基于网络药理学探讨真武汤治疗慢性心力衰竭的作用机制
发布时间:2023-04-02 06:42
目的基于网络药理学探讨真武汤治疗慢性心力衰竭(chronic heart failure,CHF)的作用机制。方法通过中药网络药理学分析平台(TCMSP)获取真武汤中候选化合物,利用SwissTargetPrediction平台进行候选靶标预测,并将TCMSP中相应化合物的靶点作为补充,利用Uniprot数据库将靶点蛋白转化成基因名;通过CTD和TTD数据库获取CHF的相关基因,将真武汤靶标(基因)与CHF相关基因取交集作为真武汤治疗CHF的潜在靶标,将交集基因提交至STRING11.0在线数据库进行蛋白互做分析,并借助网络可视化软件Cytoscape3.7.1绘制蛋白相互作用网络图,利用Excel构建真武汤中药-潜在化合物-潜在靶标网络,并利用Cytoscape 3.7.1进行可视化;通过RStudio的clusterProfiler包进行通路富集分析;利用分子对接技术对关键靶点和化合物的相互作用进行验证。结果通过设置OB和DL值筛选得到真武汤化合物59种,在获得交集基因36个后,剔除不含交集基因(靶标)的化学成分,最终筛得化合物49种,KEGG富集分析共获得36条,其中13条与CH...
【文章页数】:11 页
【文章目录】:
1 资料与方法
1.1 真武汤活性化学成分筛选
1.2 活性成分靶点预测
1.3 CHF相关基因的获取
1.4 可视化网络构建
1.5 KEGG通路富集分析
1.6 关键活性成分与关键靶点的分子对接验证
2 结果
2.1 中药候选化合物筛选结果
2.2 候选化合物靶标预测
2.3 CHF相关基因收集
2.4 可视化网络构建
2.4.1 真武汤HB-pC-pT网络的构建
2.4.2 CHF相关基因PPI网络
2.5 KEGG通路富集结果
2.6 分子对接结果
3 讨论
本文编号:3778755
【文章页数】:11 页
【文章目录】:
1 资料与方法
1.1 真武汤活性化学成分筛选
1.2 活性成分靶点预测
1.3 CHF相关基因的获取
1.4 可视化网络构建
1.5 KEGG通路富集分析
1.6 关键活性成分与关键靶点的分子对接验证
2 结果
2.1 中药候选化合物筛选结果
2.2 候选化合物靶标预测
2.3 CHF相关基因收集
2.4 可视化网络构建
2.4.1 真武汤HB-pC-pT网络的构建
2.4.2 CHF相关基因PPI网络
2.5 KEGG通路富集结果
2.6 分子对接结果
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本文编号:3778755
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