microRNA-106在胃癌中的诊断作用及其功能的生物信息学分析

发布时间：2020-07-22 10:06

【摘要】：目的:近年来,越来越多的证据表明,microRNA-106(miR-106)可能是胃癌诊断中的一种无创、经济的生物标志物。然而,研究间的不一致结果阻碍了其在临床实践中的应用。因此,我们进行了全面的meta分析,评价了用于胃癌诊断的miR-106和miR-106相关组合标志物的诊断效能。同时,我们也对miR-106在系统生物学水平上的功能进行了全面的生物信息学分析。方法:基于 PubMed、EMbase、Web of Science 和 Cochrane Library 等数据库,检索公开发表的评价miR-106与胃癌诊断相关的文献。由2名研究者按纳入和排除标准独立选择文献、提取资料和评价质量。应用STATA(14.0版本)和Meta-DiSc(1.4版本)统计软件进行分析。此外,我们通过对miR-106的靶基因进行基因本体论和KEGG通路分析,构建miR-106靶基因的蛋白相互作用网络,鉴定网络节点基因和重要模块等生物信息学方法探讨miR-106系统生物学层面上的功能,探究它们与胃癌发生发展的关系。结果:我们的研究最终纳入了 10篇已发表的文章,包括12个单独针对miR-106的研究和5个针对miR-106相关组合标志物的研究。研究结果表明单独miR-106对胃癌诊断的敏感性为0.71(95%CI:0.65-0.76),特异性为0.82(0.72-0.88),AUC(曲线下面积)值为0.80(0.76-0.83)。特别的是miR-106相关组合标志物提高了联合诊断效能,其敏感性、特异性和 AUC 分别为 0.78(0.65-0.87)、0.83(0.77-0.89)和 0.88(0.85-0.90)。亚组分析表明,样本类型和样本大小可能影响诊断的准确性。此外,我们搜集了miR-106的靶基因,通过基因本体论和KEGG通路分析揭示了它们与胃癌发生发展的关系。从miR-106靶基因构建的蛋白相互作用网络中鉴定出了关键的节点基因和重要的网络模块,发现它们也与胃癌的发生和发展密切相关。结论:miR-106可能作为诊断胃癌的生物标志物,并且miR-106相关组合生物标志物可能为临床应用提供新的选择。
【学位授予单位】：苏州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R735.2
【图文】：

流程图,文献检索,流程图,标志物

关于ｍｉＲ－１０６相关组合标志物的诊断价值，共纳入了邋４篇文献的５项研究，包括逡逑３２２名患者和２６３名对照。样本来源均为血清（ｎ＝５）。所有研究均采用定量实时聚合酶逡逑链反应（ｑＲＴ－ＰＣＲ）检测ｍｉＲ－１０６及相关联合标志物的表达水平。详细情况见表１和表逡逑２。纳入研究的质量评估表明，总体而言，这些研宄的质量从中等质量到高质量，这逡逑将提高我们分析的可靠性。逡逑

森林图,胃癌,特异性,敏感性

３邋Ｍｅｔａ分析结果逡逑ｍｉｃｒｏＲ－１０６在胃癌中的诊断价值逡逑如森林图所示（图２Ａ和２Ｂ），我们观察到个体研究之间存在显著的异质性，敏感逡逑性方面邋Ｑ邋值为邋３１．４６邋（Ｐ＜邋０．００１邋），邋Ｉ２邋值为邋６５．０４邋％邋（９５邋％邋Ｃ１，４３．５４－８６．５３邋），特异性邋Ｑ逡逑值为邋９４．７０邋（Ｐ＜０．００１），Ｉ２邋值为邋８８．３８邋％邋（９５邋％邋ＣＩ，邋８３．０４－９３．７２邋）。因此，本研究使用逡逑随机效应模型来评估合并结果。总体而言

曲线图,曲线图,胃癌,比值比

０．３６表明，如果ｍｉＲ－１０６为阴性，则胃癌患者的预期比例为３６邋％。诊断比值比表明，逡逑被诊断为胃癌阳性且ｍｉＲ－１０６高表达的人实际患胃癌的可能性是胃癌实际阴性的人逡逑的１０．８４倍。最后，我们绘制了邋ＳＲＯＣ曲线（图３Ａ），并计算了相应的ＡＵＣ值，为０．８０逡逑（０．７６－邋０．８３邋），表明本研究的总体诊断准确性为中等。逡逑Ａ逦Ｂ逡逑ＳｔｏｄｙＭ逦ＳＥＷＳｍＶＩＴＹ邋｛９５％邋ａ）逦Ｓｉｕｄｙｉｄ逦ＳＦＥＣｌＰＪＣｒＴＹ邋｛３５％邋Ｃｌ）逡逑Ｙｕａｎ？ａｌ／２０１７逦－ｎ－逦０邋７７邋｛０邋￡６邋－邋０．９１］逦Ｙｕａｎ邋ｅｔ邋却２０１７逦－？－；逦０．Ｗ邋［０．４８邋－邋０邋７８］逡逑Ｙｕａｎ邋ｅｔ邋ａｌ／２０１７逦Ｃ邋Ｓ２｛0４４－0邋７８］逦ＹｕａｎＫａｌ＾０１７逦０邋６４邋［０逦－邋０邋８３］逡逑Ｌｉ邋ｅｔ邋ａｌ；＊２Ｃ１７逦；■？：邋０．８Ｓ邋｛０．７５邋－邋０邋９３ｊ逦ＬｉＫａ＾ＤＩ？逦０邋９２邋［０邋８３邋－邋０．９７］逡逑Ｗａｎｇ邋？ｔ邋ａｌ＾ＣＩＴ逦０邋６３邋［０．￡４邋－邋０邋７１ｊ逦Ｗａｎｇ邋ｅ：邋ａｉ＾０１？逦？逦０８９邋［０邋８０邋－邋０．９４］逡逑Ｈｏｕ邋？ｔ邋ａｆ／２Ｃ１５逦ｆ邋０．７７邋［０．６Ｓ邋？邋０－８＃?逦Ｈｏｕ邋ｅｔ邋ａｌ／２０１６逦ｊ－ｓｅ邋０．９４邋［０．８５邋－邋０．９８］逡逑Ｚｅｎｇ邋ｅｔ邋ａｌ

【参考文献】