布加氏综合征致病基因的外显子测序研究

发布时间：2017-10-07 15:21

  本文关键词：布加氏综合征致病基因的外显子测序研究

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【摘要】：背景及目的原发性布加氏综合征(primary budd-chiari syndrome,BCS)发病机制及病因复杂,且亚洲国家与欧美国家存在明显的地域差异。在美欧等西方国家,原发性BCS病因多与静脉血栓形成相关,目前研究已经发现JAK2 V617F、FⅤL、FⅡG20210A、MTHFR等多种基因突变与原发性BCS相关,这些基因均是血栓形成的危险因素,它们与多种外部因素共同造成了患者血液处于高凝状态,肝静脉血栓形成导致肝静脉阻塞而最终演变为原发性BCS;然而在包括日本、中国以及印度等亚洲地区,在西方国家内高表达的相关基因却鲜有表达,东方国家原发型BCS相关基因仍然处于未知状态。分子生物学技术飞速发展,下一代测序技术以其高通量、低成本的独特优势,使人类全基因组测序成为可能,也为原发性BCS相关基因的研究带来了新的希望。传统的Sanger测序广泛运用于基因结构的研究,然而其数据产出通量低、成本高、操作复杂的缺陷使其在更深层次的基因研究受限。相较于Sanger测序,NGS测序通量是其数千倍乃至数万倍,而其成本仅仅是前者的千分之一,许多学者已经依靠NGS平台发现此前从未发现的基因突变,显示其在今后基因研究领域潜力无限。通过全基因组外显子组测序技术,对原发性BCS患者的全部外显子进行筛查,以期发现特异的基因突变,对原发性BCS的病因、发病机制等进行进一步的探讨。原发性BCS是一罕见的临床综合征,但在我国河南、安徽等地区发病率明显高于其他地区,具有明显的地域以及家族聚集现象。发现原发性BCS可能存在的致病基因,可以针对高危人群进行早期的检测及预防。方法1.病例采集本科室长期随访一原发性BCS家系。家系内共8人(5名男性,3名女性),所有人均接受下腔静脉彩超及CT下腔静脉成像检查,确诊原发性BCS患者3名。采集外周静脉血标本。2.外显子组测序根据外显子组测序的规范流程,提取基因组DNA,建立文库,外显子测序,上机测序,生物学信息分析,确定候选基因。3.数据分析通过文献复习,蛋白质功能预测,突变频率等总结出感兴趣的候选基因。4.候选基因验证对候选基因进行PCR/sanger测序验证。结果外显子组测序结果生物信息学分析结果得出2例患者共有53共有基因突变,从中筛选出2两个基因突变:HSPG2 c.C4508T、GPR126 c.T3242G。对这两个突变进行验证均得到了阳性的验证结果。结论HSPG2 c.C4508T和GPR126 c.T3242G两个新发现的基因突变位点可能与下腔静脉隔膜型布加氏综合征具有密切的关系。
【关键词】：布加氏综合征 全基因组外显子组测序 HSPG2 GPR126
【学位授予单位】：郑州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R575
【目录】：

• 摘要4-6
• Abstract6-10
• 中英文缩略词表10-11
• 1 前言11-13
• 2 资料与方法13-20
• 3 结果20-34
• 4 讨论34-37
• 5 结论37-38
• 参考文献38-40
• 综述 布加氏综合征病因学研究进展40-51
• 参考文献47-51
• 个人简历及在校期间发表文章51-52
• 致谢52

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本文编号：988597