基于网络药理学的金莲花活性成分抗炎机制研究
发布时间：2022-01-03 17:18
目的:利用网络药理学的研究方法,探索金莲花抗炎作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台搜索金莲花活性成分及活性成分相关靶点,在Uniprot数据库进行靶点蛋白的基因校正后,利用Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分-靶点基因网络;在NCBI数据库,搜索"inflammation",得到与人类炎症相关的基因,用Cytoscape 3.7.2软件构建炎症靶点相互作用网络,将其与金莲花活性成分-靶点网络融合,获得金莲花活性成分的抗炎作用靶点。结果:中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索到金莲花口服利用度≧30%,类药性≧0.18的活性成分7个,7个活性成分作用靶点共计183个蛋白,在Uniprot数据库检索并校正得到靶点基因166个;将6个活性成分与靶点基因数据导入Cytoscape 3.7.2软件,得到自由度≥5的靶点基因3个,分别是Ptgs1、Ptgs2、Ncoa2;在NCBI网站数据库检索"inflammation",得到与人类炎症相关基因1882个;利用Cytoscape 3.7.2软件将6个活性成分的166个靶点与炎症相关1882个靶点构建金莲花-抗炎的...
【文章来源】：中医药学报. 2020,48(08)
【文章页数】：4 页
【部分图文】：
活性成分-靶点基因网络图
表2 靶点基因Ptgs1、Ptgs2、Ncoa2在网络中的具体参数信息 名称 平均最短路径长度 中心度 接近中心度 自由度 Ptgs1 1.988 235 29 0.021 515 91 0.502 958 58 5 Ptgs2 1.988 235 29 0.021 515 91 0.502 958 58 5 Ncoa2 1.964 705 88 0.043 500 38 0.508 982 04 62.3 金莲花活性成分-抗炎作用靶点网络的构建
将2.1所得6种活性化合物的166个靶点与2.2炎症的相关1 882个靶点进行映射,即两者取交集,构建金莲花-抗炎的预测靶点。即利用 Cytoscape 3.7.2软件的merge功能获得金莲花活性成分-抗炎作用靶点网络,图3。图3中金莲花活性成分与抗炎靶点的交集(去除重复)共计87个。其中,刺槐素(acacetin)抗炎靶点16个,β-谷甾醇(beta-sitosterol)抗炎靶点15个,谷甾醇(sitosterol)抗炎靶点2个,果胶蛋白(Pectolinarigenin)抗炎靶点6个,玄参黄酮(Skrofulein)抗炎靶点5个,槲皮素(quercetin)抗炎靶点80个。6种活性成分相对应的抗炎靶点个数及名称见表3。表3 6种活性成分相对应的抗炎靶点个数及名称 分子名称 个数 基因名称 acacetin 16 Ptgs1/Ar/Ptgs2/Dpp4/Prss1/Pik3Cg/Adrb2/etc. beta-sitosterol 15 Pgr/Ptgs1Ptgs2/Pik3Cg/Scn5A/Adra1A/Adra1B/etc. sitosterol 2 Pgr/Nr3C2 Pectolinarigenin 6 Scn5A/Ptgs2/Adra1B/Dpp4/Prss1/Ptgs1 Skrofulein 5 Ptgs1/Scn5A/Ptgs2/Dpp4/Prss1 quercetin 80 Ptgs1/Ar/Pparg/Ptgs2/Dpp4/Prss1/Top2A/Scn5A/etc.
