“白术-茯苓”药对治疗膝骨关节炎的“中药-成分-靶点”调控网络研究
发布时间：2021-11-20 00:40
目的:采用网络药理学和生物信息学方法探索"白术-茯苓"药对治疗膝骨关节炎（OA）的"中药-成分-靶点"调控网络和分子机制。方法:在BATMAN-TCM数据库检索白术（BAI ZHU）及茯苓（FU LING）对应的有效成分和靶点,筛选条件为score≥20且Adjusted P-value <0.05;在Gene数据库中获得膝骨关节炎对应的靶点,关键词为"Osteoarthritis";白术-茯苓对应的靶点和骨关节炎靶点的交集作为"白术-茯苓"药对干预骨关节炎的潜在作用靶点;使用DAVID数据库分析靶点的GO和KEGG信号通路富集结果;基于STRING数据库的信息分析蛋白质-蛋白质互相作用,通过Cytoscape 3.7.0软件进行PPI网络可视化构建和关键基因筛选。结果:"白术-茯苓"药对总共筛选出32个有效成分,对应548个靶点;骨关节炎对应得到626个靶点;通过映射,筛选出交集靶点为71个;中药-有效成分-靶点调控网络包含94个节点,133条边;GO功能富集结果主要涉及RNA聚合酶II启动子转录的正调控、炎症反应、转录的正调控,DNA模板、信号转导、凋亡过程的负调控等,KEG...
【文章来源】：按摩与康复医学. 2020,11(16)
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
“白术-茯苓”药对干预骨关节炎的作用靶点
通过Cytoscape软件构建中药-有效成分-靶点调控网络，得知调控网络包含94个节点，133条边。中药-有效成分-靶点调控网络包含2个中药，21个有效成分，71个作用靶点。其中白术包含4个有效成分，12个作用靶点；茯苓包含17个有效成分，66个作用靶点。见表1、图2。2.3 GO和KEGG信号通路富集结果
通过String在线数据库分析作用靶点蛋白相互网络，通过Cytoscape对PPI网络进行可视化后得知PPI蛋白互作网络包括68个节点，597条边。借助cytohubba插件中3种不同算法对PPI网络进行计算分析，得到3个核心网络，MCC算法核心网络包括10个节点，45条边；MNC算法核心网络包括10个节点，44条边；Degree算法核心网络包括10个节点，44条边。综合3种算法的前10个核心靶点，得到13个核心靶点，分别为：白介素6(Interleukin.6,.IL-6）、肿瘤坏死因子（Tumor.Necrosis.Factor,.TNF）、白介素1β（Interleukin.1.Beta,.IL-1β）、基质金属肽酶9(Matrix.Metallopeptidase.9,.MMP-9）、前列腺素内过氧化物合酶2(Prostaglandin-Endoperoxide.Synthase.2,.PTGS2）、肿瘤蛋白P53(Tumor.Protein.P53,.TP53）、转化生长因子β1(Transforming.Growth.Factor.Beta.1,.TGF-β1）、过氧化物酶体增殖物激活受体γ（Peroxisome.Proliferator.Activated.Receptor.Gamma,.PPARG）、胰岛素样生长因子1(Insulin.Like.Growth.Factor.1,.IGF-1）、内皮素1(Endothelin.1,.EDN1）、Fos原癌基因，AP-1转录因子亚基（Fos.Proto-Oncogene,.AP-1.Transcription Factor.Subunit,.FOS）、白介素4(Interleukin.4,.IL-4）、雌激素受体1(Estrogen.Receptor.1,.ESR1），见图3。3 讨论
【参考文献】：
期刊论文
[1]中药影响骨代谢分子机制研究进展[J]. 张妍,王健英,邢蕴蕴,刘锟,潘颖宜,袁颖. 中草药. 2019(20)
[2]基于NF-κB通路探讨鹿角壮骨胶囊对兔膝骨关节炎的保护作用机制[J]. 梁子聪,王恒,胡建山,陆瑞娜,胡先运. 中国老年学杂志. 2019(20)
[3]基于数据挖掘的中医药治疗骨关节炎用药规律研究[J]. 鲍丙溪,刘健,忻凌,黄旦,孙艳秋. 风湿病与关节炎. 2019(08)
[4]基于PI3K/Akt信号通路探讨电针对膝骨关节炎模型大鼠软骨细胞凋亡的影响[J]. 张媛媛,蒋昕钰,李西海,吴明霞. 康复学报. 2019(04)
[5]基于关联规则挖掘健脾类中药对骨关节炎患者免疫炎症指标的影响[J]. 周巧,刘健,忻凌,宋倩,郭锦晨,黄旦. 时珍国医国药. 2017(04)
[6]辛伐他汀对膝骨关节炎大鼠MMP-3、MMP-9、TGF-β1表达的影响及作用机制[J]. 孙乃坤,王耀宗,刘志刚,付代杰,尚希福,李旭. 中国老年学杂志. 2017(05)
[7]中药复方在病证基础上的网络药理学研究[J]. 蔡甜甜,潘华峰,王奇,方坚松,赵金媛,林钟宇,陈晓东. 中华中医药杂志. 2016(11)
