基于网络药理学联合分子对接对逍遥散干预原发性肝癌的作用机制研究
发布时间：2022-01-23 12:32
为探索逍遥散干预原发性肝癌（HCC）的作用机制。运用网络药理学的方法,通过中药系统药理学技术平台（TCMSP）网站检索逍遥散的主要活性成分及对应的作用靶点,再利用GEO数据库筛选并分析原发性肝癌的差异基因,采用Cytoscape3.7.2软件构建活性成分—靶点网络图,利用Biso Genet插件分析筛选得出PPI蛋白互作网络和PPI网络的关键节点,然后运用生物信息学的方法对关键靶点进行基因功能分析和通路富集分析。最后使用分子对接技术对化合物核心成分与关键靶点进行对接验证。通过分析得到逍遥散作用于HCC的交集基因27个,GO富集显示逍遥散的生物功能主要设涉及无机物质细胞反应、趋化因子活动、细胞周期性蛋白依赖复合物等方面;KEGG通路富集显示逍遥散影响的通路主要有细胞衰老信号通路、甾类激素生物合成信号通路、p53信号通路等。分子对接结果显示逍遥散核心成分与HCC关键靶点亲和力良好。综上逍遥散改善HCC存在多成分、多靶点和多重药理作用,为进一步研究治疗HCC提供了线索。
【文章来源】：天然产物研究与开发. 2020,32(08)北大核心CSCD
【文章页数】：14 页
【部分图文】：
HCC差异基因火山图
27个逍遥散—HCC交集基因影响了271个生物学过程,选取P值排名20的功能信息,图5～7。图表显示逍遥散活性成分主要富集在无机物质细胞反应、细胞激素代谢过程金属离子反应、类固醇分解过程、伯醇代谢过程等生物过程中,在分子功能方面,主要涉及趋化因子活动、氧化还原酶活性、趋化因子受体结合等,细胞组成主要影响细胞周期蛋白复合物、蛋白激酶全酶复合物、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶复合物等。表1 逍遥散干预HCC的有效分子成分Table 1 The effective molecular components of Xiaoyaosan in the intervention of HCC Mol Drug Mol Drug MOL005016 Gancao MOL004835 Gancao MOL004913 Gancao MOL005020 Gancao MOL004653 Chaihu MOL004898 Gancao MOL013187 Chaihu MOL004814 Gancao MOL000296 Fuling MOL000449 multiDrug MOL004915 Gancao MOL000275 Fuling MOL004949 Gancao MOL004810 Gancao MOL004838 Gancao MOL004959 Gancao MOL004912 Gancao MOL004990 Gancao MOL000098 multiDrug MOL005003 Gancao MOL004829 Gancao MOL000279 Fuling MOL000359 multiDrug MOL004948 Gancao MOL004941 Gancao MOL004966 Gancao MOL005012 Gancao MOL000492 Baishao MOL002311 Gancao MOL000049 Baizhu MOL004808 Gancao MOL004827 Gancao MOL004904 Gancao MOL004855 Gancao
Symbol Uniprot ID Protein names Degree Betweenness CUL2 Q13617 Cullin-2,CUL-2 134 249.05 CUL3 Q13618 Cullin-3,CUL-3 282 848.13 CTNNB1 P35222 Catenin beta-1 136 327.95 CAND1 Q86VP6 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 176 297.83 CUL1 Q13616 Cullin-1,CUL-1 214 533.84 CDC5L Q99459 Cell division cycle 5-like protein 158 266.87 CDK1 P11440 Cyclin-dependent kinase 1 281 354.28图5 GO富集功能分析柱状图(CC富集结果)
【参考文献】：
期刊论文
[1]TNF-α对肝癌细胞NF-κB信号通路活化的影响及临床意义[J]. 朱倩,卢贵余,桂芬芳,罗子华,吴京华,黎发明,倪勇. 河北医药. 2018(24)
[2]槲皮素对缺氧人肝癌细胞HepG2增殖及HIF-1α、VEGF的影响[J]. 韦艳,陆艳玲,王荣荣,冯胜进,梁钢. 武警医学. 2018(02)
[3]基于网络药理学研究淫羊藿抗骨质疏松的分子机制[J]. 李刚,许波,梁学振,盖帅帅,夏聪敏,阎博昭,李嘉程. 中国药理学通报. 2018(02)