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于网络药理学的金银花活性成分抗炎作用机制的研究[J]. 杜叶青,段治康,董舒卉,赵鹏,宋少江. 中国药物化学杂志. 2019(02)
[2]短瓣金莲花的研究进展[J]. 张冬青,张艳玲,董阿力德尔图,朝格图. 中成药. 2016(11)
[3]网络药理学在中药研究中的最新应用进展[J]. 李泮霖,苏薇薇. 中草药. 2016(16)
[4]槲皮素免疫学作用研究进展[J]. 蔡智谋,王晓慧,蒋冰之,杜丹,周晓青,李成文. 教育教学论坛. 2016(16)
[5]金莲花药用研究进展[J]. 石雪静,钱庄,周哲,韩淑英,吕志伟,敖杨. 亚太传统医药. 2014(17)
[6]金莲花药用研究概况[J]. 钱丽,胡金林. 海峡药学. 2014(03)
[7]中药金莲花药效组分抗炎镇痛作用研究[J]. 杨静伟,张贵君,吴明侠,杨晶凡. 中国药物评价. 2013(04)
[8]金莲花中四种主要成分的抗炎活性研究[J]. 王如峰,赓迪,吴秀稳,安燕南. 时珍国医国药. 2012(09)
[9]金莲花软胶囊治疗急性咽炎122例临床观察[J]. 郭筠芳,赵章. 湖北中医杂志. 2012(04)
[10]中药金莲花药理作用研究进展[J]. 袁勤洋,刘长利. 人民军医. 2011(09)
本文编号：3566664
【文章来源】：中医药学报. 2020,48(08)
【文章页数】：4 页
【部分图文】：
活性成分-靶点基因网络图
表2 靶点基因Ptgs1、Ptgs2、Ncoa2在网络中的具体参数信息 名称 平均最短路径长度 中心度 接近中心度 自由度 Ptgs1 1.988 235 29 0.021 515 91 0.502 958 58 5 Ptgs2 1.988 235 29 0.021 515 91 0.502 958 58 5 Ncoa2 1.964 705 88 0.043 500 38 0.508 982 04 62.3 金莲花活性成分-抗炎作用靶点网络的构建
将2.1所得6种活性化合物的166个靶点与2.2炎症的相关1 882个靶点进行映射,即两者取交集,构建金莲花-抗炎的预测靶点。即利用 Cytoscape 3.7.2软件的merge功能获得金莲花活性成分-抗炎作用靶点网络,图3。图3中金莲花活性成分与抗炎靶点的交集(去除重复)共计87个。其中,刺槐素(acacetin)抗炎靶点16个,β-谷甾醇(beta-sitosterol)抗炎靶点15个,谷甾醇(sitosterol)抗炎靶点2个,果胶蛋白(Pectolinarigenin)抗炎靶点6个,玄参黄酮(Skrofulein)抗炎靶点5个,槲皮素(quercetin)抗炎靶点80个。6种活性成分相对应的抗炎靶点个数及名称见表3。表3 6种活性成分相对应的抗炎靶点个数及名称 分子名称 个数 基因名称 acacetin 16 Ptgs1/Ar/Ptgs2/Dpp4/Prss1/Pik3Cg/Adrb2/etc. beta-sitosterol 15 Pgr/Ptgs1Ptgs2/Pik3Cg/Scn5A/Adra1A/Adra1B/etc. sitosterol 2 Pgr/Nr3C2 Pectolinarigenin 6 Scn5A/Ptgs2/Adra1B/Dpp4/Prss1/Ptgs1 Skrofulein 5 Ptgs1/Scn5A/Ptgs2/Dpp4/Prss1 quercetin 80 Ptgs1/Ar/Pparg/Ptgs2/Dpp4/Prss1/Top2A/Scn5A/etc.
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于网络药理学的金银花活性成分抗炎作用机制的研究[J]. 杜叶青,段治康,董舒卉,赵鹏,宋少江. 中国药物化学杂志. 2019(02)
[2]短瓣金莲花的研究进展[J]. 张冬青,张艳玲,董阿力德尔图,朝格图. 中成药. 2016(11)
[3]网络药理学在中药研究中的最新应用进展[J]. 李泮霖,苏薇薇. 中草药. 2016(16)
[4]槲皮素免疫学作用研究进展[J]. 蔡智谋,王晓慧,蒋冰之,杜丹,周晓青,李成文. 教育教学论坛. 2016(16)
[5]金莲花药用研究进展[J]. 石雪静,钱庄,周哲,韩淑英,吕志伟,敖杨. 亚太传统医药. 2014(17)
[6]金莲花药用研究概况[J]. 钱丽,胡金林. 海峡药学. 2014(03)
[7]中药金莲花药效组分抗炎镇痛作用研究[J]. 杨静伟,张贵君,吴明侠,杨晶凡. 中国药物评价. 2013(04)
[8]金莲花中四种主要成分的抗炎活性研究[J]. 王如峰,赓迪,吴秀稳,安燕南. 时珍国医国药. 2012(09)
[9]金莲花软胶囊治疗急性咽炎122例临床观察[J]. 郭筠芳,赵章. 湖北中医杂志. 2012(04)
[10]中药金莲花药理作用研究进展[J]. 袁勤洋,刘长利. 人民军医. 2011(09)
本文编号：3566664
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