基于网络药理学的党参治疗慢性萎缩性胃炎的机制研究
发布时间:2021-10-12 08:41
目的运用网络药理学的方法探讨党参治疗慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)的分子作用机制。方法通过TCMSP数据库和文献挖掘获取党参的主要活性成分,利用人类基因数据库GeneCards预测和筛选党参活性成分的作用靶点。采用String数据库和Cytoscape3.7.1软件绘制蛋白相互作用网络(PPI),借助DAVID6.8数据库进行潜在基因的基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果筛选得到党参21个活性成分,涉及27个作用靶点。GO分析结果显示,党参治疗慢性萎缩性胃炎潜在基因的生物功能主要涉及影响染色体结合,蛋白质异二聚化活性,核受体活性,转录因子活性,类固醇激素受体,类固醇结合,NF-κB结合,雌激素受体,RNA聚合酶II,半胱氨酸型内肽酶等;KEGG通路富集分析结果显示,党参治疗慢性萎缩性胃炎潜在基因的通路主要涉及前列腺癌,细胞凋亡,TNF信号通路,结直肠癌,乙型肝炎,AGE-RAGE信号通路,PI3K-Akt等信号通路。结论党参治疗慢性萎缩性胃炎是多成分、多靶点、多通路的复杂过程,主要通过参与抑制炎性分子、NF-...
【文章来源】:时珍国医国药. 2020,31(04)北大核心CSCD
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
药物有效成分-靶点网络图
图1 药物有效成分-靶点网络图表2 药物-疾病交集基因具有的功能信息 ID Description Count P GO:0004879 核受体活性 5 9.03E-09 GO:0098531 转录因子活性,直接的配体调节序列特异性DNA结合 5 9.03E-09 GO:0003707 类固醇激素受体活性 5 2.07E-08 GO:0003682 染色质结合 7 4.07E-06 GO:0005496 类固醇结合 4 8.57E-06 GO:0046982 蛋白质异二聚活性 7 9.46E-06 GO:0051059 NF-κB结合 3 1.28E-05 GO:0030331 雌激素受体结合 3 3.68E-05 GO:0000978 RNA聚合酶II近端启动子序列特异性DNA结合 6 4.94E-05 GO:0000987 近端启动子序列特异性DNA结合 6 6.36E-05 GO:0004197 半胱氨酸型内肽酶活性 3 9.41E-05 GO:0051117 ATP酶结合 3 0.000243 GO:0008013 β-catenin结合 3 0.000252 GO:0001228 DNA结合转录激活剂活性,RNA聚合酶II特异性 5 0.000332 GO:0042277 肽结合 4 0.00035 GO:0035258 类固醇激素受体结合 3 0.00036 GO:0001091 RNA聚合酶II基础转录因子结合 2 0.000367 GO:0001223 转录共激活因子结合 2 0.000503 GO:0001085 RNA聚合酶II转录因子结合 3 0.000749 GO:0033218 酰胺结合 4 0.00078 GO:0031625 泛素蛋白连接酶结合 4 0.000824 GO:0070851 生长因子受体结合 3 0.000913 GO:0042805 肌动蛋白结合 2 0.000964 GO:0044389 泛素样蛋白连接酶结合 4 0.001021 GO:0004601 过氧化物酶活性 2 0.001569 GO:0035257 核激素受体结合 3 0.0016 GO:0008234 半胱氨酸型肽酶活性 3 0.001631 GO:0001221 转录辅因子结合 2 0.001654 GO:0016684 氧化还原酶活性,以过氧化物为受体 2 0.001832 GO:0050840 细胞外基质结合 2 0.002115
