模拟失重下巨噬细胞长链非编码RNA表达谱变化及生物信息学分析

发布时间：2020-12-14 12:36

　　目的探索在模拟失重下巨噬细胞RAW264.7差异表达的长链非编码RNAs（Lnc RNA）及其生物学意义。方法巨噬细胞RAW264.7随机分为对照组（C）和模拟失重组（Z）,Z组细胞回转72小时模拟失重,采用Arraystar小鼠长链非编码RNA芯片鉴别对照和模拟失重组巨噬细胞Lnc RNAs表达谱的差异。通过volcano法鉴别（差异倍数≥2.0,P≤0.05）两组间有统计学差异的Lnc RNAs,对筛选的差异表达Lnc RNAs以荧光定量PCR技术进行验证。采用GO和KEGG分析预测Lnc RNAs的潜在功能,以e Bioscience基于Luminex的多重免疫分析技术和流式细胞术检测炎症因子分泌及细胞凋亡,以Western blotting技术研究相关蛋白表达水平变化。结果Lnc RNA芯片结果显示,与对照组相比,模拟失重组有693个差异表达的Lnc RNAs,其中328个Lnc RNAs表达上调,365个Lnc RNAs表达下调的。q RT-PCR验证结果表明,Lnc RNAs ENSMUST00000137470,uc009oqw.1,uc007wem.2,NR_0... 

【文章来源】：锦州医科大学辽宁省

【文章页数】：63 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

LncRNA芯片实验、数据操作分析流程图

图 2 LncRNA Z vs C 聚类分析图4、LncRNA 散点图较模拟失重组和对照组之间的全部lncRNA表达谱的散点图(scatter红线表示lncRNA表达在任一方向上的双重差异。 散点图表明样本集中趋势。红色表示上调2倍lncRNA，绿色表示下调2倍lncRNA。获得差异上调LncRNA398个，即为图3中红色点；差异下调LncRNA3中绿色点；没有明显差异的LncRNA 21231个，即为图3中黑色点

图 3 LncRNA Z vs C 散点图RNA 火山图olcano plot)，用于比较两组样品的显著性差异。正负红色的点表示P值小于0.05，差异倍数大于2的差异基P值小于0.05，差异倍数小于-2的差异基因（探针）。LncRNA325个（图4中红色点），差异下调LncRNA有明显差异的LncRNA 21351个（图4中黑色的点）

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：2916420