基于网络药理学分析五味消毒饮治疗关节假体周围感染的作用机制

发布时间：2024-03-09 13:37

　　背景:五味消毒饮在临床中已被用于治疗关节假体周围感染,但因五味消毒饮所含有效成分复杂,其分子作用机制尚不明确。目的:探究五味消毒饮治疗关节假体周围感染的作用机制。方法:通过中药系统药理学成分分析数据库(BATMAN-TCM)预测获得五味消毒饮的有效化合物及靶点基因,利用Gene Cards和OMIM数据库获得关节假体周围感染疾病的相关靶点基因,取两者交集后得到五味消毒饮-关节假体周围感染疾病交集基因。随后采用STRING在线数据库构建蛋白相互作用网络(PPI),根据度值筛选核心基因。将交集基因输入Cytoscape3.7.2软件以构建WWXDY-靶点-关节假体周围感染可视化网络图,并借助DAVID在线工具进行交集靶点的基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,探讨其抗关节假体周围感染的作用机制。结果与结论:①从BATMAN-TCM平台共预测出五味消毒饮的有效化合物37个,作用靶点共914个;从Gene Cards和OMIM数据库筛选出关节假体周围感染疾病的相关靶点基因286个;取交集获得药物与疾病交集靶点39个,经筛选得到核心基因16个;②GO分析结果显...

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【部分图文】：

图1五味消毒饮和关节假体周围感染疾病的交集靶点基因图

通过BATMAN-TCM平台检索总共预测到五味消毒饮的有效化合物37个，其中金银花24个，蒲公英6个，野菊花7个，紫花地丁1个，紫背天葵子1个。随后获得其作用靶点共914个，通过GeneCards和OMIM数据库共筛选获得PJI的疾病靶点共286个。取两者靶点的交集，最终获得WW....

图2交集基因的蛋白相互作用网络图(PPI网络)

利用STRING在线数据库构建了交集靶点基因蛋白相互作用网络，结果见图2。蛋白相互作用网络包含39个蛋白质节点，277条相互作用关系，即节点间的连接线，其中2个蛋白质节点无相互作用关系(已剔除)，平均度值(degree)为14.2，平均局部聚类系数(avg.localclust....

图3核心靶点基因

采用Cytoscape3.7.2软件构建的WWXDY-靶点-PJI疾病可视化调控网络见图4，图中清晰可见五味消毒饮中5味中药与有效化合物、有效化合物与交集靶点基因、靶点基因与PJI疾病之间分别的对应关系。靶点所连接的化合物越多，说明度值越大，该靶点就越重要。网络中，左边四边形3....

图4WWXDY-靶点-关节假体周围感染疾病可视化调控网络

图3核心靶点基因2.4交集基因的GO富集分析结果

本文编号：3923496