应用短扩增子ASPCR技术对FFPET进行SNP基因分型的研究

发布时间：2021-09-02 17:58

　　前言福尔马林固定石蜡包埋组织（Formalin Fixed and Paraffin Embedded Tissues，FFPET）是病理学、法医病理学等学科进行疾病诊断和科学研究的常用检材，多被长时期的保存而成为一种重要的个人实物档案，为解决涉嫌保险欺诈、医疗纠纷、财产继承等民事或刑事案件提供了一种极为重要的、可靠的法医物证检材。基于CODIS系统13个STR位点的Plus和Cofiler等试剂盒，虽已广泛应用于血液、唾液、上皮组织、发根及骨组织的基因分型，但是对FFPET进行基因分型时，常因组织固定过程中各种理化因素的影响致使DNA高度降解，从而难以获得稳定、可靠的分型结果。研究表明，福尔马林固定时间、切片厚度以及不同的脱蜡方法均可影响FFPET提取DNA的质量，从而影响其基因分型。通过优化蛋白酶消化条件，精简DNA提取步骤和纯化DNA模板虽能提高DNA纯度和减少DNA额外损伤，但并不能给FFPET的基因分型带来本质的改观；通过增加循环次数或采用巢式PCR等对PCR方法进行调整与改良，可以提高扩增产物量或扩增特异性，但并未明显改善其检出率。因此，越来越多的学者将研究的重点转移到如何... 

【文章来源】：中国医科大学辽宁省

【文章页数】：42 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

FFPET提取DNA的AGE图谱

3T3AA，一T八乙M1T1A图2， rs1454361基因座扩增产物PAGE图谱T、A表示 rs1354361基因座两等位基因;l、2、3为样品号，其基因型分别为:AA，TT，TA;M为MarkerA， 1t.B图3， rs1454361基因座扩增产物测序结果A图为F瓜，(T)引物对PcR扩增产物的测序图B图为F/RZ(A)引物对PCR扩增产物的测序图(二)群体分布调查应用短扩增子ASPCR技术调查rs1454361基因座在中国辽宁地区汉族人群(152例)中多态性分布的结果:TT型为40例(26.32%)

1t.B图3， rs1454361基因座扩增产物测序结果A图为F瓜，(T)引物对PcR扩增产物的测序图B图为F/RZ(A)引物对PCR扩增产物的测序图(二)群体分布调查应用短扩增子ASPCR技术调查rs1454361基因座在中国辽宁地区汉族人群(152例)中多态性分布的结果:TT型为40例(26.32%)，TA型为71例(46.71%)，从.16.

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3379466