全基因组测序在食源性疾病监控和暴发调查中的应用

发布时间：2017-06-19 05:05

  本文关键词：全基因组测序在食源性疾病监控和暴发调查中的应用，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：全基因组测序(WGS)分型在微生物的遗传与变异特征分析、菌株进化和暴发溯源调查中已经显示出了其极大的应用价值和发展潜力。本文简要概述了WGS的基本原理,介绍了基于全基因组的单核苷酸多态性分型和基于全基因组多位点序列分型两种主要的测序数据解读和分析方式,比较了WGS与脉冲场凝胶电泳技术、多位点序列分型等常见分子分型手段的主要特点,列举了典型的WGS应用于食源性疾病监控和暴发识别的案例,最后对WGS分型在食源性疾病监控和暴发调查领域的发展前景进行了展望。
【作者单位】： 广东省疾病预防控制中心;
【关键词】： 全基因组测序 食源性疾病 暴发调查 溯源分析 食源性致病菌
【基金】：广东省省级科技计划项目(2014A020219004)
【分类号】：R155.3
【正文快照】： 食源性疾病监控和暴发调查主要通过发现异常疾病的聚集,准确、快速地识别病原体,发现传染源,以达到控制甚至终止疾病暴发的目的。20世纪90年代,美国疾病预防控制中心组建了微生物国家分子分型网络Pulse Net,用于准确及时地发现和识别疾病暴发,在大肠杆菌O157和沙门菌暴发调查

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