VGLL4和NOTCH4基因单核苷酸多态性与肺癌易感性的研究
本文关键词:VGLL4和NOTCH4基因单核苷酸多态性与肺癌易感性的研究
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【摘要】:中科院上海生命科学研究院近期在国际学术期刊Cell Research刊发了一项最新研究成果[7],他们发现了导致肺癌发生的新抑癌基因VGLL4基因。研究表明,VGLL4异常表达与肺癌、肝癌等多种癌症的发生发展相关,VGLL4基因表达下调是导致肿瘤发生的可能原因,但是对于其下调的机理还未见有报道,而外显子的突变可以直接导致蛋白的变化或蛋白结构的改变,从而导致蛋白的功能改变。据此我们选取了该基因编码区的同义突变位点rs1803489(A/G,Gln/Gln)和错义突变位点rs2276749(C/T,Met/Ile)两个SNP位点进行分析研究:同时,在肿瘤的发生和发展过程中,Notch信号扮演着重要的角色,单一的Notch信号的紊乱可能直接引发肿瘤的发生和发展,而通路的异常可由于基因突变导致的蛋白表达变化而引起。因此,我们选取了位于NOTCH4基因外显子区的同义突变位点rs3134942(A/C,Val/Val)作为研究对象。为了研究两个基因的三个位点与肺癌易感性的关系,我们选取了375例肺癌患者外周血作为研究对象,和380例健康人群外周血作为正常对照组。首先我们根据不同的位点设计不同的引物,然后通过PCR扩增和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,选取电泳条带清晰、单一无杂带的退火温度进行高分辨率熔解曲线(High Resolution Melting,HRM)上机实验。然后利用Roche480 Lightcycler Software对高分辨率熔解曲线进行分析,根据曲线形成的形状和颜色对样本进行分型,最后通过统计学分析这三个多态位点与肺癌易感性的关联性。研究结果表明:(1)研究对象基本资料比较结果显示,在375例肺癌病例和380例对照样本中:肺癌病例与正常对照在年龄、吸烟与饮酒状况存在差异(p值均0.05),而性别没有显著差异(p=0.825),说明肺癌的发生是多因素诱导的结果。VGLL4基因的两个多态位点基因型分布显示:在超显性遗传模型下,同义突变rs1803489多态性位点与肺癌易感性具有显著显著相关性,其中GA基因型会提高其个体的肺癌发病风险(Adjusted OR=1.42,95%CI:1.00-2.00,p=0.048),是GG基因型携带者肺癌发生风险的1.42倍。基于上述遗传模型,我们对其进行了分层分析,结果显示:小于60岁的人群中该位点GA基因型与肺癌有着显著的相关性(Adjusted OR=1.96,95%CI:1.23-3.14,p=0.005)。我们的研究结果提示错义突变位点rs2276749与肺癌易感性无显著相关性。(2)NOTCH4基因外显子上的rs3134942多态位点与肺癌易感性无显著相关性,但是在针对该位点的分层分析中发现,非饮酒人群中CA基因型在共显性模型中与肺癌易感性有着显著的相关性,并能够降低肺癌易感的风险(p=0.046),但是在校正后显著性消失。
【关键词】:VGLL4 NOTCH4 多态性 肿瘤易感性
【学位授予单位】:苏州大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R734.2
【目录】:
- 中文摘要4-6
- Abstract6-9
- 一、引言9-16
- 二、材料与方法16-23
- 三、实验结果23-30
- 四、讨论30-33
- 参考文献33-37
- 附录37-38
- 攻读学位期间取得的研究成果38-39
- 致谢39-40
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本文编号:1115008
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