[8]中药复方新药组方设计思路与方法[J]. 任钧国,刘建勋. 中国中药杂志. 2015(17)
[9]中医药在膝骨性关节炎治疗中的应用现状[J]. 周明旺,王晓萍,李盛华. 中国中医骨伤科杂志. 2015(04)
[10]中药复方物质基础研究的现状与进展[J]. 赵建荣,李晓玫. 中草药. 2003(11)
硕士论文
[1]基于中医传承辅助系统分析中药治疗膝骨关节炎的应用规律[D]. 高曼.北京中医药大学 2019
本文编号：3506214
【文章来源】：按摩与康复医学. 2020,11(16)
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
“白术-茯苓”药对干预骨关节炎的作用靶点
通过Cytoscape软件构建中药-有效成分-靶点调控网络，得知调控网络包含94个节点，133条边。中药-有效成分-靶点调控网络包含2个中药，21个有效成分，71个作用靶点。其中白术包含4个有效成分，12个作用靶点；茯苓包含17个有效成分，66个作用靶点。见表1、图2。2.3 GO和KEGG信号通路富集结果
通过String在线数据库分析作用靶点蛋白相互网络，通过Cytoscape对PPI网络进行可视化后得知PPI蛋白互作网络包括68个节点，597条边。借助cytohubba插件中3种不同算法对PPI网络进行计算分析，得到3个核心网络，MCC算法核心网络包括10个节点，45条边；MNC算法核心网络包括10个节点，44条边；Degree算法核心网络包括10个节点，44条边。综合3种算法的前10个核心靶点，得到13个核心靶点，分别为：白介素6(Interleukin.6,.IL-6）、肿瘤坏死因子（Tumor.Necrosis.Factor,.TNF）、白介素1β（Interleukin.1.Beta,.IL-1β）、基质金属肽酶9(Matrix.Metallopeptidase.9,.MMP-9）、前列腺素内过氧化物合酶2(Prostaglandin-Endoperoxide.Synthase.2,.PTGS2）、肿瘤蛋白P53(Tumor.Protein.P53,.TP53）、转化生长因子β1(Transforming.Growth.Factor.Beta.1,.TGF-β1）、过氧化物酶体增殖物激活受体γ（Peroxisome.Proliferator.Activated.Receptor.Gamma,.PPARG）、胰岛素样生长因子1(Insulin.Like.Growth.Factor.1,.IGF-1）、内皮素1(Endothelin.1,.EDN1）、Fos原癌基因，AP-1转录因子亚基（Fos.Proto-Oncogene,.AP-1.Transcription Factor.Subunit,.FOS）、白介素4(Interleukin.4,.IL-4）、雌激素受体1(Estrogen.Receptor.1,.ESR1），见图3。3 讨论
【参考文献】：
期刊论文
[1]中药影响骨代谢分子机制研究进展[J]. 张妍,王健英,邢蕴蕴,刘锟,潘颖宜,袁颖. 中草药. 2019(20)
[2]基于NF-κB通路探讨鹿角壮骨胶囊对兔膝骨关节炎的保护作用机制[J]. 梁子聪,王恒,胡建山,陆瑞娜,胡先运. 中国老年学杂志. 2019(20)
[3]基于数据挖掘的中医药治疗骨关节炎用药规律研究[J]. 鲍丙溪,刘健,忻凌,黄旦,孙艳秋. 风湿病与关节炎. 2019(08)
[4]基于PI3K/Akt信号通路探讨电针对膝骨关节炎模型大鼠软骨细胞凋亡的影响[J]. 张媛媛,蒋昕钰,李西海,吴明霞. 康复学报. 2019(04)
[5]基于关联规则挖掘健脾类中药对骨关节炎患者免疫炎症指标的影响[J]. 周巧,刘健,忻凌,宋倩,郭锦晨,黄旦. 时珍国医国药. 2017(04)
[6]辛伐他汀对膝骨关节炎大鼠MMP-3、MMP-9、TGF-β1表达的影响及作用机制[J]. 孙乃坤,王耀宗,刘志刚,付代杰,尚希福,李旭. 中国老年学杂志. 2017(05)
[7]中药复方在病证基础上的网络药理学研究[J]. 蔡甜甜,潘华峰,王奇,方坚松,赵金媛,林钟宇,陈晓东. 中华中医药杂志. 2016(11)
[8]中药复方新药组方设计思路与方法[J]. 任钧国,刘建勋. 中国中药杂志. 2015(17)
[9]中医药在膝骨性关节炎治疗中的应用现状[J]. 周明旺,王晓萍,李盛华. 中国中医骨伤科杂志. 2015(04)
[10]中药复方物质基础研究的现状与进展[J]. 赵建荣,李晓玫. 中草药. 2003(11)
硕士论文
[1]基于中医传承辅助系统分析中药治疗膝骨关节炎的应用规律[D]. 高曼.北京中医药大学 2019
本文编号：3506214
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