[4]P53调控细胞凋亡在肝细胞癌治疗中的作用[J]. 高斯,赵相轩,卢再鸣. 临床肝胆病杂志. 2017(07)
[5]β-谷甾醇对H22荷瘤小鼠体内抗肿瘤作用[J]. 林明珠,赵岩,蔡恩博,祝洪艳,郜玉钢,何忠梅,杨鹤,刘双利,张连学. 中国公共卫生. 2017(12)
[6]华蟾素注射液联合化疗治疗中晚期肺癌临床研究[J]. 李新权,鲍英春,张洪玉. 现代肿瘤医学. 2009(01)
本文编号：3604355
【文章来源】：天然产物研究与开发. 2020,32(08)北大核心CSCD
【文章页数】：14 页
【部分图文】：
HCC差异基因火山图
27个逍遥散—HCC交集基因影响了271个生物学过程,选取P值排名20的功能信息,图5～7。图表显示逍遥散活性成分主要富集在无机物质细胞反应、细胞激素代谢过程金属离子反应、类固醇分解过程、伯醇代谢过程等生物过程中,在分子功能方面,主要涉及趋化因子活动、氧化还原酶活性、趋化因子受体结合等,细胞组成主要影响细胞周期蛋白复合物、蛋白激酶全酶复合物、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶复合物等。表1 逍遥散干预HCC的有效分子成分Table 1 The effective molecular components of Xiaoyaosan in the intervention of HCC Mol Drug Mol Drug MOL005016 Gancao MOL004835 Gancao MOL004913 Gancao MOL005020 Gancao MOL004653 Chaihu MOL004898 Gancao MOL013187 Chaihu MOL004814 Gancao MOL000296 Fuling MOL000449 multiDrug MOL004915 Gancao MOL000275 Fuling MOL004949 Gancao MOL004810 Gancao MOL004838 Gancao MOL004959 Gancao MOL004912 Gancao MOL004990 Gancao MOL000098 multiDrug MOL005003 Gancao MOL004829 Gancao MOL000279 Fuling MOL000359 multiDrug MOL004948 Gancao MOL004941 Gancao MOL004966 Gancao MOL005012 Gancao MOL000492 Baishao MOL002311 Gancao MOL000049 Baizhu MOL004808 Gancao MOL004827 Gancao MOL004904 Gancao MOL004855 Gancao
Symbol Uniprot ID Protein names Degree Betweenness CUL2 Q13617 Cullin-2,CUL-2 134 249.05 CUL3 Q13618 Cullin-3,CUL-3 282 848.13 CTNNB1 P35222 Catenin beta-1 136 327.95 CAND1 Q86VP6 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 176 297.83 CUL1 Q13616 Cullin-1,CUL-1 214 533.84 CDC5L Q99459 Cell division cycle 5-like protein 158 266.87 CDK1 P11440 Cyclin-dependent kinase 1 281 354.28图5 GO富集功能分析柱状图(CC富集结果)
【参考文献】：
期刊论文
[1]TNF-α对肝癌细胞NF-κB信号通路活化的影响及临床意义[J]. 朱倩,卢贵余,桂芬芳,罗子华,吴京华,黎发明,倪勇. 河北医药. 2018(24)
[2]槲皮素对缺氧人肝癌细胞HepG2增殖及HIF-1α、VEGF的影响[J]. 韦艳,陆艳玲,王荣荣,冯胜进,梁钢. 武警医学. 2018(02)
[3]基于网络药理学研究淫羊藿抗骨质疏松的分子机制[J]. 李刚,许波,梁学振,盖帅帅,夏聪敏,阎博昭,李嘉程. 中国药理学通报. 2018(02)
[4]P53调控细胞凋亡在肝细胞癌治疗中的作用[J]. 高斯,赵相轩,卢再鸣. 临床肝胆病杂志. 2017(07)
[5]β-谷甾醇对H22荷瘤小鼠体内抗肿瘤作用[J]. 林明珠,赵岩,蔡恩博,祝洪艳,郜玉钢,何忠梅,杨鹤,刘双利,张连学. 中国公共卫生. 2017(12)
[6]华蟾素注射液联合化疗治疗中晚期肺癌临床研究[J]. 李新权,鲍英春,张洪玉. 现代肿瘤医学. 2009(01)
本文编号：3604355
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/zhongyaolw/3604355.html
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