肝肝硬化患者肠道微生物宏基因组学的研究

发布时间：2023-11-26 17:00

　　人体作为一个超个体,其生理健康不仅会受到外界环境与自身基因的影响,也会受到机体自身寄居微生物的影响。人体内的微生物组可以看做是一个虚拟的器官,执行着机体的多种代谢功能。而人体大部分的细菌是寄居在肠道的,肠道微生物基因组被誉为人类的“第二基因组”。 正常成年人结肠内pH在5.5-7.0之间,并且肠道菌群结构趋于近似,拟杆菌属占肠道菌群30%,而肠杆菌属和肠球菌属的含量少于1%。肠道中的专性厌氧菌本身对于维持肠道菌群结构的平衡起着至关重要的作用,专性厌氧菌作为肠道中的菌膜屏障,主要通过两种途径来阻止肠道潜在致病菌(通常为兼性厌氧或需氧菌)及毒素在肠上皮细胞的粘附,其一,通过与肠上皮细胞紧密结合,占据空间；其二,通过竞争营养物质,产生酸性代谢产物,降低肠道pH。 据世界卫生组织的数据显示,全球每年约有60万人死于慢性HBV感染。截止至2010年,中国有1.2亿人感染HBV。HBV侵袭肝脏后在肝细胞内复制,从根本上损害肝脏功能,其诱导的机体适应性免疫应答会产生两种效果：杀死肝细胞和清除HBV病毒,经过数年的迁延,发展为肝硬化。在我国,肝硬化患者中血清HBV DNA阳性率高达76.7%。 肝硬化...

【文章页数】：117 页

【学位级别】：硕士

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缩略词表
摘要
Abstract
前言
第一部分 肠道菌群宏基因组DNA的基因数据产出
    1.1 材料与方法
        1.1.1 实验仪器与试剂
        1.1.2 实验步骤
    1.2 结果及讨论
        1.2.1 研究对象的基本信息
        1.2.2 测序结果及数据处理
        1.2.3 基因比对结果
        1.2.4 稀释分析结果
    1.3 小结
第二部分 肝硬化患者和正常人肠道菌群结构及差异分析
    2.1 分析方法
        2.1.1 主成分分析
        2.1.2 显著差异基因的检验及物种注释
        2.1.3 显著差异种属的荧光定量PCR验证
    2.2 结果及讨论
        2.2.1 肝硬化患者与正常人肠道菌群结构分析
        2.2.2 肝硬化患者和正常人肠道菌群的主成分分析
        2.2.3 基于显著差异基因的物种注释及分析
        2.2.4 显著差异种属的荧光定量PCR验证结果
    2.3 小结
第三部分 肝硬化患者和正常人肠道菌群功能及代谢分析
    3.1 分析方法
        3.1.1 功能及代谢注释的方法
        3.1.2 胆汁酸代谢分析的方法
    3.2 结果及讨论
        3.2.1 肝硬化患者和正常人肠道菌群功能及代谢组成分析
        3.2.2 显著差异基因的功能代谢注释及分析
        3.2.3 肝硬化患者肠道菌群的胆汁酸代谢分析
    3.3 小结
第四部分 肝硬化患者肠道微生物特有基因分析
    4.1 分析方法
        4.1.1 特有基因的组装及基因预测
        4.1.2 特有基因的物种及功能代谢注释方法
    4.2 结果及讨论
        4.2.1 肝硬化患者特有基因预测结果
        4.2.2 肝硬化患者特有基因的物种注释
        4.2.3 肝硬化患者特有基因的功能注释及分析
    4.3 小结
讨论
全文总结
参考文献
综述
    参考文献
附表一
附表二
发表文章
个人简历
硕士在读期间发表的文章
致谢



本文编号：3868191