进展期胃癌SOX新辅助化疗敏感性相关基因及信号通路的生物信息学分析
本文选题：胃肿瘤 切入点：放化疗 出处：《中国普通外科杂志》2017年04期 论文类型：期刊论文
【摘要】：目的:探讨与进展期胃癌对替吉奥胶囊联合奥沙利铂(SOX)新辅助化疗敏感性有关的基因及信号通路。方法:收集15例III期胃癌患者术后标本,其中6例SOX新辅助化疗后缓解(缓解组)、6例SOX新辅助化疗后未缓解(未缓解组),3例未行新辅助化疗(未化疗组),在用高通量基因芯片法检测各组标本基因表达谱后,以DNA损伤修复和叶酸代谢方面为重点分析对象,用系统性生物信息学技术筛选出差异基因,并通过KEGG来解释每个差异表达基因所在通路。结果:3组标本的基因表达谱存在明显差异。缓解组与未缓解组间的差异基因主要集中在细胞因子相互作用和NK细胞介导的细胞毒性作用通路上。与未缓解组比较,缓解组与DNA损伤修复相关的3个基因(HUS1、RECQL5、XRCC4)明显上调和1个基因(GADD45G)明显下调;3组间在叶酸代谢方面未找到任何差异基因。结论:影响进展期胃癌SOX新辅助化疗敏感性的基因可能与免疫信号传导有关,相关的基因检测对评估胃癌SOX新辅助化疗效果有一定的意义。
[Abstract]:Objective: To investigate the progress of gastric cancer and S-1 combined with oxaliplatin (SOX) neoadjuvant chemotherapy sensitivity related genes and signaling pathways. Methods: We collected 15 cases of stage III patients with gastric cancer specimens, including 6 cases with neoadjuvant chemotherapy after SOX remission (remission group), 6 cases of SOX without remission after chemotherapy (auxiliary help the non remission group), 3 patients without neoadjuvant chemotherapy (chemotherapy group), the expression of the gene expression in each sample by high-throughput gene chip method after the spectrum, the DNA damage repair and folate metabolism as the analysis object, using the system of bioinformatics genes were screened by KEGG, and to explain each the difference of gene expression in pathway. Results: there are obvious differences of expression spectrum of the 3 groups were remission group and no remission. Gene gene differences between groups mainly focus on the interaction of cytokine and cytotoxic NK cells mediated by pathway and no corrosion. The solution group, alleviate the injury group and DNA repair related 3 genes (HUS1, RECQL5, XRCC4) were up-regulated and 1 genes (GADD45G) significantly decreased; between the 3 groups in the aspects of folate metabolism did not find any differences in gene. Conclusion: the effect of gene sensitivity of neoadjuvant chemotherapy for advanced gastric cancer may be associated with immune SOX detection of genes related to signal transduction, has certain significance to evaluate the effect of neoadjuvant chemotherapy of gastric cancer SOX.
【作者单位】： 天津医科大学总医院普通外科;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(81501589)
【分类号】：R735.2
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，本文编号：1617584
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