某医院船不同舱室微生物多样性初步研究

发布时间：2017-10-03 19:36

  本文关键词：某医院船不同舱室微生物多样性初步研究

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【摘要】：目的应用16S rDNA测序技术分析海军某医院船不同舱室细菌群落结构及其多样性,为医院船潜在感染的监测和控制提供科学依据。方法采用拭子涂抹方法在医院船的12个舱室(A~L位)共采集样本31份,采用Illumina Hiseq2500高通量测序平台PE250测序策略对样品16S r DNA扩增的V3~V4区域进行测序,并进行物种分类、丰度及多样性等生物信息分析。结果 31份样品共产生原始测序数据为1860.64 Mbp,每份样品平均产生54.86 Mbp的clean data序列,各样品检测的Tags数量平均为60 000,Unique tags序列数量均值为58 364;操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)数量181~2239。在医院船12个舱室中共检测到26个细菌门纲目等类,216个细菌科,414个细菌属。其中在各级水平分布的优势菌群分别为厚壁菌门(Firmicutes)、葡萄球菌科(Staphylococcaceae)和葡萄球菌属(Staphylococcus)。在属水平,葡萄球菌属在L位和J位分布最多,微球菌属在B位分布最多(27.15%),不动杆菌属在K位占优势(23.83%),栖水菌属则主要见于C位。12个舱室两间共有的OTU数量占检测到OTU总数的比例均22.3%,其中K位有着最高的Chao指数(4711.55)和Shannon-Wiener指数(8.58),及最高的Simpson优势度指数(0.9905)。结论医院船菌群构成复杂、多样,以革兰阳性葡萄球菌为优势菌属,并有水生环境中的菌属分布,与陆地医院常见细菌分布存在明显差异,而且各舱室细菌物种丰度及分类也存在明显不同。
【作者单位】： 海军总医院中心实验科;海军总医院科研科;海军总医院感染控制办公室;
【关键词】： 海军医学 医院船 微生物多样性 Illumina测序 S rDNA
【基金】：国家自然科学基金资助项目(31400107) 军队重点课题资助项目(BHJ14J004) 全军医药卫生科研资助项目(06Z007)
【分类号】：R821.89
【正文快照】： 医院船是海军卫勤保障的重要支援力量和海上立体救治的关键环节,承担着战时伤病员救治和平时海上突发事件卫勤支援、重大灾害人道主义救援及海上医疗救护训练等多样化军事任务[1,2]。作为海上流动的医疗救护平台,医院船既有相应级别的综合性医院的特点,又兼有平战时多样化军事

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本文编号：966335