武威地区人群IL-1B、TNF-A及IL-8基因多态性与幽门螺杆菌易感性的关联研究

发布时间：2017-09-23 03:57

  本文关键词：武威地区人群IL-1B、TNF-A及IL-8基因多态性与幽门螺杆菌易感性的关联研究

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【摘要】：背景:幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)是引发胃炎和消化性溃疡的主要致病因子,而且与胃癌及黏膜相关淋巴组织淋巴瘤的发生密切相关。Hp在人群中的感染除与经济、文化、医疗水平等有关外,机体的遗传基因多态性与Hp感染也存在相关性。甘肃省武威市曾是丝绸之路上连接东西方文明的重镇。武威地区是胃癌的高发区,人群Hp感染率高,可能是当地胃癌高发的重要原因之一。本研究通过循证医学方法在分析IL-1B、TNF-A、IL-8基因多态性与Hp易感性的基础上,对武威市汉族人群中的IL-1B、TNF-A、IL-8基因多态性与Hp易感性进行了研究。以期探索该地区宿主基因背景与Hp易感性的潜在关联性,为该地区胃癌的防治策略提供新的线索。方法:(1)检索Pubmed、Embase、Cochrane Library、CBM和CNKI在2016年1月前发表的所有关于IL-1B、TNF-A、IL-8基因多态性与Hp感染的相关文献,制定纳入排除标准,对纳入的文献进行质量评价并提取数据,使用STATA 13.1软件来计算合并比值比(odds ratio,OR)和95%置信区间(confidence interval,CI)。使用逐个排除单项研究的方法做敏感性分析,并基于Hp感染检测方法、研究设计方法和种族的差别进行亚组分析。使用Begg秩相关检验和Egger回归检验来检测出版偏倚,用卡方检验检测纳入每项研究的哈迪-温伯格平衡。(2)对来自武威农村地区的662名目标人群进行问卷调查,使用14C呼气试验法检测受试者的Hp感染状况,抽取受试者5 ml抗凝外周血,提取基因组DNA,通过MassARRAY平台依靠时间飞行质谱法检测受试者的IL-1B(-31CT、-511CT、-1473GC)、TNF-A(-308GA、-863CA、-1031TC)、IL-8(-251TA)基因多态性。使用卡方检验计算待测多态性位点的基因型与Hp易感性的关联性。结果:(1)meta分析:il-1b-31ct多态性位点与hp感染风险升高相关(tt+ctvs.cc,or=1.04,95%ci=0.91 1.18;ttvs.ct+cc,or=1.10,95%ci=1.00 1.20;ttvs.cc,or=1.16,95%ci=1.04 1.30;tallelevs.callele,or=1.04,95%ci=0.96 1.13)。il-1b-31ct在elisa亚组中与hp感染风险呈正相关;在对照来源基于人群(population-based,pb)的亚组中与hp感染风险正相关;在亚洲人群亚组中与hp感染正相关。il-1b-511ct位点同样与hp感染风险正相关(tt+ctvs.cc,or=1.10,95%ci=0.98 1.23;ttvs.ct+cc,or=1.06,95%ci=0.97 1.16;ttvs.cc,or=1.10,95%ci=0.99 1.22;tallelevs.callele,or=1.06,95%ci=1.00 1.11)。il-1b-511ct与hp感染在对照来源基于医院(hospital-based,hb)的亚组中显著关联。tnf-a-308ga位点在隐性和纯合子遗传模型中显著降低hp感染风险(aa+agvs.gg,or=0.91,95%ci=0.81 1.03;aavs.ag+gg,or=0.67,95%ci=0.45 1.00;aavs.gg,or=0.67,95%ci=0.45 0.99;aallelevs.gallele,or=0.90,95%ci=0.81 1.01)。-1031tc位点也在隐性和纯合子模型中显著降低hp感染风险(cc+ctvs.tt,or=0.98,95%ci=0.82 1.17;ccvs.ct+tt,or=0.62,95%ci=0.46 0.84;ccvs.tt,or=0.62,95%ci=0.46 0.85;callelevs.tallele,or=0.93,95%ci=0.80 1.09)。-863ca及-857ct位点与hp感染风险无显著相关性。基于hp检测方法的亚组分析结果显示,在非elisa亚组中,tnf-a-857ct及-1031tc位点与hp感染负相关。基于种族的亚组分析结果显示,在亚洲人群中tnf-a-1031tc与hp感染负相关。基于研究设计方法的亚组分析结果显示,在hb亚组中tnf-a-863ca显著升高hp感染风险而-1031tc显著降低其风险。il-8-251ta位点在纯合子和等位基因遗传模型中升高hp感染的风险(aa+tavs.tt,or=1.12,95%ci=0.94-1.33;aavs.ta+tt,or=1.06,95%ci=0.92-1.22;aavs.tt,or=1.17,95%ci=1.00-1.37;aallelevs.tallele,or=1.07,95%ci=1.00-1.16)。在亚洲人群、非elisa亚组和pb亚组中,il-8-251ta位点与hp感染风险正相关。(2)所测武威地区受试者的il-1b-31ct、il-1b-511ct、il-1b-1473gc、tnf-a-308ga、tnf-a-863ca、tnf-a-1031tc、il-8-251ta这7个基因多态性位点与hp感染之间均无显著性关联(p0.05)。结论:(1)在亚洲和拉丁美洲人群中,il-1b-31ct的基因型tt可能增高hp感染的发病风险;在多种族人群中,il-1b-511ct的等位基因t可能增高hp感染的发病风险。(2)在多种族人群中,TNF-A-308GA的基因型AA和-1031TC的基因型CC可能降低Hp感染的发病风险,-857CT、-863CA与Hp感染无关联。(3)在多种族人群中,IL-8-251TA的等位基因A可能是Hp感染的易感基因。(4)中国武威市汉族人群中IL-1B-31CT、IL-1B-511CT、IL-1B-1473GC TNF-A-308GA、TNF-A-863CA、TNF-A-1031TC、IL-8-251TA基因多态性与Hp易感性无显著性关联。该结论需要在更大样本和更多种群的研究中进行验证。
【关键词】：IL-1B TNF-A IL-8 基因多态性 幽门螺杆菌 易感性 关联研究 Meta分析 武威市
【学位授予单位】：兰州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R573
【目录】：

