多肽9R-P201诱导肝癌HepG2细胞的转录组分析以及长非编码RNA RP11-224O19.2的调控与功能研究
发布时间：2020-01-26 04:29
【摘要】：前期研究发现多肽9R-P201抑制肝癌HepG2细胞的存活、增殖、迁移并诱导细胞凋亡。长非编码RNAs (lncRNAs)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA,研究已证实lncRNAs通过在表观遗传、转录和转录后水平调控基因的表达从而参与肿瘤的发生发展过程。然而,多肽 9R-P201 对肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC) HepG2细胞的mRNA和lncRNA表达谱的作用以及机制尚不清楚。本研究通过对9R-P201处理的肝癌HepG2细胞进行转录组测序分析,共筛选出显著差异表达的mRNAs 1557个以及lncRNA881个。结构特征比较分析表明差异表达mRNAs和lncRNAs在基因长度、转录本长度、ORF长度、外显子个数和转录本个数等方面存在显著差异。GO功能和KEGG信号通路富集分析结果显示差异表达mRNAs和lncRNAs显著地参与了与肿瘤相关的生物学进程与信号通路。基于转录因子(transcription factor,TF)结合位点分析和蛋白间相互作用分析,我们通过中间中心度筛选得到相互作用关系富集度高的转录因子33个、lncRNA 273个以及靶基因94个,并构建了 TFs-lncRNAs-靶基因的调控网络图。此外,我们发现差异表达mRNAs间存在相互作用关系634条,并构建了差异表达mRNAs间的相互作用网络图。差异表达mRNAs和lncRNAs的qRT-PCR验证结果表明mRNAs和lncRNAs表达变化情况与测序结果趋势一致。我们选择感兴趣并在肝细胞癌中未曾研究过的差异表达lncRNA RP11-224019.2进行后续的功能研究。经过分析发现RP11-224019.2在肝癌组织中上调并与肿瘤大小相关。通过转染siRNA下调RP11-224019.2的表达显著地抑制HepG2细胞的增殖、克隆形成、迁移和侵袭并诱导凋亡。最后通过RP11-224019.2共表达网络和靶基因预测分析,我们发现TGFB2的表达量与 RP11-224019.2 成相关,并且TGFB2与RP11-224019.2属于antisense 关系。此外,TGFB2的表达量在RP11-224019.2被干扰后下调了88%,这些结果表明TGFB2可能是RP11-224019.2的潜在靶基因。
【图文】：
染特别是乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）或丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）感染是导致肝癌发生的最关键逡逑病因；此外肝硬化、长期酗酒、食物污染、肥胖、糖尿病、代谢紊乱等也是重要的致病逡逑原因［６］（图１－１）。除此之外，，一些信号通路、原癌或抑癌基因以及ｍｉＲＮＡ和ＩｎｃＲＮＡ逡逑等的异常也是导致肝癌发生发展的重要原因［７］。逡逑Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ邋Ｂ邋＆邋Ｃ邋Ａｌｃｏｈｏｌ逡逑ＡＨａｔｏｘｉｎ－ｉｎｔａｋｅ逡逑ｉ逦．逦？Ｈｅｐａｔｏｃｅｌ邋丨邋ｕｌａｒ－邋—邋．邋Ｔ＞ｐｃ邋ＩＩ邋ｄｉａｂｅｔｅｓ，逡逑Ｃｉｒｒｈｏｓｉｓ逦Ｃａｒｃｉｎｏｍａ逦Ｍｅｔａｂｏｌｉｃ邋Ｄｉｓｏｒｄｅｒ，逡逑Ｌｉｖｅｒ逦Ｌｉｖｅｒ邋Ｆｉｂｒｏｓｉｓ逦Ｏｂｅｓｉｔｙ，ＮＡＳＨ／ＮＡＦＬＤ逡逑图１－１肝细胞癌发生的原因ｍ逡逑由Ｘ开放阅读框编码的ＨＢｘ蛋白通过激活ＭＡＰＫ和ＪＡＫ／ＳＴＡＴ信号通路来促进由逡逑ＨＢＶ感染导致的肝癌的发展⑷。斑蝥素作用于肝癌细胞后能增加细胞内Ｐ５３、ｃｙｃｌｉｎＡｌ逡逑和ｃｙｄｉｎＢｌ等基因的表达，进而诱导细胞周期阻滞和细胞凋亡并使肿瘤的生长停滞［９］。逡逑
IneRNA的起源m
【学位授予单位】：西南交通大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：R735.7
本文编号：2573209
【图文】：
染特别是乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）或丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）感染是导致肝癌发生的最关键逡逑病因；此外肝硬化、长期酗酒、食物污染、肥胖、糖尿病、代谢紊乱等也是重要的致病逡逑原因［６］（图１－１）。除此之外，，一些信号通路、原癌或抑癌基因以及ｍｉＲＮＡ和ＩｎｃＲＮＡ逡逑等的异常也是导致肝癌发生发展的重要原因［７］。逡逑Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ邋Ｂ邋＆邋Ｃ邋Ａｌｃｏｈｏｌ逡逑ＡＨａｔｏｘｉｎ－ｉｎｔａｋｅ逡逑ｉ逦．逦？Ｈｅｐａｔｏｃｅｌ邋丨邋ｕｌａｒ－邋—邋．邋Ｔ＞ｐｃ邋ＩＩ邋ｄｉａｂｅｔｅｓ，逡逑Ｃｉｒｒｈｏｓｉｓ逦Ｃａｒｃｉｎｏｍａ逦Ｍｅｔａｂｏｌｉｃ邋Ｄｉｓｏｒｄｅｒ，逡逑Ｌｉｖｅｒ逦Ｌｉｖｅｒ邋Ｆｉｂｒｏｓｉｓ逦Ｏｂｅｓｉｔｙ，ＮＡＳＨ／ＮＡＦＬＤ逡逑图１－１肝细胞癌发生的原因ｍ逡逑由Ｘ开放阅读框编码的ＨＢｘ蛋白通过激活ＭＡＰＫ和ＪＡＫ／ＳＴＡＴ信号通路来促进由逡逑ＨＢＶ感染导致的肝癌的发展⑷。斑蝥素作用于肝癌细胞后能增加细胞内Ｐ５３、ｃｙｃｌｉｎＡｌ逡逑和ｃｙｄｉｎＢｌ等基因的表达，进而诱导细胞周期阻滞和细胞凋亡并使肿瘤的生长停滞［９］。逡逑
IneRNA的起源m
【学位授予单位】：西南交通大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：R735.7
【参考文献】
相关期刊论文 前3条
1 Danijel Galun;Dragan Basaric;Marinko Zuvela;Predrag Bulajic;Aleksandar Bogdanovic;Nemanja Bidzic;Miroslav Milicevic;;Hepatocellular carcinoma: From clinical practice to evidence-based treatment protocols[J];World Journal of Hepatology;2015年20期
2 Gan-Lu Deng;Shan Zeng;Hong Shen;;Chemotherapy and target therapy for hepatocellular carcinoma:New advances and challenges[J];World Journal of Hepatology;2015年05期
3 Bulent Karaman;Bilal Battal;Sebahattin Sari;Samet Verim;;Hepatocellular carcinoma review:Current treatment,and evidence-based medicine[J];World Journal of Gastroenterology;2014年47期
本文编号：2573209
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/zlx/2573209.html