续表2 ID Description Count P GO:0051427 激素受体结合 3 0.002421 GO:0043621 蛋白质自缔合 2 0.003561 GO:0001098 基础转录机制结合 2 0.004077 GO:0001099 基底RNA聚合酶II转录机制结合 2 0.004077 GO:0003684 DNA结合受损 2 0.004077 GO:0030545 受体调节活性 4 0.004313 GO:0005126 细胞因子受体结合 3 0.00439 GO:0033613 激活转录因子结合 2 0.004625 GO:0002039 p53结合 2 0.004767 GO:0016209 抗氧化活性 2 0.004767 GO:1901681 硫化合物结合 3 0.005061 GO:0001618 病毒受体活性 2 0.006137 GO:0104005 被劫持的分子功能 2 0.006137 GO:0042562 激素结合 2 0.007311 GO:0042826 组蛋白脱乙酰基酶结合 2 0.0113882.6 KEGG 富集通路分析结果
【参考文献】:
期刊论文
[1]中医药治疗慢性萎缩性胃炎的研究进展[J]. 宋青,刘震,黄达. 首都医科大学学报. 2019(03)
[2]党参药理作用及临床应用研究进展[J]. 王涵,林红强,谭静,董庆海,吴福林,李平亚,刘金平. 世界最新医学信息文摘. 2019(07)
[3]补中益气汤加减治疗慢性萎缩性胃炎临床观察[J]. 赵欣,周宁. 实用中医药杂志. 2019(01)
[4]基于KEGG通路和基因网络对慢性萎缩性胃炎靶点基因的筛选[J]. 王佳慧,郑洋,王嘉孺,李卫民. 中国医药导报. 2019(02)
[5]萎缩性胃炎致病机制研究概况及中医药实验研究进展[J]. 姜小艳,李京伟,张竞超,谢伟昌,李健,郭绍举,陈绮婷,黄彬. 中国中西医结合消化杂志. 2018(12)
[6]半夏泻心汤对PLGC大鼠胃黏膜P13k/Akt/m TOR通路的影响及其防治研究[J]. 彭雪靖,刘洁. 湖南中医杂志. 2018(10)
[7]四君子汤在慢性萎缩性胃炎中的疗效观察[J]. 徐梅. 内蒙古中医药. 2017(07)
[8]健脾益胃汤治疗慢性萎缩性胃炎临床研究[J]. 熊云华. 世界中医药. 2016(10)
[9]PI3K/Akt-mTOR信号通路介导溃疡性结肠炎相关癌变的实验研究[J]. 方培植,黄会云,张涛,罗淑娟,王囡囡,卓少元. 胃肠病学和肝病学杂志. 2015(07)
[10]胃肠道癌前病变和癌前疾病研究现状[J]. 李仲启,傅汉中. 临床消化病杂志. 2015(03)
硕士论文
[1]健脾益气方对CAG大鼠成模的抑制作用及Wnt/β-catenin通路相关蛋白表达的影响[D]. 马锦霞.南京中医药大学 2018
[2]中药系统药理学数据库和分析平台的构建和应用[D]. 汝锦龙.西北农林科技大学 2015
本文编号:3432244
【文章来源】:时珍国医国药. 2020,31(04)北大核心CSCD
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
药物有效成分-靶点网络图
图1 药物有效成分-靶点网络图表2 药物-疾病交集基因具有的功能信息 ID Description Count P GO:0004879 核受体活性 5 9.03E-09 GO:0098531 转录因子活性,直接的配体调节序列特异性DNA结合 5 9.03E-09 GO:0003707 类固醇激素受体活性 5 2.07E-08 GO:0003682 染色质结合 7 4.07E-06 GO:0005496 类固醇结合 4 8.57E-06 GO:0046982 蛋白质异二聚活性 7 9.46E-06 GO:0051059 NF-κB结合 3 1.28E-05 GO:0030331 雌激素受体结合 3 3.68E-05 GO:0000978 RNA聚合酶II近端启动子序列特异性DNA结合 6 4.94E-05 GO:0000987 近端启动子序列特异性DNA结合 6 6.36E-05 GO:0004197 半胱氨酸型内肽酶活性 3 9.41E-05 GO:0051117 ATP酶结合 3 0.000243 GO:0008013 β-catenin结合 3 0.000252 GO:0001228 DNA结合转录激活剂活性,RNA聚合酶II特异性 5 0.000332 GO:0042277 