应用微卫星位点研究安徽、江苏地区湖北钉螺的群体遗传结构

发布时间：2020-12-19 20:01

　　目的:湖北钉螺是日本血吸虫唯一中间宿主,在血吸虫病传播过程中起关键作用。湖北钉螺微卫星DNA库建立之后,为后续微卫星位点的筛选提供了丰富的储存库,但库中的位点却未被充分利用。因此,本文利用生物信息学方法筛选多态性的微卫星位点,设计并合成相应的引物,为后续的群体遗传学分析提供有效的分子标志。湖北钉螺的地理分布与日本血吸虫病的流行区具有严格的一致性,主要分布在我国的长江流域以及南部地区。受到分布范围广、地理隔离以及滋生环境复杂等因素的影响,不同地理群体的湖北钉螺发生了明显的分化和变异。因此,本研究通过对不同地区的湖北钉螺进行群体遗传学研究,以期找出遗传变异的规律,为低流行水平状态下评价湖北钉螺控制措施效果和监测钉螺扩散提供科学依据。方法:从公共数据库（Genbank）中下载湖北钉螺的核苷酸序列,使用SciRoKo3.3软件查找微卫星序列,从中挑选微卫星位点（以3核苷酸重复片段为主）,同时从已发表文献中挑取多态性的微卫星位点。然后,利用软件Primer premier和Oligo来进行引物的设计和评价,并外送合成。鉴定引物扩增的效果,最终构建扩增效果较好的多重反应体系1。从安徽石台、和县、枞... 

【文章来源】：苏州大学江苏省

【文章页数】：68 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

GenBank数据库中湖北钉螺的核苷酸序列数

SciRoKo软件筛选出的含有完全重复序列片段的位点

图 2-1 湖北钉螺样本采集点（绿色菱形为采样地点，蓝色区域为湖泊）1.2 实验室逸蚴经实验室逸蚴无血吸虫尾蚴逸出的钉螺，室内无水乙醇保存用于后续分析。

【参考文献】：
期刊论文
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[3]2005～2014年江苏省血吸虫病疫情分析[J]. 杨秀芹,张键锋.  热带病与寄生虫学. 2017(01)
[4]2015年全国血吸虫病疫情通报[J]. 张利娟,徐志敏,钱颖骏,党辉,吕山,许静,李石柱,周晓农.  中国血吸虫病防治杂志. 2016(06)
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[7]消除血吸虫病——我国血吸虫病防治工作的新目标与新任务[J]. 雷正龙,周晓农.  中国血吸虫病防治杂志. 2015(01)
[8]分子生态学的研究技术和方法及其在植物种群遗传学中的应用[J]. 金海峰.  环境与发展. 2014(08)
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[10]长江下游3省湖北钉螺不同地理种群的群体遗传结构研究[J]. 崔斌,霍志萍,杨坤,张丽,杨频,尤平,李石柱.  中国血吸虫病防治杂志. 2013(06)

硕士论文
[1]基于时空与遗传信息的江苏省江滩钉螺分布规律研究[D]. 何健.江苏省血吸虫病防治研究所 2016
[2]湖北钉螺（Oncomelania hupensis）微卫星DNA文库的建立及多态性位点的筛选[D]. 王艺秀.陕西师范大学 2009



本文编号：2926489