基于网络药理学分析北刘寄奴的活性成分及其药效作用机制

发布时间：2021-10-12 06:40

　　目的:基于网络药理学研究北刘寄奴药理作用的物质基础和作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台（TCMSP）筛选北刘寄奴的化学成分、作用靶点、治疗疾病。通过蛋白数据库预测候选活性靶点相互关系,用生物信息学技术分析靶点的功能,通过基因本体（GO）功能和通路富集分析,研究北刘寄奴作用机制。结果:筛选共获得5个有效化合物（其中1个化合物没有相应的靶点）,共44个相关靶点,涉及79种疾病。PPI网络中有44个靶点,关键靶点有EGFR、CCND1等。基因功能富集结果分析共涉及12个条目,包括细胞组成5个,分子功能2个,生物过程5个。通路富集分析得到7条通路,包括乙型肝炎、PI3K-Akt信号通路、细胞凋亡等。结论:北刘寄奴中木犀草素等活性成分通过作用于PTGS1、PRSS1、NCOA2等靶点,协同参与多条通路的调节,发挥其抗炎、抗菌等作用。 

【文章来源】：中医药导报. 2020,26(10)

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

北刘寄奴化合物-靶点网络图

将从STRING数据库中所得的靶蛋白作用信息导入Cytoscape 3.6.0软件，构建靶蛋白互作网络图，用软件中的Network Analyzer进行网络拓扑分析，得到靶点蛋白相互作用的关系。在图2靶蛋白PPI网络中，共有44个节点，259条边。根据网络图中的Degree绘制排名前10的靶点蛋白的条形图，见图3。度值排名前3的是EGFR、CCND1、CASP3，分别可以与27、25、24个蛋白发生相互作用。2.4 北刘寄奴靶点-疾病网络关系图

通路富集分析，得到85条信号通路，根据FDR<0.01筛选出来7条信号通路（见表4、图5），包括前列腺癌、乙型肝炎、PI3K-Akt信号通路、军团病、细胞凋亡、胰腺癌、膀胱癌，结果表明北刘寄奴中的化合物发挥药理作用治疗疾病，要通过这几条通路来实现。其中富集基因数排名前3的有前列腺癌、乙型肝炎、PI3K-Akt信号通路，有11个基因富集在前列腺癌通路上，分别为EGFR、AR、CCND1、CASP9、RELA、GSK3B、BCL2、ERBB2、NFKBIA、MDM2、RB1；有12个基因富集在乙型肝炎上，分别为PRKCA、CASP3、IL6、CCND1、CASP9、RELA、BCL2、CASP8、PC-NA、NFKBIA、BIRC5、RB1；有13个基因富集在PI3K-Akt信号通路上分别为EGFR、PRKCA、IL6、MCL1、RELA、CCND1、CASP9、CHRM2、BCL2、GSK3B、CHRM1、VEGFA、MDM2。3 讨论

【参考文献】：
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本文编号：3432071