ARE结构对骨骼肌损伤后mRNA表达异质性影响研究

发布时间：2020-12-18 07:28

　　目的:应用RT-qPCR技术检测大鼠骨骼肌挫伤后有ARE结构的mRNA（AREs-mRNAs）和无ARE结构的mRNA（non-AREs mRNAs）的表达量,探索有、无ARE结构mRNA表达异质性（个体间表达差异）之间的差异,以期为用于损伤时间推断指标的筛选提供帮助。方法:成年Sprague-Dewley大鼠108只,随机分为正常对照组、损伤后4h,8h,12h,16h,20h,24h,28h,32h,36h,40h,44h和48h组,重力锤自由落体制备骨骼肌损伤模型。实验共分为三组,分别为实验组（n=6）、随机抽样组（n=3）和样本增多组（n=6+2）,其中随机抽样组利用Excel中INDERECT函数从实验组每组6个样本中随机抽取3个;样本增多组是在实验组基础上对照组增加6个样本,损伤组每组增加2个样本。在前期测序结果的基础上,筛选出non-AREs mRNAs和AREs-mRNAs各五个,利用RT-qPCR技术检测其表达量,并分别计算mRNA在同一时间点内不同个体间的CV,DFA,STD,Z.SCORE。利用T检验、Fisher判别分析和随机森林分类验证有、无AREs mRNA... 

【文章来源】：山西医科大学山西省

【文章页数】：64 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
常用缩写词中英文对照表
前言
1 材料与方法
    1.1 mRNA选取
    1.2 材料与仪器
    1.3 动物模型建立及检材提取
    1.4 总RNA提取
    1.5 检测RNA纯度、浓度及完整性
    1.6 RNA反转录合成cDNA
    1.7 利用cDNA进行RT-qPCR扩增
    1.8 数据处理及统计学分析
2 结果
    2.1 选取mRNA信息
    2.2 总RNA的纯度及完整性
    2.3 内参基因及目的基因的扩增效率
    2.4 mRNAs表达量、变异系数、离均差、标准差及Z.SCORE
    2.5 实验组统计分析
    2.6 随机抽样组统计分析
    2.7 样本增多组统计分析
3 讨论
4 结论
参考文献
Review
    1 AREs Structure and Function
    2 Non-AREs mRNAs may suitable for wound age estimation
    3 Measures of heterogeneity
    4 Commonly used classification method
    References
致谢
在学期间承担/参与的科研课题与研究成果
个人简历


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于联合区间偏最小二乘判别分析的猪肉近红外光谱定性建模分析[J]. 武小红,孙俊,武斌,唐凯.  激光与光电子学进展. 2015(04)
[2]基于支持向量机的目标检测算法综述[J]. 郭明玮,赵宇宙,项俊平,张陈斌,陈宗海.  控制与决策. 2014(02)
[3]多元统计分析在高校教师教学质量管理中的应用研究[J]. 魏春梅.  高等函授学报(自然科学版). 2010(05)
[4]Fisher判别法在高校财务风险分析中的应用[J]. 钟冲.  西南交通大学学报(社会科学版). 2007(06)

硕士论文
[1]机器学习算法在医疗数据分析中的应用[D]. 叶雷.华中师范大学 2017
[2]多元统计分析在高等教育评价中的应用[D]. 耿叶萌.电子科技大学 2015
[3]决策树及神经网络算法在股票分类预测中的应用[D]. 陶雨雨.杭州电子科技大学 2014
[4]支持向量机中若干优化算法研究[D]. 邵小健.山东科技大学 2005



本文编号：2923617