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海南岛重要动物宿主携带病毒的分子流行病学调查

发布时间:2021-02-21 06:49
  研究目的:对海南岛部分地区重要动物宿主(蝙蝠、啮齿动物和家禽等)携带病毒病原体的情况进行调查和监测,为防控海南岛新发传染病和再发传染病提供病毒病原本底数据和技术支持。研究方法:根据海南岛不同地区生态环境的特点,以及重要动物宿主(蝙蝠和啮齿动物等)栖息的情况,选取具有代表性的生态环境作为样本采集地点。通过病毒高通量基因组测序,获得重要动物携带病毒的宏基因组数据,并对病毒宏基因组数据进行生物信息学分析。了解不同生态环境中重要动物宿主携带病毒病原的情况,分析不同生态环境中病毒组的多样性和特点。针对重要的新发病毒进行分离培养,全基因组扩增、遗传进化分析等方面的研究,对有潜在致病风险的病毒开发高效特异的检测方法与技术。研究结果:蝙蝠、啮齿动物和家禽样本采集自海南岛五个县市地区,样本数量约为740份,采集时间为2015年至2016年。根据各物种和采集地点信息进行分组,情况如下:蝙蝠652只(海口火山口HHB组210只,屯昌县TCB组442只),啮齿动物85只(海口市HKS组18只,澄迈县CMS组24只,临高县LGS组24只,黎母山LMS组19只),禽类粪便样本3份(鸡CH组、鸭DU组和鸽PI组)。... 

【文章来源】:海南医学院海南省

【文章页数】:82 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

海南岛重要动物宿主携带病毒的分子流行病学调查


HHB组蝙蝠样本中携带病毒分类图

蝙蝠


图 1.2 TCB 组蝙蝠样本中携带病毒分类图igure 1.2 Overview of sequence reads to different viral genus from group HHB iHainan, China.

啮齿动物


图 1.3 LMS 组啮齿动物样本中携带病毒分类图igure 1.3 Overview of sequence reads to different viral genus from group LMHainan, China.

【参考文献】:
期刊论文
[1]拉沙热病毒及其检测技术[J]. 陈昭斌.  中国卫生检验杂志. 2006(02)

博士论文
[1]蝙蝠病毒组学及其新病毒的发现与鉴定[D]. 何彪.中国人民解放军军事医学科学院 2014

硕士论文
[1]鼠肠道病毒宏基因组学研究[D]. 李旺.江苏大学 2016
[2]云南省鼠类肠道病毒宏基因组研究[D]. 曹婧.大理学院 2015



本文编号:3043996

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