MAPK通路基因多态性与甲状腺乳头状癌关系的遗传流行病学研究

发布时间：2018-03-15 05:35

本文选题：MAPK信号转导通路　切入点：基因多态性　出处：《吉林大学》2016年博士论文　论文类型：学位论文

【摘要】：甲状腺癌是临床上常见的内分泌系统恶性肿瘤,以甲状腺乳头状癌居多。甲状腺癌多于青壮年发病,40-60为发病高峰年龄,男女患者数量存在1:3的比例。研究表明,甲状腺癌的发病率呈逐年上升趋势。目前,尚不完全明确甲状腺癌的发病机制。随着分子生物技术的发展,已证明某些基因的多态性有可能与甲状腺癌相关。MAPK信号转导通路,含有苏氨酸/丝氨酸蛋白激酶,能将细胞外信号向内转导至细胞核内。随后通过保守的MAPKKK-MAPKK-MAPK三级级联反应激活转录因子,进而调节基因的表达。MAPK通路影响多种细胞功能,可参与细胞的多种生理过程,如运动、凋亡、分化及生长增殖等。其中,KRAS基因、NRAS基因、HRAS基因、ALK基因、MET基因和VEGFA基因在MAPK通路中起重要作用。目的:探讨MAPK信号转导通路中的KRAS基因、NRAS基因、HRAS基因、ALK基因、MET基因和VEGFA基因的多态性与甲状腺乳头状癌之间的关系,为甲状腺癌的病因研究提供科学依据。方法:采用病例-对照的研究方法,病例组选取860例甲状腺乳头状癌患者(甲状腺乳头状癌组)和420例结节性甲状腺肿患者(结节性甲状腺肿组),健康对照组选取896例无甲状腺相关疾病的健康人。上述各组研究对象的年龄、性别均已匹配。分别采集各组研究对象的外周血液样本,提取基因组的DNA。应用MALDI-TOF-MS技术检测候选位点的基因型。数据整理录入使用Epidata3.1,统计学分析使用SPSS19.0、SNPStats、Haploview4.2和UNPHASE等软件。结果:1本研究选取MAPK通路上KRAS、HRAS、NRAS、ALK、MET和VEGFA基因为候选基因,使用Hap Map和NCBI-db SNP数据库,利用Haploview 4.2软件,筛选上述每个候选基因上的tag SNPs。共筛选出13个tag SNPs,分别为KRAS基因的rs712、rs7315339、rs12427141,HRAS基因的rs12628,NRAS基因的rs2273267、rs14804,ALK基因的rs1881421,MET基因的rs1621、rs6566和VEGFA基因的rs3024997、rs3025040、rs25648、rs10434位点。2在甲状腺乳头状癌组、结节性甲状腺肿组和健康对照组中分别做各位点的Hardy-Weinberg平衡。除了rs7315339在甲状腺乳头状癌组,rs712、rs12427141、rs1881421在健康对照组,rs3024997在结节性甲状腺肿组和健康对照组中不符合H-W平衡定律(P0.01)外,其它各位点在各组中均符合H-W平衡定律。3与甲状腺乳头状癌相关的基因型(P0.05)包括:MET基因rs1621的GA基因型(ORGA/AA=1.346,95%CI=1.064-1.703),rs6566的GG基因型(ORGG/AA=1.391,95%CI=1.063-1.822);KRAS基因rs712的GT基因型(ORGT/GG=1.334,95%CI=1.084-1.641),rs12427141的AA基因型(ORAA/GG=3.685,95%CI=1.352-10.047)。按性别分层分析结果表明,与女性甲状腺乳头状癌患者相关(P0.05)的基因型包括:KRAS基因rs712的GT基因型(ORGT/GG=1.436,95%CI=1.132-1.821),rs12427141的AA基因型(ORAA/GG=3.280,95%CI=1.183-9.095),ALK基因rs1881421的GC基因型(ORGC/GG=0.727,95%CI=0.580-0.911),VEGFA基因rs3025040的CC基因型(ORCC/TT=2.019,95%CI=1.068-3.819),rs25648的CT基因型(ORCT/CC=1.540,95%CI=1.082-2.190)。与结节性甲状腺肿相关的基因型(P0.05)包括:VEGFA基因rs3024997的AG基因型(ORAG/GG=0.628,95%CI=0.478-0.825)。按性别分层分析结果表明,与女性结节性甲状腺肿患者显著相关(P0.05)的基因型包括:VEGFA基因rs3024997的AG基因型(ORAG/GG=0.618,95%CI=0.449-0.851)。