基于高通量测序技术的溃疡性结肠炎及回肠贮袋患者肠道菌群的实验研究

发布时间：2024-05-25 05:17

　　目的:分析溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)、末端回肠造口及全结直肠切除、回肠贮袋肛管吻合术(ileal pouch anal anastomosis,IPAA)术后回肠贮袋患者肠道菌群结构、丰度及多样性变化,探讨肠道菌群介导的UC及贮袋炎发生的微生物学机制。方法:连续选取2017年12月～2018年12月期间在天津医科大学总医院普通外科、消化内科病房及门诊,并接受结肠镜和组织病理学检查且符合条件的UC患者37例、末端回肠造口患者14例及IPAA术后回肠贮袋患者16例,分别记作UC组、造口组和贮袋组;选择同时期性别年龄相匹配的健康人18例作为健康对照组,收集上述4组大便标本至无菌管中,放置低温冰箱储存备用。按照改良Mayo评分系统将UC组分为缓解期(Aa)、轻度活动(Ab)、中度活动(Ac)及重度活动(Ad)四个亚组;按照贮袋炎活动指数评分(PDAI)将贮袋组分为≥7分的贮袋炎组(Pa)和<7分的非贮袋炎组(Pb)两个亚组;按照基础疾病的不同将造口组分为UC术后造口(Sa)组及非UC术后造口(Sb)组。随后对粪便样本DNA进行抽提质检,PCR扩增及产物提纯...

【文章页数】：100 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2.1粪便样本基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳(2)Nan0DroPZo00超微量分光光度计检测表明，1.5OD‘

图2.2NanoDrop2000超微量分光光度计检测粪便样本基因组DNA

图2.3PCR特异性扩增产物的琼脂糖凝胶电泳结果

图2.2NanoDrop2000超微量分光光度计检测粪便样本基因组DNAPCR特异性扩增产物的检测本实验采用琼脂糖凝胶电泳检测经PCR特异性扩增后的产物质量，所得条晰、单一，浓度适中，片段大小在420bp左右，无明显杂带及弥散，表明扩增后产物为细菌16Sr....

图2.4UC各亚组与HC组OTU分布Venn图

释TU对应的物种分类信息，在Silva128数据OTUs代表序列进行比对分析，并在门(Phyluily)、属(Genus)水平注释其群落的物种信息分析后，可以得知样本在各分类水平上的分类学相对丰度，将结果绘制成菌群组成分析柱状平上的菌群组成情况。物种组成别出20个菌....

本文编号：3981758