山西不同产地酸枣仁的ITS序列比较研究

发布时间：2022-06-02 22:54

　　目的:通过分析山西不同产地酸枣仁核糖体基因内部转录间隔区序列,为酸枣仁药材鉴定提供DNA分子标记方法。方法:采用植物基因组DNA快速提取试剂盒的方法,提取22个不同产地酸枣仁药材中的总DNA,以通用引物采用PCR扩增rDNA-ITS序列并测序。采用contig分析软件进行序列拼接、CLUSTAL X软件进行序列比对,再使用MEGA 7.0软件进行遗传分析并构建系统发育树。结果:种内变异位点分析共获得22条ITS序列,11个单倍型,根据单倍型的数目,单倍型1、单倍型2、单倍型3为酸枣仁的核心单倍型,占所有条带的60.87%。种间序列分析NJ树分为两大支,正品酸枣仁与伪品枳椇子各一支,聚类分析可以对酸枣仁及其伪品ITS序列差异进行识别。结论:rDNA-ITS序列可用于对山西不同产地酸枣仁的分析,是酸枣仁药材分子鉴定的有效方法之一。 

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
材料
    1. 仪器
    2. 试剂
方法
    1.DNA提取
    2. DNA浓度检测
    3. PCR扩增
        3.1 引物
        3.2 反应体系
        3.3 PCR反应体系条件考察
            3.3.1 退火温度的考察：实验随机选用样品T1和J2，设置温
            3.3.2 DNA模板浓度考察：实验选用样品T1和J2考察PCR
        3.4 循环参数
    4. 电泳
    5. PCR产物测序
        5.1 种内变异位点分
        5.2 种间序列分析
结果与序列分析
讨论


【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3653239