小型基因芯片作为辐射生物剂量计的探索
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【摘要】:目的:开发针对辐射损伤人员的小型基因芯片,对X射线照射人外周血淋巴细胞后的基因表达进行了分析和验证,为探究不同剂量辐射的分子作用机制和优化生物剂量计提供了进一步实验数据。方法:1.以50种辐射敏感基因作为基础,研制了一种小型基因芯片。2.分别采用辐射剂量为0.1Gy、0.5Gy、2Gy的X射线照射人外周血淋巴细胞。3.照射后4小时及20小时,用自主研制的基因芯片检测淋巴细胞基因表达谱的改变,芯片表达谱数据通过NimbleScan软件分析,选择差异表达≥1.5倍为辐射诱导反应基因。4.利用GO方法分析筛选出的部分辐射反应基因的生物学功能。结果:1.利用基因芯片技术研究x射线照射人外周血淋巴细胞4h后,0.1Gy组基因XPC表达上调,SSBP2表达下调;0.5Gy组基因BBC、GADD45A、IER5、XPC表达上调,SSBP2 CCT5表达下调;2Gy组基因BBC、CDKNIA、GADD45A、IER5 TP53I3、 XRCC5、XPC表达上调,CCT5、SSBP2表达下调。照射20h后,0.5Gy组BAX、BBC3、 TP53I3、XPC表达上调,CCT5、PCNA表达下调;2Gy组BBC3、CDKN1A、TP53I3、 XRCC5、XPC上调,CCT5、PCNA表达下调。2.利用GO分析得出,低剂量辐射诱导产生的基因主要参与细胞间信号通路、信号转导、细胞/组织防御、内环境稳定等过程,而高剂量诱导产生的基因主要参与细胞凋亡、细胞增殖、细胞周期阻滞等过程。结论:1.小型基因芯片技术可作为一种有效的辐射生物剂量计。2.基因BBC3、CCT5、 CDKNIA、GADD45A、IER5、PCNA表达呈剂量依赖性,可作为新型生物剂量计。3.基因DDB2在不同的实验中表达为不同的结果,其是否能作为生物剂量计需要慎重考虑。
【关键词】:电离辐射 基因芯片 辐射诱导基因 高低剂量 GO分析
【学位授予单位】:济南大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R144
【目录】:
- 研究生导师及课题指导小组介绍4-7
- 摘要7-8
- ABSTRACT8-10
- 主要符号表10-11
- 前言11-13
- 材料与方法13-26
- 1 实验材料13-18
- 1.1 实验细胞13
- 1.2 主要试剂13-17
- 1.3 主要实验设备及器材17-18
- 2 实验方法18-26
- 2.1 细胞培养及照射18
- 2.2 提取细胞的总RNA18-19
- 2.3 RNA浓度分析和纯度19
- 2.4 总RNA纯化及质检19-20
- 2.5 变性琼脂糖凝胶电泳20
- 2.6 cDNA合成20-21
- 2.7 RNA酶去除21-22
- 2.8 cDNA制备22
- 2.9 样品标记22-23
- 2.10 确定辐射敏感基因23
- 2.11 设计探针23-24
- 2.12 制备基因芯片24
- 2.13 芯片的杂交与洗涤24-26
- 2.14 扫描26
- 结果26-46
- 1 RNA质控26
- 2 基因芯片荧光扫描结果26-30
- 3 基因芯片信号散点图30-33
- 4 芯片杂交结果33-41
- 5 PATHWAY分析41-44
- 6 GO分析44-46
- 讨论46-52
- 结语52-53
- 参考文献53-57
- 综述57-63
- 参考文献60-63
- 攻读硕士学位期间的研究成果63-64
- 致谢64
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