• 中文摘要3-6
• Abstract6-12
• 第一章 IL-1B、TNF-A和IL-8 基因多态性与幽门螺杆菌易感性的研究进展12-19
• 1.1 幽门螺杆菌及其与胃部疾病关联性的研究12-15
• 1.1.1 幽门螺杆菌研究史及其微生物学特征12
• 1.1.2 Hp感染的致病机制及相关胃部疾病12-14
• 1.1.3 Hp的流行病学状况14-15
• 1.1.4 Hp感染的诊断方法15
• 1.2 IL-1B、TNF-A及IL-8 基因多态性与Hp感染关联性的研究15-17
• 1.2.1 IL-1B基因多态性与Hp感染关联性的研究16
• 1.2.2 TNF-A基因多态性与Hp感染关联性的研究16-17
• 1.2.3 IL-8 基因多态性与Hp感染关联性的研究17
• 1.3 本研究的目的及意义17-19
• 第二章 IL-1B、TNF-A和IL-8 基因多态性与Hp易感性的Meta分析19-50
• 2.1 材料与方法19-20
• 2.1.1 检索策略19
• 2.1.2 纳入标准19-20
• 2.1.3 数据提取与质量评价20
• 2.1.4 统计学分析20
• 2.2 结果20-43
• 2.2.1 IL-1B基因多态性与Hp易感性的循证研究结果20-31
• 2.2.2 TNF-A基因多态性与Hp易感性的循证研究结果31-39
• 2.2.3 IL-8 基因多态性与Hp易感性的循证研究结果39-43
• 2.3 讨论43-49
• 2.3.1 IL-1B基因多态性与Hp感染的关联性43-45
• 2.3.2 TNF-A基因多态性与Hp感染的关联性45-46
• 2.3.3 IL-8 基因多态性与Hp感染的关联性46-48
• 2.3.4 Hp诊断方法与亚组分析48-49
• 2.4 结论49-50
• 第三章 武威地区人群IL-1B、TNF-A和IL-8 基因多态性与Hp易感性的关联研究50-64
• 3.1 材料与方法50-58
• 3.1.1 目标人群50
• 3.1.2 主要试剂和材料50
• 3.1.3 主要仪器50-51
• 3.1.4 主要实验方法51-58
• 3.1.5 数据分析58
• 3.2 结果58-62
• 3.2.1 受试人群的基本特征及Hp感染情况58
• 3.2.2 目标人群血液基因组DNA抽提结果58-59
• 3.2.3 IL-1B基因多态性与Hp感染的关联研究结果59-60
• 3.2.4 TNF-A基因多态性与Hp感染的关联研究结果60-61
• 3.2.5 IL-8 基因多态性与Hp感染的关联研究结果61-62
• 3.3 讨论62-63
• 3.4 结论63-64
• 参考文献64-74
• 在学期间的研究成果74-75
• 中英文缩略词对照表75-76
• 附录76-86
• 致谢86

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本文编号：903044