基于网络药理学探讨参芪扶正注射液治疗原发性肝癌的作用网络与机制预测
发布时间:2022-02-16 11:41
目的采用网络药理学阐明参芪扶正注射液多成分、多靶点、多途径的作用特点,进一步研究肝癌治疗可能药效的物质基础及作用机制。方法采用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)数据库,分别检索并收集黄芪与党参的活性成分及其对应的靶标。通过在线人类孟德尔网(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)和人类基因组注释数据库(Genecard)收集与肝癌相关的靶标,并与药物成分所对应的靶标相比较筛选出相同部分,即获得黄芪-党参与肝癌重合的潜在靶基因。可视化Cytoscape 3.6.1软件建立对药物与疾病靶点相映射得到参芪扶正注射液治疗原发性肝癌的作用靶点,运用STRING软件构建"化合物-靶点"作用网络与蛋白质相互作用网络,筛选发挥治疗作用的关键成分与关键靶点,对关键靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和pathway富集分析获知其潜在作用机制。结果共筛选出参芪扶正注射液35个候选...
【文章来源】:中华肿瘤防治杂志. 2020,27(17)北大核心
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
肝癌靶点基因与参芪扶正注射液治疗靶点匹配基因
党参-黄芪药物、活性成分与肝癌关键作用靶点网络
将党参-黄芪治疗原发性肝癌的72个潜在的关键靶点基因导入String数据库平台,选择物种为人类,获取蛋白质相互作用关系,采用该平台绘制蛋白关系网络(图3)。排除游离的(无相互作用蛋白),该网络图共包括31个节点,118个边。用节点的大小和颜色表示Degree值的大小,节点越大对应的Degree值越大,颜色由红变蓝对应的Degree值越大;用边的粗细表示Combine score值的大小,边越粗Combine score值越大。根据Degree≥10的节点制作出前7个关键蛋白质节点(图4),分别为JUN、RELA、MAPK1、丝裂原活化蛋白激酶14(mitogen-activated protein kinase 14,MAPK14)、AKT1、ESRI和RB1。这些靶点基因在治疗肝癌治疗中具有重要意义,可作为参芪扶正注射液有效成分作用的靶点基因。2.5 关键靶点基因生物功能及通路分析
【参考文献】:
期刊论文
[1]TPX2通过PI3K/Akt信号通路调控肝癌细胞增殖及凋亡[J]. 黄丹红,吴建兵,简捷,张岩,刘利珍. 肿瘤. 2019(11)
[2]MAPK14与胃癌放疗抵抗机制实验研究[J]. 杨甜,吴八路,江宏强,覃桂珍,魏永长. 中华肿瘤防治杂志. 2019(21)
[3]槲皮素抑制人肝癌细胞HepG2的体内外活性研究[J]. 周孟,廖祥明,王珊,巩仔鹏,张荣红. 安徽医药. 2019(11)
[4]胶质瘤中MKK7与c-Jun磷酸化的表达及其相关性[J]. 郅程,赖妙玲,廖德贵,郝卓芳,王业忠,吴力强,刘锶锶,曾淑莲,黄紫燕,陈丹敏,袁忠民. 肿瘤防治研究. 2019(09)
[5]异鼠李素与索拉非尼联合对肾癌的抑制作用及作用机制[J]. 杜倩倩,黄璐璐,刘春霞,唐梅,闫辰,李燕. 药学学报. 2019(08)
[6]miRNA-350靶向MAPK14及JNK调控H9c2细胞增殖和凋亡[J]. 张淑华,洪浪,王云霞,吴志婷,刘秋玲,葛郁芝. 中国老年学杂志. 2018(18)
[7]RelA/p65的磷酸化调节及其与肿瘤的关系[J]. 李丽,陈玉婷,曾希. 中南医学科学杂志. 2018(02)
