淮安地区食管鳞状细胞癌中Hsa-miRNA-133a表达的研究
本文关键词:淮安地区食管鳞状细胞癌中Hsa-miRNA-133a表达的研究
更多相关文章: 食管鳞状细胞癌(ESCC) miRNA-133a VEGFA 生物信息学
【摘要】:目的:探讨江苏淮安地区食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)中miRNA-133a的表达特征并对其生物信息学进行分析研究。方法:采用Microarray流体芯片技术及荧光定量聚合酶链反应(quantitatie realtime Polymerase Chain Reaction,qPCR)技术检测食管鳞状细胞癌(ESCC)癌组织及癌旁组织中miRNA-133a表达;通过miRBase、NCBI、UCSC Browser等在线工具分析,iRNA-133a序列特征;应用niRanda、TargetScan预测miRNA-133a的靶基因,并结合已证实的靶标基因,进行功能富集分析(Gene Ontology)和信号通路富集分析(Pathway Enrichment),并采用Western Blot技术检测miRNA-133a过表达/沉默后ESCC细胞中靶基因蛋白表达水平。结果:1.流体芯片技术及qRT-PCR技术检测的结果均表明:淮安地区食管鳞状细胞癌(ESCC)癌组织中miRNA-133a表达水平显著低于癌旁组织(P0.05);2.伴淋巴结转移组食管鳞状细胞癌(ESCC)的miRNA-133a表达水平低于无淋巴结转移组(P0.05);3.食管鳞癌细胞株(KYSE-150、ECA109)中niRNA-133a的表达比正常食管上皮细胞株Het-1A显著降低(P0.05),但食管鳞癌细胞株高分化和低分化组间无统计学差异(P0.05):4miRNA-133a在各物种之间具有高度保守性,其靶基因功能分别富集于蛋白质修饰、细胞增殖及凋亡等生物学过程(P0.001),涉及肿瘤、细胞凋亡等信号通路(P0.05);5.参与肿瘤转移相关的基因血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)可能为miRNA-133a的靶基因。结论:1.淮安地区食管鳞状细胞癌(ESCC)癌组织中hsa-miRNA-133a表达水平显著低于癌旁组织;2.伴淋巴结转移的食管鳞状细胞癌(ESCC)中hsa-miRNA-133a表达低于无淋巴结转移食管鳞状细胞癌(ESCC),hsa-miRNA-133a可能与肿瘤的转移相关;3. miRNA-133a可能通过与VEGFA基因相互作用参与肿瘤转移的发生。
【关键词】:食管鳞状细胞癌(ESCC) miRNA-133a VEGFA 生物信息学
【学位授予单位】:东南大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R735.1
【目录】:
- 中文摘要4-6
- 英文摘要6-9
- 缩略词表9-11
- 前言11-13
- 文献综述13-17
- 资料和方法17-26
- 实验结果26-34
- 讨论34-37
- 结论37-38
- 参考文献38-43
- 附录(该文已发表于《山东医药》杂志)43-50
- 附录(读硕士期间发表论文)50-51
- 致谢51
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