重庆地区HBV基因型与临床相关性分析及HBV群体遗传学研究

发布时间：2017-09-05 07:09

  本文关键词：重庆地区HBV基因型与临床相关性分析及HBV群体遗传学研究

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【摘要】：目的:了解重庆地区HBV基因型分布特征,探讨各基因型与HBV感染者年龄、性别、肝功能状态、HBe Ag阳性率、病毒复制水平、临床用药、临床表型及HBV S基因突变的关系,为本地区诊治和预防乙型肝炎提供理论依据;研究HBV的群体遗传学,计算重庆各地区HBV群体遗传结构,推测某些地区是否存在HBV可能爆发的威胁。方法:选取重庆8个地区HBs Ag阳性的HBV感染者768例,提取各感染者电子病历中的人口统计学信息和诊断治疗数据,应用PCR和直接测序法获得HBV S基因序列,运用NCBI在线软件genetyping及软件MEGA6.0将HBV S基因序列和在NCBI上下载的21条A-H型标准序列进行系统发育树的构建,分析HBV基因型;运用生物信息软件分析S基因突变位点,通过统计学方法探讨基因型与临床特征及S基因突变的相关性;应用群体遗传学方法,对不同地区不同基因型的HBV群体进行群体遗传学分析,探讨重庆各地区不同基因型HBV的扩张情况。结果:1.768例HBs Ag阳性血清标本中,成功测出HBV S基因序列的有528条。其中B型346例(65.53%),C型181例(34.28%),D型1例(0.19%),未见其他基因型;2.B型和C型在性别、年龄、HBV DNA载量及临床用药方面差异不大,没有统计学意义(P0.05);3.C型HBV感染者ALT异常值(40IU/L)的比例及HBe Ag阳性率明显高于B型(P0.05)。LC/HCC组中C型的比例高于ASC组和CHB组(P0.05),ASC组和CHB组中B型比例高于LC/HCC组中B型比例(P0.01);4.B型和C型HBV S基因不同细胞表位均存在大量突变,B型主要突变类型为I110L、P120T、K122R、T126A/S、P127T、Q129H/R、M133L、T140N;C型突变类型主要有Y100C、Q101R、T113S、S114T、I126T/N/S、G130N、F134L、G131N、S143T。P120T、K122R为B型特异性突变,T113S为C型特异性突变。5.在HBs Ag MHR B型HBV株有140例(140/346)发生了突变,C型有84株(84/181)发生了突变,B型和C型的突变比例无明显差异(P0.05);突变存在单突变和多突变,C型多突变比例38.1%(32/84)高于B型17.9%(25/140),具有统计学意义(P0.01);6.比对后的HBV S基因序列中,346条B型531bp S基因有189个突变位点,250个hap,h为0.978,各地区从0.895-0.999不等,π为0.01644,各地区从0.00694-0.02628不等;181条C型525bp S基因有161个突变位点,163个hap,h为0.999,各地区从0.992-1不等,π为0.02051,各地区从0.01788-0.02604不等;7.各地区B型和C型HBV群体的BSP显示贝叶斯天界线呈上升趋势,中性检验值(Tajima's D值与Fu's Fs值)均为负值,大部分地区的错配分布为单峰倒钟形分布,综合分析表明重庆地区HBV群体近10年经历了一个扩张过程,有的地区甚至扩张了10倍,只有少部分地区的C型扩张不明显(黔江、合川、沙坪坝区)。结论:1.B型为重庆地区的优势基因型,占65.53%;2.C型比B型具有更强的致病力,容易引起肝硬化及肝细胞癌;3.HBV S基因不同表位均存在大量突变,这些突变的病毒抗原性及免疫原性可能发生改变,感染HBs Ab阳性人群。4.C型多突变率比例高于B型,多突变可能会影响HBV的致病性,影响乙肝患者的治疗及预后;5.B型和C型HBV群体h和p均高,提示HBV遗传多样性丰富,生存能力强,且C型高于B型,间接反映C型具有更强的生存能力;6.重庆各地区B型和C型HBV群体都在经历扩张,将来具有爆发的可能,需进一步开展大型的分子流行病学调查并做好预警工作。
【关键词】：乙型肝炎病毒 基因型 临床相关性 HBV S基因突变 群体遗传学
【学位授予单位】：西南医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R512.62
【目录】：

• 中文摘要3-6
• 英文摘要6-10
• 前言10-15
• 技术路线15-16
• 材料与方法16-23
• 结果23-39
• 讨论39-46
• 结论46-47
• 参考文献47-51
• 中英文对照表51-53
• 致谢53-54
• 乙肝疫苗突破性感染患者病毒S基因变异的研究进展（综述）54-66
• 参考文献61-66

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本文编号：796536