[8]敲低AKT1基因增强裸鼠胃癌移植瘤对阿霉素的敏感性[J]. 周巍,付雪琼,于红刚. 细胞与分子免疫学杂志. 2017(10)
[9]ESR1基因突变与乳腺癌内分泌治疗耐药的相关性[J]. 杨雅岚,王佳玉,曾益新. 中华乳腺病杂志(电子版). 2017(03)
[10]芒柄花素抑制乳腺癌细胞HIF-1α/CXCR4信号以及细胞增殖和迁移[J]. 葛新,李林,王芳,郭广成,李靖若,谷元廷. 河南医学研究. 2016(09)
本文编号:3627900
【文章来源】:中华肿瘤防治杂志. 2020,27(17)北大核心
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
肝癌靶点基因与参芪扶正注射液治疗靶点匹配基因
党参-黄芪药物、活性成分与肝癌关键作用靶点网络
将党参-黄芪治疗原发性肝癌的72个潜在的关键靶点基因导入String数据库平台,选择物种为人类,获取蛋白质相互作用关系,采用该平台绘制蛋白关系网络(图3)。排除游离的(无相互作用蛋白),该网络图共包括31个节点,118个边。用节点的大小和颜色表示Degree值的大小,节点越大对应的Degree值越大,颜色由红变蓝对应的Degree值越大;用边的粗细表示Combine score值的大小,边越粗Combine score值越大。根据Degree≥10的节点制作出前7个关键蛋白质节点(图4),分别为JUN、RELA、MAPK1、丝裂原活化蛋白激酶14(mitogen-activated protein kinase 14,MAPK14)、AKT1、ESRI和RB1。这些靶点基因在治疗肝癌治疗中具有重要意义,可作为参芪扶正注射液有效成分作用的靶点基因。2.5 关键靶点基因生物功能及通路分析
【参考文献】:
期刊论文
[1]TPX2通过PI3K/Akt信号通路调控肝癌细胞增殖及凋亡[J]. 黄丹红,吴建兵,简捷,张岩,刘利珍. 肿瘤. 2019(11)
[2]MAPK14与胃癌放疗抵抗机制实验研究[J]. 杨甜,吴八路,江宏强,覃桂珍,魏永长. 中华肿瘤防治杂志. 2019(21)
[3]槲皮素抑制人肝癌细胞HepG2的体内外活性研究[J]. 周孟,廖祥明,王珊,巩仔鹏,张荣红. 安徽医药. 2019(11)
[4]胶质瘤中MKK7与c-Jun磷酸化的表达及其相关性[J]. 郅程,赖妙玲,廖德贵,郝卓芳,王业忠,吴力强,刘锶锶,曾淑莲,黄紫燕,陈丹敏,袁忠民. 肿瘤防治研究. 2019(09)
[5]异鼠李素与索拉非尼联合对肾癌的抑制作用及作用机制[J]. 杜倩倩,黄璐璐,刘春霞,唐梅,闫辰,李燕. 药学学报. 2019(08)
[6]miRNA-350靶向MAPK14及JNK调控H9c2细胞增殖和凋亡[J]. 张淑华,洪浪,王云霞,吴志婷,刘秋玲,葛郁芝. 中国老年学杂志. 2018(18)
[7]RelA/p65的磷酸化调节及其与肿瘤的关系[J]. 李丽,陈玉婷,曾希. 中南医学科学杂志. 2018(02)
[8]敲低AKT1基因增强裸鼠胃癌移植瘤对阿霉素的敏感性[J]. 周巍,付雪琼,于红刚. 细胞与分子免疫学杂志. 2017(10)
[9]ESR1基因突变与乳腺癌内分泌治疗耐药的相关性[J]. 杨雅岚,王佳玉,曾益新. 中华乳腺病杂志(电子版). 2017(03)
[10]芒柄花素抑制乳腺癌细胞HIF-1α/CXCR4信号以及细胞增殖和迁移[J]. 葛新,李林,王芳,郭广成,李靖若,谷元廷. 河南医学研究. 2016(09)
本文编号:3627900
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