白血病恶性表型与糖基化相关性探索研究
发布时间：2018-09-07 07:21
【摘要】：目的:目前在白血病分子机制的研究中,疾病相关蛋白的翻译后加工主要集中于磷酸化和乙酰化修饰,而对蛋白质翻译后加工的最主要方式——糖基化却甚少涉及。本研究旨在探索白血病恶性表型与糖基化的相关性。方法:(1)TCGA数据库收集得到183例急性白血病病例,大数据处理方法探讨研究多肽:N-乙酰氨基半乳糖基转移酶(Polypepide:N-Acetylgalactosaminyltransferases,pp-GalNAc-Ts,EC.2.1.41)家族pp-GalNAc-T1、T2及N-乙酰氨基葡萄糖基转移酶β3GnTs家族特别是β3GnT8与白血病细胞相关性。采用Affymetrix GeneChip Command Console软件(version4.0,Affymetrix)处理提取原始数据。利用Genespring软件(version 12.5;Agilent Technologies)进行RNA标准化和后续处理。差异基因利用T检验的p值和倍数变化值进行筛选,筛选的标准为上调或者下调倍数变化值=2.0且P值=0.05。对差异基因进行GO和KEGG富集分析,以判定差异基因主要影响的生物学功能或者通路。对差异基因进行非监督层次聚类,展示差异基因在不同样本间的表达模式。(2)运用实时定量PCR、Western Blot、Lectin Blot、流式细胞术等方法,检测白血病细胞K562和HL60,mRNA水平、蛋白水平糖基化相关糖基转移酶表达变化,并检测细胞表面N-聚糖、O-聚糖等糖链结构,与白血病临床分型及白血病细胞的恶性表型的关系作较深入的研究。(3)收集白血病临床病例骨髓涂片130例,通过凝集素免疫组化方法,观察在白血病急慢性的不同分型、患者不同年龄、患者性别等分组中,β3GnT8(GalT7)和β3GnT2P暬锒嗑廴樘前妨吹谋泶锊钜，
本文编号：2227590
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