深圳地区环境水体和人群中诺如病毒监测与分析

发布时间：2017-08-12 21:06

  本文关键词：深圳地区环境水体和人群中诺如病毒监测与分析

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【摘要】：【目的】检测深圳地区环境水体和人群的诺如病毒(No Vs),探讨其是否在两者之间循环传播。【方法】2014年3月至2015年2月检测24份深圳茅洲河河水标本和287份腹泻患者粪便标本。河水标本经过混合纤维素酯膜和PEG法二次浓缩后提取核酸,粪便标本无需浓缩,稀释离心后直接提取核酸。应用实时荧光逆转录PCR初步分型,RT-PCR扩增ORF2保守区域衣壳蛋白(VP1)基因后测序确定亚型、分析不同来源病毒的同源性;同时建立基因进化树,进一步分析不同来源No Vs的亲缘关系。【结果】在河水标本和腹泻患者粪便标本中,No Vs阳性率分别为23.1%和17.4%,其中上下游河水标本阳性率分别为8.3%和41.7%,河水中No VGI型和No VGII型的阳性率为16.7%和8.3%。扩增阳性样本发现茅洲河水中检出No V主要是GI.6型,其次是GII.4 Sydney_2012型,而从腹泻胃肠炎患者粪便标本中检出No Vs主要是No VGII.4Sydney_2012型和少量的GII.3型。同时期水体和人群粪便标本来源的No VGII.4 Sydney_2012型VP1基因相似性98.2% 100.0%。【结论】No VGII.4 Sydney_2012型是深圳地区主要的流行株。No Vs在环境水体和人群中于某种程度上存在循环传播。
【作者单位】： 华中科技大学同济医学院公共卫生学院;深圳市光明新区疾病预防控制中心;深圳市疾病预防控制中心;
【关键词】： 诺如病毒 环境水体 人群
【基金】：深圳市国家科技重大专项项目(No.GJHS20120628150935034)~~
【分类号】：R512.5;R181.3
【正文快照】： 诺如病毒(Noroviruses,No Vs)属于杯状病毒科、诺如病毒属的非包膜单正链RNA(7.5-7.7 kb)病毒,其RNA由3个开放阅读框(ORFs)组成[1]。根据由ORF2编码的VP1氨基酸相似程度,将其分为以下6个基因组(Genogroup):GI、GII、GIII、GIV、GV和GVI,主要感染人的GI和GII又分别被分为9个和2

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1 吴立梦;林庆能;王文静;许慧慧;张曦;;环境水体中感染性胃肠道病毒检测方法研究进展[J];环境与职业医学;2014年06期

2 徐雪华;滕登林;张乃杰;;莱州市2005年外环境水体霍乱监测情况[J];中华预防医学杂志;2006年05期

3 ;[J];;年期

，

本文编号：663609