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CSN5在胃癌中的表达及与患者预后的相关性

发布时间:2019-07-09 09:33
【摘要】:目的探讨CSN5在胃癌中的表达及与患者预后的关系。方法运用cBioportal分析工具,分析CSN5在胃癌中基因水平的改变情况;运用qRT-PCR方法检测CSN5 mRNA在永生化的正常胃黏膜细胞株及不同胃癌细胞株中的表达;运用Oncomine数据库(DErrico、Chen胃癌数据集)和TCGA数据库(375例胃癌组织和32例癌旁组织),分析CSN5 mRNA在胃癌组织与正常胃黏膜表达的差异性;运用生存期分析软件Kaplan-Meier plotter,分析CSN5对876例胃癌患者预后的影响;运用Chen胃癌数据集,分析胃癌患者5年生存状态与CSN5表达的关系。结果在胃癌中CSN5主要的基因改变形式为扩增;CSN5 mRNA在多种胃癌细胞株中的表达水平显著高于正常胃黏膜细胞株;CSN5 mRNA在胃癌中的表达显著高于正常胃黏膜。生存分析结果发现,CSN5高表达的患者总生存期较长,CSN5低表达的患者总生存期较短。结论 CSN5在胃癌组织中高表达,且其表达水平与胃癌患者的预后呈正相关,即CSN5高表达的患者,预后较好。
文内图片:CSN5mRNA在1种正常胃黏膜细胞株及6种胃癌细胞株中的相对表达情况
图片说明:CSN5mRNA在1种正常胃黏膜细胞株及6种胃癌细胞株中的相对表达情况
[Abstract]:Objective to investigate the expression of CSN5 in gastric cancer and its relationship with prognosis. Methods the changes of CSN5 gene level in gastric cancer were analyzed by cBioportal analysis tool, the expression of CSN5 mRNA in immortalized normal gastric mucosa cell lines and different gastric cancer cell lines was detected by qRT-PCR, and the difference of CSN5 mRNA expression between gastric cancer tissues and normal gastric mucosa was analyzed by using Oncomine database (DErrico,Chen gastric cancer dataset) and TCGA database (375 gastric cancer tissues and 32 paracancerous tissues). Survival time analysis software Kaplan-Meier plotter, was used to analyze the effect of CSN5 on the prognosis of 876 patients with gastric cancer, and Chen gastric cancer data set was used to analyze the relationship between 5-year survival status and CSN5 expression in patients with gastric cancer. Results the main gene changes of CSN5 in gastric cancer were amplification, the expression level of CSN5 mRNA in various gastric cancer cell lines was significantly higher than that in normal gastric mucosa cells, and the expression of CSN5 mRNA in gastric cancer was significantly higher than that in normal gastric mucosa. The results of survival analysis showed that the overall survival time of patients with high expression of CSN5 was longer than that of patients with low expression of CSN5. Conclusion the expression of CSN5 is highly expressed in gastric cancer, and its expression level is positively correlated with the prognosis of patients with gastric cancer, that is, the prognosis of patients with high expression of CSN5 is better.
【作者单位】: 山东大学附属济南市中心医院中心实验室;
【基金】:国家自然科学基金(81000869,31671468) 山东省自然科学基金(ZR2016HM15)
【分类号】:R735.2

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