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人体脑组织RNA表达水平与早期PMI的相关性

发布时间:2017-11-12 17:12

  本文关键词:人体脑组织RNA表达水平与早期PMI的相关性


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【摘要】:目的探讨人体脑组织多种RNA指标的表达水平与早期死亡时间(PMI)的相关性。方法选取12例已知PMI(4.3~22.5 h)的个体,提取脑组织总RNA。选取8种常用RNA指标(β-actin、GAPDH、RPS29、18S rRNA、5S rRNA、U6 snRNA、miRNA-9、miRNA-125b),通过实时荧光定量PCR技术检测其在脑组织中的表达水平。运用geNorm软件筛选早期PMI表达稳定的内参指标,并分析其表达水平与相关因素(年龄、性别、死亡原因)的关系。运用R软件将内参标准化的RNA指标代入前期研究建立的数学模型推断PMI,计算推断PMI的误差率以验证模型精确性。结果 5S rRNA、miRNA-9和miRNA-125b表达稳定,其表达水平与年龄、性别、死亡原因无关。利用β-actin推断PMI的误差率为24.6%,GAPDH为41.0%。结论 5S rRNA、miRNA-9和miRNA-125b在死亡早期表达稳定,适合作为人体脑组织的内参指标。β-actin表达水平与PMI相关性良好,有望成为推测早期PMI的辅助指标。
【作者单位】: 上海健康医学院;上海市公安局物证鉴定中心法医物证学现场应用技术公安部重点实验室上海市现场物证重点实验室;复旦大学基础医学院法医学系;
【基金】:国家自然科学基金面上资助项目(81373242、81671863) 上海健康医学院种子基金项目 上海高校青年教师培养资助计划
【分类号】:D919
【正文快照】: 随着分子生物学技术的发展,运用RNA时序性降解规律推断PMI逐渐成为研究热点。国内外学者在研究中发现RNA并非想象中那样脆弱,可以通过测定某些管家基因m RNA含量变化推断PMI,如β-肌动蛋白(β-actin)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)等

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本文编号:1176834

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