肽结合 4 0.00035 GO:0035258 类固醇激素受体结合 3 0.00036 GO:0001091 RNA聚合酶II基础转录因子结合 2 0.000367 GO:0001223 转录共激活因子结合 2 0.000503 GO:0001085 RNA聚合酶II转录因子结合 3 0.000749 GO:0033218 酰胺结合 4 0.00078 GO:0031625 泛素蛋白连接酶结合 4 0.000824 GO:0070851 生长因子受体结合 3 0.000913 GO:0042805 肌动蛋白结合 2 0.000964 GO:0044389 泛素样蛋白连接酶结合 4 0.001021 GO:0004601 过氧化物酶活性 2 0.001569 GO:0035257 核激素受体结合 3 0.0016 GO:0008234 半胱氨酸型肽酶活性 3 0.001631 GO:0001221 转录辅因子结合 2 0.001654 GO:0016684 氧化还原酶活性,以过氧化物为受体 2 0.001832 GO:0050840 细胞外基质结合 2 0.002115
续表2 ID Description Count P GO:0051427 激素受体结合 3 0.002421 GO:0043621 蛋白质自缔合 2 0.003561 GO:0001098 基础转录机制结合 2 0.004077 GO:0001099 基底RNA聚合酶II转录机制结合 2 0.004077 GO:0003684 DNA结合受损 2 0.004077 GO:0030545 受体调节活性 4 0.004313 GO:0005126 细胞因子受体结合 3 0.00439 GO:0033613 激活转录因子结合 2 0.004625 GO:0002039 p53结合 2 0.004767 GO:0016209 抗氧化活性 2 0.004767 GO:1901681 硫化合物结合 3 0.005061 GO:0001618 病毒受体活性 2 0.006137 GO:0104005 被劫持的分子功能 2 0.006137 GO:0042562 激素结合 2 0.007311 GO:0042826 组蛋白脱乙酰基酶结合 2 0.0113882.6 KEGG 富集通路分析结果
【参考文献】:
期刊论文
[1]中医药治疗慢性萎缩性胃炎的研究进展[J]. 宋青,刘震,黄达. 首都医科大学学报. 2019(03)
[2]党参药理作用及临床应用研究进展[J]. 王涵,林红强,谭静,董庆海,吴福林,李平亚,刘金平. 世界最新医学信息文摘. 2019(07)
[3]补中益气汤加减治疗慢性萎缩性胃炎临床观察[J]. 赵欣,周宁. 实用中医药杂志. 2019(01)
[4]基于KEGG通路和基因网络对慢性萎缩性胃炎靶点基因的筛选[J]. 王佳慧,郑洋,王嘉孺,李卫民. 中国医药导报. 2019(02)
[5]萎缩性胃炎致病机制研究概况及中医药实验研究进展[J]. 姜小艳,李京伟,张竞超,谢伟昌,李健,郭绍举,陈绮婷,黄彬. 中国中西医结合消化杂志. 2018(12)
[6]半夏泻心汤对PLGC大鼠胃黏膜P13k/Akt/m TOR通路的影响及其防治研究[J]. 彭雪靖,刘洁. 湖南中医杂志. 2018(10)
[7]四君子汤在慢性萎缩性胃炎中的疗效观察[J]. 徐梅. 内蒙古中医药. 2017(07)
[8]健脾益胃汤治疗慢性萎缩性胃炎临床研究[J]. 熊云华. 世界中医药. 2016(10)
[9]PI3K/Akt-mTOR信号通路介导溃疡性结肠炎相关癌变的实验研究[J]. 方培植,黄会云,张涛,罗淑娟,王囡囡,卓少元. 胃肠病学和肝病学杂志. 2015(07)
[10]胃肠道癌前病变和癌前疾病研究现状[J]. 李仲启,傅汉中. 临床消化病杂志. 2015(03)
硕士论文
[1]健脾益气方对CAG大鼠成模的抑制作用及Wnt/β-catenin通路相关蛋白表达的影响[D]. 马锦霞.南京中医药大学 2018
[2]中药系统药理学数据库和分析平台的构建和应用[D]. 汝锦龙.西北农林科技大学 2015
本文编号:3432244
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