4与甲状腺乳头状癌相关的等位基因(P0.05)包括:KRAS基因rs12427141位点G→A突变危险性增加(ORA/G=1.222,95%CI=1.004-1.487),MET基因rs6566位点A→G突变危险性增加(ORG/A=1.177,95%CI=1.031-1.344)。按性别分层分析结果表明,与女性甲状腺乳头状癌患者显著相关(P0.05)的等位基因包括:KRAS基因rs712位点G→T突变危险性增加(ORT/G=1.254,95%CI=1.040-1.513),rs12427141位点G→A突变危险性增加(ORA/G=1.272,95%CI=1.017-1.590),HRAS基因rs12628位点C→T突变危险性增加(ORT/C=1.269,95%CI=1.042-1.545),MET基因rs1621位点A→G突变、rs6566位点A→G突变危险性增加(rs1621:ORG/A=1.272,95%CI=1.000-1.618。rs6566:ORG/A=1.192,95%CI=1.023-1.388),VEGFA基因rs3025040位点T→C突变、rs25648位点C→T突变危险性增加(rs3025040:ORC/T=1.290,95%CI=1.058-1.574。rs25648:ORT/C=1.550,95%CI=1.116-2.152)。与结节性甲状腺肿相关的等位基因(P0.05)包括:HRAS基因rs12628位点C→T突变危险性增加(ORT/C=1.275,95%CI=1.064-1.640),NRAS基因rs14804位点的T→C突变危险性降低(ORC/T=0.655,95%CI=0.401-0.975),VEGFA基因rs3025040位点的T→C突变危险性增加(ORC/T=1.247,95%CI=1.026-1.583)。按性别分层分析结果表明,与女性结节性甲状腺肿患者显著相关(P0.05)的等位基因包括:VEGFA基因rs3025040位点的T→C突变危险性增加(ORC/T=1.333,95%CI=1.035-1.716)。5在甲状腺乳头状癌组与健康对照组频数分布差异存在统计学意义(P0.05)的单倍型包括:KRAS基因的rs712-rs12427141、MET基因的rs1621-rs6566、KRAS基因的rs712-rs12427141-rs7315339。结论:1 MAPK通路中MET基因和KRAS基因多态性可能与甲状腺乳头状癌相关。其中MET基因rs1621位点GA基因型、rs6566位点GG基因型和A→G突变,KRAS基因rs712位点GT基因型、rs12427141位点AA基因型和G→A突变可能是甲状腺乳头状癌的危险因素。2 MAPK通路中HRAS基因、NRAS基因和VEGFA基因多态性可能与结节性甲状腺肿相关。其中HRAS基因rs12628位点C→T突变、VEGFA基因rs3025040位点T→C突变可能是结节性甲状腺肿的危险因素。VEGFA基因rs3024997位点AG基因型、NRAS基因rs14804位点T→C突变可能是结节性甲状腺肿的保护因素。3 KRAS基因、HRAS基因、MET基因、ALK基因、VEGFA基因与女性罹患甲状腺乳头状癌相关。其中KRAS基因rs712位点GT基因型和G→T突变、rs12427141位点AA基因型和G→A突变,VEGFA基因rs3025040位点CC基因型和T→C突变、rs25648位点CT基因型和C→T突变,HRAS基因rs12628位点C→T突变,MET基因rs1621位点A→G突变、rs6566位点A→G突变可能增加女性罹患甲状腺乳头状癌的危险性。ALK基因rs1881421位点GC基因型可能降低女性罹患甲状腺乳头状癌的危险性。4 VEGFA基因与女性罹患结节性甲状腺肿相关。VEGFA基因rs3025040位点T→C突变可能增加女性罹患结节性甲状腺肿的危险性。VEGFA基因rs3024997位点AG基因型可能降低女性罹患结节性甲状腺肿的危险性。5 KRAS基因的rs712-rs12427141、rs712-rs12427141-rs7315339,MET基因的rs1621-rs6566,上述单倍型与甲状腺乳头状癌有关联。6除了VEGFA基因rs3025040位点是女性甲状腺乳头状癌和女性结节性甲状腺肿的共同易感基因位点外,在MAPK通路未发现甲状腺乳头状癌和结节性甲状腺肿共同的易感基因。7 MAPK通路基因多态性与甲状腺乳头状癌相关。
[Abstract]:......
【学位授予单位】：吉林大学
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R736.1

【参考文献】